李、包等下汽車入署，由參謀官李嗚珊招待三人在參謀處上房套間內，言少坐，再請到督辦客廳。李等既入內，所帶手槍衛兵二十餘人亦隨進，被督署官兵攔住，立時關閉督署大門、二門，由梁冠英團官兵蜂擁包圍，喝令交械，李、包衛兵發槍抗拒，當被署內士卒開槍擊倒數人，餘人乃不敢動，解下武器，與請來的各軍官囚禁一室。李、包、魏三人坐參謀處房內，未一刻許，團長梁冠英率十數兵擎槍擁入撲三人前，槍口指胸，喝令勿動。梁先抱住李長清，數兵持繩，將三人一並縛綁。由參謀處北出方圃，押赴後花園，至園門內，蔣鴻遇自土堆下，呼令開放魏鴻發一人。魏向蔣問究係何事？
蔣言他二人屢抗命令，近來竟公然步哨放至廣武門外，與政府為敵，這還了得。喝令士兵將李、包押走，令魏隨至大廳聽訓。李、包既擒，劉鬱芬乃至督署大廳集合李師全部軍官訓活，大意謂“軍人以服從為天職，李、包膽敢反抗，公然與政府為敵，實為國法所不容，今天我已將軍隊分布好了，有誰敢再違抗，即當與他一拚。今問你們還是違抗政府呢？還是聽從命令？應即明確回答”。眾等齊聲答稱，都願聽從政府命令。劉言如此就好，大家各回各營，約束所部聽命，切勿妄動。你們需要知道，政府軍隊現已在東校場及拱星墩等處布置包圍。有誰要亂動。即將立遭滅亡。眾皆唯唯退出，劉留郭安學、魏鴻發二人講話，麵令郭往拱星墩各營宣慰，對魏鴻發言，你係原日師參謀長，與李部素有感情，今特派你往東校場及東稍門各營安撫，曉以大義，靜候聽命，並令兩人即日回報情況。是時，李師團、營官長均各出署回歸。有營長華連升、羅滿章二人在後，又被督署指名呼入扣押。因兩人與李、包為臨夏同鄉，華原屬包旅營長，在場解除武裝時，態度強硬。嗣與李、包一同被殺（華以前曾在陝西某部任連長職，非陸舊部，係後由李、包保薦引用）。羅滿章屬郭安學旅。在押兩旬餘由郭安學保釋。又營長楊占魁，皋蘭人，家住督署東山字石巷，是晨獨藉便由家走督署箭道後門入內，甫至門內操場，前麵槍聲連發，急返回走出。崗兵阻止不聽，被發槍擊死於箭道中。事後經劉鬱芬查明，給五百元撫恤其家屬（一說係陸洪濤自漢中函劉保薦用楊）。是日變起臨時，事先本極秘密，全城各界均無所覺。晨十時許，突聞督署槍聲連作，人見署門內闔，驚駭走傳，不解其故，各大街商號，紛紛閉門。至十一時許，眾見數兵由皋蘭縣署手攜鐐銬數具，走往督署，署前頭，二門俱啟，秩序如常。護理省長之楊思時亦在署內，事作時，其辦公之處，亦被軍隊監視，禁止人員出入，情勢極為嚴重。上午十二時後，督署在各城門張貼告示，宣布李等罪狀。大致謂：奉馮令，據陸前督電告，旅長李長清跋扈背命，作變省垣，攻奪黃（得貴）旅兵械，脅迫長官離職各情。應將李長清與同惡之團長包玉祥一並捕拿，解交軍法審判。茲已遵照辦理等語，眾始知其事。維時駐拱星墩三個營，為郭安學旅所部，無何問題。在東校場等處所駐各營，皆陸氏舊部，為李、包所屬，故令魏鴻發前往撫慰，魏乘騾車帶衛士二人往東校場，行之廣武門外後西街，被李部哨兵阻止前進。魏告以我來係安慰你們，你們與我感情素洽，對我豈不相信？哨兵乃放其通過。魏先至李之師部，恐招集全部講話，或有少數人鼓噪，牽動全局，乃分赴各營駐地，分別集合勸慰，大意謂：“我們部是甘肅人，向來愛護鄉邦，今日之事，因李師長不聽命令，致生誤會。現師長及包旅長被扣，你們如或妄動，對他二人是罪上加罪。要想營救他們，惟有遵守紀律，況蘭州十餘萬民眾，若有騷動，何以對得住地方父老？現在還是靜安待命，也就是保全師長、旅長的上策，尚再胡行，反與他二人不利”。官兵等多為感動，均願聽命。是日魏遍曆李部各營，詳為勸告，至下午八時後，乃回督署複命。新關一帶商號民家，半天門皆緊閉，盡都驚惶，甚至有通宵不敢安眠者。入夜寂然，人心乃安。
劉鬱芬、蔣鴻遇據報後，即決定取銷原第一師番號，改編為兩個混成旅，委任魏鴻發為第一混成旅旅長，郭安學為第二混成旅旅長，營數未減於前，團、營以下原有軍官，亦悉各仍原職。並擢宋有才為第四混成旅旅長，韓有祿為第三混成旅旅長（韓有祿原為李長清旅第二團團長，全團三個營），在陸洪濤時由永登防地，移駐中衛縣之寧安堡（今寧夏回族自治區中寧縣）。李任師長後，以韓為第二旅旅長，仍駐該地，又任黃得貴為遊擊司令，以一營駐煤山（今阿幹鎮），撥給二千元補充軍餉。黃受職來省謁謝，優慰勸勉（劉部到省後，黃曾以書麵控訴李長清）。由是陸部舊人，皆漸滿意。李長清部下最有力的包玉祥、華連升已同被擒，餘人勢孤，無敢舉動。