在很多情況下，海盜在追逐目標時，還會升起一種白色的海盜旗，來表明身份——有時獵物會因此降下本國的旗幟表示屈服；如果獵物拒絕投降，海盜則升起黑白兩色旗幟，加強威脅；而若獵物繼續逃竄，或是海盜船長過於殘暴的話，就會有一麵紅色旗幟在桅頂升起，意思是一旦捕獲獵物，不留任何活口。當然，海盜旗上的圖形是海盜首領們為了表達其特定含義而被設計出來的：頭骨象征的是死亡；帶有號角的骷髏，是指受盡折磨而死；飛標或矛的圖案暗示慘遭橫死；滴血的心髒比喻的是痛苦地慢慢結束生命；舉著匕首或水手刀的手臂預示嗜殺的習性。
有些海盜船長的旗幟非常有個人特色：如海盜“黑胡子”蒂奇喜愛把上述那些主要的標誌一個不漏地都放到他的旗幟上；綽號“棉布”的傑克·拉克漢用雅致的交叉長劍圖形代替了傳統的交叉人骨；船長托馬斯·提歐也模仿地使用了劍的圖案在他的旗幟上，但沒有加上象征死亡的圖案——提歐爵士大概認為，用不帶有死亡含義的物件來描述他的暴力行動，會顯得禮貌些吧——但對這些過著刀口舔血日子的海盜來說，刺激他們的原動力隻有財富，他人的生命可不是海盜們考慮的重點。
還有一種旗子，上麵畫的是一具骷髏，它的一隻手裏握著沙漏，另一隻手裏握著一顆還在滴血的被鏢矛擊穿的心。有記錄表明，一些海盜使用畫著黑色骷髏頭和骨架的白色旗子，圖案下麵還有一行題詞：“為了上帝和自由”。
海盜們還經常會升起兩麵旗子——先升“快樂的羅傑”，然後升紅旗。第一麵旗子似乎是邀請對方自願投降。要是這一邀請被拒絕，那麼海盜船的桅杆上就會飄揚起一麵腥紅的旗子，它證明敵人將得不到寬恕，隻能付出血的代價。
無論海盜們在自己的船上升什麼旗子，它們始終都是同一種死亡之旗。
私掠許可證
私掠許可證是指在戰爭期間授權私人駕駛武裝民船來攻擊、俘獲和搶劫敵國商船的正式公文。18世紀初，歐洲各國政府使用這些許可證作為國家工具來加強海軍力量。使本國在不增加預算的情況下，憑空多出一支能攻擊敵國商船的海上力量。私掠者在國家的法律之下執行命令，合法搶劫那些被本國定義為敵對國家的船隻。對於本國來說，這些駕駛武裝民船的私掠者就是英雄；而落在敵對國家手裏，往往會被判決為海盜直接絞死。私掠許可證的使用在1856年終止。
海盜的法典
觀點：很多海盜團夥在組織上有著嚴格的規章製度，而不是人們想象的那種隻靠體力掠奪財物的烏合之眾。這些規章製度通常都是寫成條文，並由全體船員簽名共同遵守。
好萊塢電影裏的海盜經常被塑造成浪漫神秘的英雄形象，而他們的生活其實是殘酷和艱苦的，但又充滿激情和自由。當時的許多年青人就是因為想追求那種充滿刺激和自由的生活而成為海盜的。
在眾多的海盜中自然也不乏劫富濟貧的義盜，他們的事跡在後世的民間傳說中成了自由和勇氣的象征，為這個海上冒險職業增添了一份傳奇的光環。
海盜作為一個自然的社會群體，當然也有屬於他們獨有的規章製度，這樣才能保證海盜活動的正常進行和長期存在。在電影《加勒比海盜3》中出現的海盜法典，在現實曆史中也確有其事。隻是每個海盜團夥遵行的法典都有所區別，大體分船員等級和主要條例兩個方麵內容。
其一，是對船上人員的等級限定：
海盜船長——被船員共同選出，膽識和指揮能力樣樣出色的船長，在追逐海上獵物或是采取其他行動時，船長有著最高的決定權。
同時他也有權處置不聽命令的手下，以及決定俘虜生死的權力。
領航員——領航員在船上主要分管航海路線，他們的崗位在桅杆上。因為當時的海圖很不詳盡，領航員的工作也就非常重要。在那個時候，有不少領航員是被迫加入海盜的，但他們也會受到所有船員的尊重，因為航線、危險和獵物都是由他們來確定及發現的。
軍需官——軍需官在海盜船上的權力僅次於船長，平時負責管理船員，還有處罰沒有服從命令者，以及裁斷船員間糾紛的權力。多數時候，軍需官是一場戰鬥的先鋒官，總是最先登上敵艦。當然在平時，食物和飲水等儲備物資也是交由軍需官來管理的。