內部控製的方式很多，在不同的業務處理過程中，應當采用不同的控製方式，才能最大限度地發揮內部控製製度的作用。一般來講，內部控製的基本方式有以下幾種。
一、授權控製
授權控製是指單位內部的各級工作人員必須獲得批準和授權後，方能執行或處理有關的經濟業務。其基本要求是:單位內部的各級管理層必須在授權範圍內行使相應職權，各級工作人員在處理業務時，必須首先明確自己的職權和責任，在授權範圍內開展工作，既不能超越權限去處理那些不屬於自己職權範圍內的事情，如非出納員收付貨幣資金、非會計員處理賬務等，也不能推諉責任，對那些屬於自己職權範圍內的事情不認真辦理，如保管員不認真負責物資收發，會計員不按規定登記賬簿等。
按授權的性質，授權控製可分為:“一般授權”和“特定授權”。一般授權通常規定處理正常經濟業務的標準，授予有關人員處理一般經濟業務的權利，如推銷員按規定價格銷售產品或商品、采購員可在計劃指標內購買材料等。特定授權是指授予有關人員處理特殊經濟業務的權利。例如，企業銷售閑置設備、削價處理積壓的存貨，必須經行政領導特別批準授權後才能處理，銷售人員不得自行決定。否則，就屬於越權行為，銷售價格就會失去控製，就有可能產生漏洞。
授權控製有利於建立崗位責任製，便於有關人員各司其職，各負其責，有效防止問題的出現，即使發生問題也便於查找解決。
二、分權控製
又稱職務分管控製，它要求任何一項經濟業務的辦理，都必須由兩人或兩人以上分工掌管，不允許任何一個人單獨辦理任何一項經濟業務，以便形成相互製約、相互監督的格局，避免一個人包辦經濟業務全過程而容易出現的弊端和錯誤。一般情況下，以下職務和權力應當實行分管:
(1)經濟業務的授權批準職務與執行職務應予以分離，即將審批權與執行權分離。
(2)經濟業務的執行職務與記錄職務應予分離，即將業務的執行權與記錄權分離。
(3)財產物資的保管職務與會計記錄職務應予分離。
(4)經濟業務的經辦職務與稽核職務應予分離。
(5)貨幣資金出納職務與總賬記錄職務應予分離。
此外，經濟業務的授權批準職務與監督檢查等職務也應分離，以確保內部控製的嚴密性……
三、憑證控製
憑證控製是指經濟業務發生時，通過填製和傳遞原始憑證，對經濟業務實施記錄控製，以便在任何時候、任何問題發生時都有據可查。為此，設計足夠的憑證聯次和合理的憑證傳遞程序，將業務發生所涉及到的各職能部門或個人聯係起來，是強化內部控製的有效方式。
其主要內容是:
(1)每發生一筆經濟業務，都必須填製或取得合法的、真實的、正確的原始憑證，作為各項業務的證明材料和控製依據。
(2)根據需要用複寫方式填製憑證，即一式幾聯。
(3)重要的憑證如收款收據、銷貨發票等應當事先編號，以防短缺，一般憑證可在使用時按順序統一編號。
(4)憑證上必須具備業務經辦人員的簽名或蓋章，以明確其應負責任，強化製約關係……
(5)建立複查和核對製度，包括對憑證本身的複查和與
其他有關憑證的核對。如購貨發票，既要審查其是否符合原始憑證填製要求，又要與訂貨合同、收料單等進行核對。
(6)建立科學合理的憑證傳遞程序，與業務的標準處理程序結合起來，使各種憑證在業務經辦部門和人員之間合理的流轉。既要經過每一個必要的環節，防止遺漏，發生失控現象，分不清責任，又要盡可能地減少傳遞環節，提高工作效率。
(7)建立嚴格的印製、購買、保管、使用、注銷和存檔等管理製度。
四、賬簿控製
這一控製方式是通過利用會計賬簿對經濟業務進行序時、分類記載的功能，實施內部控製。其主要內容是:
(1)建立完整的賬簿組織體係，明確規定各種賬簿的作用以及它們之間的關係。做到……總賬控製明細賬、日記賬;明細賬控製財產實物和債權債務的數量、金額變化;日記賬控製收付款的筆數和金額。