海盜在後勤保障方麵也往往依賴沿海的一些漁業社區。這些漁業社區的居民向即將出海的海盜團體出售食物和淡水等，在海盜團夥在海上作業期間遇有物資短缺時，還在海上實施物資保障。
海盜的後勤保障涉及許多方麵，在索馬裏海盜的主要陸上基地艾伊爾，甚至有一些專為被劫船員提供食物的餐館。在海盜活動的後勤保障中，最重要的當屬武器的供給。連年內戰外加猖獗的武器走私活動，使得索馬裏海盜團夥可以輕而易舉地在索馬裏的一些軍火市場上購得所需武器。根據聯合國安理會一個專家組的調查，在索馬裏臭名昭著的巴卡拉哈軍火市場上，可以隨時購得多種武器。不僅貨源充足，價格也在海盜們的承受範圍之內。例如，ZU-23高射機槍的單價是70000~10000美元，PKM機槍的單價是12000~6000美元，DShK重機槍的單價是8000~3000美元，RPG-2反坦克火箭彈發射筒的單價是2000~1500美元，AK-47衝鋒槍的單價是400~200美元。2007年6月27日索馬裏問題監測組給安理會的報告。
從上述可見，海盜團夥的組織、運作模式實際上很像一個“產業鏈”。參與者眾多，分工明確，且高度專業化。
海盜活動收益巨大。2008年，海盜全年獲得的贖金總收入甚至超過了邦特蘭政府的總預算。海盜活動的收益部分回流到當地政治生活之中，不僅造成政府的腐敗，而且可能形成海盜活動的保護傘，從而進一步加劇海盜活動。聯合國安理會的一個專家組曾指控邦特蘭政府官員從索馬裏海盜活動中受益。政府官員獲得了贖金總額的30%，涉案人員包括多名部長。而聯合國的另一份報告稱，在邦特蘭，海盜黑錢對社會的滲透無孔不入，對政府的腐蝕涉及政府各級官員，包括邦特蘭政府的若幹部長。在海盜活動猖獗的艾伊爾市，市長奧尤素甫(Aw-Yusuf)於2008年10月14日在接受當地一個廣播電台的采訪時，根據他掌握關於海盜活動的大量第一手資料，表示當地海盜活動激增，邦特蘭行政當局的若幹部長和高級警官是同謀。邦特蘭總統穆薩(Musa)則告訴聯合國安理會專家組，他已經撤銷了幾名與海盜活動有牽連的官員的職務，其中包括警察副總長阿登(Aden)。
在海盜與政府官員的勾結方麵，聯合國安理會一個專家組曾報告過一個突出實例，即海盜哈那阿諾(Hanaano)與政界人士依爾卡吉爾(Ilkajiir)的關係。2008年6月23日，哈那阿諾率領的海盜團夥在亞丁灣劫持了德國遊艇羅卡爾(Rockall)號。遊艇主人是一對德國退休夫婦。他們被帶到索馬裏岸上，並押往山區，在那裏扣押了52天，在支付贖金後才被釋放，據說贖金高達100萬美元。哈那阿諾用海盜活動獲得的收益在家鄉建立了一支約有50~60人的私人武裝，配備了火箭筒、機槍、衝鋒槍和半自動步槍。他的兒子巴卡爾約(Baqalyo)是這支私人武裝的主要成員。在羅卡爾號遊艇劫持事件之後，哈那阿諾及其私人武裝又於2008年11月12日劫持了一艘土耳其化學品運輸船，於2009年4月10日劫持了兩艘埃及漁船，於2009年4月11日劫持了一艘意大利拖船。哈那阿諾與邦特蘭內務部長依爾卡吉爾將軍關係密切。依爾卡吉爾曾經是一名軍官，與哈那阿諾同屬一個部族。依爾卡吉爾於2008年末從美國返回邦特蘭，競選邦特蘭總統。有消息說哈那阿諾為依爾卡吉爾的競選捐贈了20多萬美元。依爾卡吉爾競選失敗，但在邦特蘭政府中謀得了內務部長一職。對哈那阿諾在競選中的慷慨支持，依爾卡吉爾投桃報李。就任內務部長後不久，就提議由哈那阿諾擔任“薩納格東部海岸警衛隊司令”。2009年8月，兩艘遭劫持的埃及漁船的船員奮起反抗，製服了海盜，並隨後將其移送埃及政府處理。2009年9月，埃及政府將這些海盜遣返邦特蘭。依爾卡吉爾促使哈那阿諾屬下的這些海盜獲得釋放。2009年11月30日，邦特蘭安全部隊逮捕了哈那阿諾的兒子巴卡爾約，但指控的罪名與海盜行為無關。有報道稱，根據依爾卡吉爾的命令，巴卡爾約已於2009年12月5日獲釋。