這份供詞，雖然依然未招供出主使、幫凶等，但起碼比之前的供詞多了點實質性的動機。同一天，陳德又供稱，他原想用小刀搶奪官員們的腰刀，然後“砍退幾個人，直奔轎前，驚了聖駕，皇上自然諸事由我，可得好處”。當天，又傳訊了陳德的舊主人，均稱對陳德行刺之事並不知情。但行刺皇帝這樣的大事，隻是由陳德一個人所為，又有些說不過去。二十三日，嘉慶皇帝再度發布命令：“此案再著添派九卿、科道會同審辦。”
二十三至二十四日，曾經審訊過陳德的所有大臣，來了個大團聚，他們動用集體的智慧來審查這個膽敢謀殺皇帝的窮人，“掌嘴二十，板責三十，並加刑夾，收至四分”。但陳德依然“堅供實無同謀、主使之人”。案子審到這份上，大臣們也束手無策了。動大刑都不招，難道真無同黨、主使？可他一個落魄的廚子，怎能一個人做出這等大事？
正在左右為難間，二十四日，嘉慶下令停止審訊，原因是不忍心讓凶犯妄加攀扯，以連累無辜之人，所以就不再深究。“在諸臣見此等逆犯，義憤自不容已，必欲窮究主使何人、同謀何人、有無黨羽，反複究詰，悉心訊問，忠君為國之忱，必應如是”。但是，“舉朝臣工，皆同朕之兄弟子侄，至親骨肉。朕又何忍令凶犯扳扯，況實無疑忌之人乎。總之，天下之大，何所不有，譬如猘犬噬人，原無主使，鴟梟食母，豈有同謀。若一味刑求，反肆狂吠，所言之人，如何存活。即不究問，終是疑團，所損者大也”。
就這樣對此案做了叛決，如下：主犯陳德被淩遲處死，陳德的兩個幼子被處以絞刑；其嶽母年已80，免議；陳德的朋友黃五福被杖一百、徒三年；神武門東西兩邊的護軍章京賢福、瑞慶，護軍統領阿合保、常青和護軍校、護軍等60多人以失察之罪分別被發配熱河披甲當差、革職、降級、罰俸、枷示等處分；當班的肅親王永錫、副督禦史萬寧、副督統薩敏等交由宗人府及各相關部議處。
據《清朝野史大觀》等書記載，陳德就刑時非常從容，一副大義凜然的樣子，是認罪伏誅，還是從刺殺那刻起就早已預料到了結局，所以麵不改色？在菜市口刑場，陳德被綁在木樁上，兩個兒子被押來給他叩頭，隻見他閉起眼睛不聞不見。行刑開始，“割陳德耳鼻及乳，從左臂魚鱗碎割，次及右臂，以至胸背。初尚見血，繼則血盡，但流黃水而已”。割完上體，陳德應該是因為太過痛苦，忽然睜開雙眼大叫:“快些！”但這樣的催促顯然不會得到劊子手的同情，監刑的劊子手卻說:“上有旨，令爾多受些罪！”陳德閉上眼睛再也不曾開口。
至此，這個案子算是結了。前後隻有四天的時間，刺殺皇帝這樣的大罪隻審了四天好像態度略顯不慎重，可是當事人——皇帝，親自阻止了審案，旁人也說不得什麼。一個轟動朝野的大案能夠就落下了帷幕。但陳德行刺的真正原因，卻一直眾說紛紜、爭論不休。
如果陳德所供供詞屬實，從理論上說，人在絕望之下的確什麼都能做得出來。可在當時的背景之下，這個理由未免有些離奇。“行刺皇帝”這個罪，不是一個人能承擔得起的。一旦失敗，會有很多無辜的親人被牽連。就算成功了，他也不可能像夢中那樣翻身改變命運。難道他真的天真到不知道後果的地步？
另據野史記載，此案可能跟嘉慶處死和珅有關。話說，“和珅一倒，嘉慶吃飽”，可同時，也給自己“招”了一批敵人。相傳自那以後，嘉慶曾多次險些被暗算。一次，近侍奉茶，嘉慶還沒來得及喝就有事離去了，一個侍從將茶撤下喝了，結果立刻斃命。因此，陳德行刺案一出，就有人猜測是和珅的黨羽所指使。可如果這種猜測成立，受命執行此項任務的陳德就未免太忠心了。什麼好處也沒撈到，還搭上了兩個兒子的命，朋友也受到牽連，值得嗎？
而從案件發生到結束，作為當事人的嘉慶的態度也很耐人尋味。從一開始時的“窮究主使何人、同謀何人、有無黨羽”，到最後的“不欲窮究”，變化似乎太快了點吧？如果當真如此，他就沒必要連日過問審訊情況，並不斷增派大員會審了。而萬一陳德背後真有主使之人呢？放過了豈不是還會有危險。他是在忌諱什麼吧？