1958年裏，還有少量的右派分子被正式逮捕、判刑，實施勞動改造。
一天深夜，因所謂“要殺共產黨人”的“叫囂”而驚世駭俗了的葛佩琦，突然被警察從位於人民大學的家中帶走，收押進北京西安門附近的草嵐子看守所，春節後開始對他進行了第一回合的審訊，這一白天黑夜連軸轉的審訊，共進行了36次。
“1938年你在河南商丘組織了遊擊隊，你想幹什麼？”
“當然是打日本鬼子。”
“胡扯！當今人民坐穩了江山，你還磨刀謔謔，要殺共產黨人，那時你怎麼可能將槍口對著日本人？”
“我長期從事黨的地下工作，抗戰時搞策反，解放戰爭時奉命打入國民黨東北保安司令部……”
“混蛋，你是雙手沾滿革命人民鮮血的國民黨少將，不準你再用自己的罪惡玷汙我們偉大的黨！我警告你，這裏是清算罪惡的審訊室，不是可以信口雌黃的江湖碼頭，你若再不老實，就得罪上加罪！”
命運這家夥，倘若正兒八經起來，你便能種瓜得瓜，種豆得豆；倘若不那麼正經，有時還要黑色幽默一下，本該大紅大紫的你，卻可能灰頭垢麵，如魚銅轍——
1935年“一二·九”運動爆發時，葛佩琦已經是走在遊行示威隊伍前振臂高呼的風雲人物，次年中華民族解放先鋒隊在古城誕生，他率先加入該組織，又當選為北京大學學生會副主席時，他更成了與黃華、姚依林齊名，北平高校裏幾乎無人不知的學生運動領袖。北平淪陷後，他有過一段在豫東打遊擊的經曆，並在槍林彈雨裏加入了中國共產黨。
此後，他便投入了黨的秘密工作戰線，抗戰時期孤身策動偽軍一個團、參與策動偽軍三個師反正，編人我抗日部隊序列。解放戰爭時，他前往沈陽，在國民黨東北保安司令部擔任了少將督察和通訊處長。
盡管東北保安總司令杜聿明對共產黨人的仇視，像他對蔣介石的忠貞一樣是無可懷疑的，在通遼一地他曾一次下令槍殺中共黨員29人；盡管他手下的反諜報人員在智商上，與他們使用的從美國進口的全套特務器材一樣，也均是優良的，可當年葛佩琦還是一次次金蟬脫殼、化險為夷了，他將來自敵人心髒的大量高度機密，通過秘密電台，源源不斷地擺上了棗園窯洞裏毛澤東的案頭；
而眼下，他卻被幾個黨齡比他少得多的共產黨員們“識破”了麵目，他們無須懂得任何曆史邏輯與現實邏輯，隻需憑著疾利的權力之角，眼裏炭焰般迸射的階級仇恨，便能將他牢牢地抵牾進了死角！
“雖然我在東北的單線聯係人李年同誌，在西安陷入了敵人的魔掌，押送南京後又下落不明，但是這個情報組一定還有同誌健在，你們應該趕快去調查……”
葛佩琦一遍又一遍的訴求，哪怕是一堵牆也應該聽進去了。然而，對方覺得，對於一個右派分子，趕快要做的事情，不是去調查他曾做了什麼，說了什麼，而是得讓他從此後不再能做什麼，能說什麼。
1958年下半年，葛佩琦被判處無期徒刑，並投進山西省第一監獄服刑。