傅奕見蕭瑀言辭激烈，他從容不迫地據理反駁道：“禮本事於親，終於奉上，此則忠孝之理著，臣子之行成。而佛逾城出家，逃背其父，以匹夫而抗天子，以繼體而悖所親。蕭瑀非出於空桑，乃遵無父之教。臣聞非孝者無親，其瑀之謂矣！”
蕭瑀被傅奕批駁得啞口無言，想要反駁卻又無從下手，隻能將雙手合十，喃喃地道：“地獄所設，正為是人。”
當時，參加朝會的有太子李建成、秦王李世民等人以及魏徵，太子李建成什麼話都沒有說，任何意見都沒有提出來，不反對也不支持；秦王的態度也是如此，但是張道源卻是秦王府的人。因此，張道源的支持使得傅奕成為秦王府的人，與李世民交好，成為秦王府的門人。
秦王李世民之前也不曾將傅奕當成一回事，認為他隻不過是文人墨客，根本就不堪重用。但是，經曆過朝堂上的激烈爭鬥，使得李世民對他刮目相看。雖然傅奕太過於極端，反對信佛者，一心想要廢除佛教，尊崇道教以及儒學，隻不過傅奕敢在唐高祖李淵的麵前與朝中權貴據理力爭，毫不退縮。
他就知道傅奕定是一位忠君愛國之人，隻要傅奕成為秦王府中的人，必定會對秦王李世民盡忠職守，絕對不會叛離。因此，秦王李世民私下裏邀請傅奕進王府中一敘，直接了當的表達了自己愛才之心，願意將他招攬麾下，也是借此告訴於他，隻要歸附於他的話，傅奕可以繼續上疏奏請唐高祖李淵廢除佛教，使得傅奕二話不說效忠於李世民。
魏徵等人屬於逍遙王府的勢力，他們隻是站在一邊看著，根本就不曾有任何的意見。不過，魏徵也對傅奕不懼權貴的傲骨實在是佩服不已，隻不過魏徵知道他已經效忠於秦王，也就不了了之，而且魏徵覺得傅奕所言並非全部沒有道理，他也知道佛教徒甚多，一旦真的出現大規模的暴亂，或者被有心人利用的話，後果的確不堪設想，然而李逍遙率領麾下大將全部離開京師，使得魏徵隻能作壁上觀，不支持也不反對，一切聽從唐高祖李淵的意思。
恰如其分，唐高祖李淵接到前方捷報，使得他沒有立即當著群臣就表明自己的想法，這件事也就不了了之。然而，傅奕卻沒有放棄，他勢必要將自己的想法貫徹到底，堅決上疏奏請唐高祖李淵滅佛。隻不過，唐高祖李淵一直都是模擬兩可的態度，根本就沒有明確的答複與他，而且唐高祖李淵的心思根本就不放在這件事上，全部都轉移在前方的戰況，聽聞李逍遙節節勝利，大破突厥等消息，整個大唐都歡呼雀躍，李淵也沒有心思再去顧慮其他事情。
秦王李世民將傅奕收納成自己的麾下，唐高祖李淵也視而不見聽而不聞，隻不過這件事被太子李建成知道了。當時，太子李建成對於反對滅佛之事，根本就不在乎。隻不過，有一位高僧卻意外的找上門來，李建成好奇之下也就接見與他，但是這件事並沒有任何人知道，不是在東宮之中發生的事情，就連唐高祖李淵都不清楚。
李建成原本是微服私訪出去探查民情，卻意外與寺廟的高僧相遇，而且那個高僧似乎知道李建成的身份，直接向他傳教，並且將佛教之中的佛祖以及信仰一一相告，還稱讚李建成一臉的福相，像極了佛教中的多聞天王，樂善好施，認為李建成將來必定能夠事業順利宏圖大展，而且直指李建成胸有大誌，卻擔心另外一個人的看法，使得李建成本性被壓製，這才讓李建成真正的相信了佛教，也開始信仰佛教，甚至小字改成毗沙門，但是這件事他卻不敢跟任何去說，若是被唐高祖李淵知曉，後果不是他能承受的。
隻因為在當時，發生了一些事情，使得唐高祖李淵更加對佛教深惡痛絕，隻不過時機尚未成熟，也就一直沒有真正的下旨清除佛門教徒。恰逢其會，有一個從西域來的和尚，擅長咒術，他念起咒語能讓人立即死去，再念咒語又能讓人活過來。
如此的驚天動地的神術，能讓人死去活來，轟動了天下，就連唐高祖也感到莫名其妙，不知其中的奧妙，心中也有些不相信，就挑選了幾個強壯的騎士來實驗。結果被那個和尚試試，還真的顯靈。唐高祖就把這件事情說給了傅奕聽，他也認為佛教的確有些本事；傅奕聞之不屑一顧，斬釘截鐵地說道：“回稟聖上，這是邪術。臣相信邪不壓正，您讓他來給我念咒語，一定不會成功。”