五月壬子，陶茂林、藍斯明等渡河，跨渭而營。蘇倫保、常興阿馬隊繼之。趙既發、朱希廣營倉渡高陵，金順、溫德勒克西馬隊護之。次日，複令金順騎軍渡渭而南。丁巳，敗回於零口，陶茂林移營駐之。庚申，金順、穆圖善追回至零口，橋窄人眾，遮殺過半。多隆阿策回將他遁，豫囑陶茂林扼渭水伺之。越日，回果過戲河，我軍躡至。回盡毀所過橋梁，值大雨水發，人馬皆病涉，乃派卒輿梁以濟。軍士冒暑遄征，疫瘧並作，死者十二三，多隆阿亦患痢。約穆圖善等出南岸，朱希廣、趙既發屯交口，堅壁勿戰，以待南岸捷。
六月丁亥，回乘夜鳧水渡渭撲我營。趙既發開壁出擊，躡之過河，破回巢十三。朱希廣亦率軍渡渭而北。回以萬眾包抄，朱希廣、趙既發俱戰死。多隆阿聞敗，憤將士不用命，輿疾至交口；辛卯，親督諸軍三麵進攻，輔以炮船，殛回數百人，回匿不出。七月辛亥，克蒲萄窪、拜家村。乙卯克三府裏，毀白鴨嘴、烏什回巢略盡。丙辰，拔沙河老巢，溺斃悍回數千，漆水為不流。於是省東皆靖。丙寅，多隆阿至西安，與將軍、巡撫計事。瑛棨褫革遣戍，擢劉蓉陝西巡撫，由四川率師入秦，未至，按察使張集馨暫權之。穆宗以鳳翔、平涼被圍久，諭多隆阿撥兵馳援。乃令陶茂林三千五百人援鳳翔，曹克忠攻鄠，穆圖善攻十三村。
八月丙申，多隆阿還駐交口。庚子進屯普陀原，大雨，結橋以渡；令雷正綰攻永樂塔底，馬升扼鹹陽。壬寅，穆圖善攻十三村，下之；進規高陵，留兵戍之。雷正綰克永樂、塔底。戊申，回由渭渡涇，我軍移屯河北逼之。回乘勢來犯，多隆阿令馬隊嚐之；回敗走，躡之長陀灣。辛亥，進攻蘇家溝，回精華所聚地也。甲寅下之，殲回五千，俘獲無算。進破渭城灣，殲萬七千人，群回多走甘肅。總督熙麟僻處慶陽，護總督恩麟在蘭州，寇所至無人遮遏，固原、平涼、井舍皆墟。是時，陶茂林破川匪於郿，進攻槐芽鎮、白家凹，皆下之，遂薄鳳翔，壁七裏河，鳳郡解嚴。知府張兆棟由是知名。陶茂林擢甘肅提督，多隆阿移西安將軍，曹克忠授河州鎮總兵。克忠渡渭，擊白起營、馬家埠，破之，關輔稍靖。詔促多隆阿援甘，陶茂林移軍度隴，與雷正綰會攻平涼。
十月庚辰，川匪陷盩厔。辛卯，曹克忠大捷於白吉原，回走固原。壬辰，雷正綰由永壽趨邠州，回解圍遁。自是陝西回懾多軍威，逐漸西趨。而寧夏漢、回互鬥，兵備道侯登雲練民團備之。將軍慶瑞惑撫議，奏劾侯登雲，勒漢團繳軍械。丁酉，回夜襲寧夏，陷之；侯登雲遇害，漢民屠戮無遺。滿城隔數裏，慶瑞佯為弗聞也。次日，靈州回起，陷州城，大掠滿營，捆載而去。事聞，嚴旨責慶瑞，促熙麟赴蘭州接印。諭山西巡撫英桂，撥楚勇千人，屯定邊；直隸總督劉長佑，揀勁旅二千，提督訥欽統之，援寧夏。
寧夏者，宋之西夏，地沃饒稻，東接榆、延，西達涼州、蘭州，趙元昊據以抗衡中國者也。自元年陝回煽變，遣黨四出勾結。於是靈州之同心城，鹽茶廳之預望城，伏莽滋起。而馬化隆亦據金積堡，設碉卡，納亡命，反側鴟張，虎視一隅。寧夏既陷，其酋赫姓使使迎馬化隆入城；群回跪道左，鹹聽命焉。是時，馬彥龍、馬占鼇起和州，陷狄道。馬桂源、馬本源起西寧，逐總兵、知府。桂源自為西寧守，本源自為西寧鎮，辦事大臣玉通不能製。其後馬文祿踞肅州，自稱兵馬大元帥。而岷、洮、渭源、靜遠、循化、會寧、安定等處，先後變亂，甘肅全境無完土矣。自金陵合圍，苗沛霖誅殛，東南事機日順。多隆阿乃請下兩江督撫撥兵赴陝，且催石清吉楚軍西行。
十一月大雪，劉蓉軍次褒沔；以漢南賊勢猖獗，約多隆阿分兵夾擊。多軍方圍盩厔，未暇也。十二月，蓉至寧羌，川督駱秉章增撥九營助之。詔促劉蓉趨青石關，與京卿李雲麟規複漢中、城固。會洪秀全召粵賊援金陵，漢南諸酋始各離散，陝西稍稍息肩矣。
三年正月，粵賊棄漢中、興安東走。多隆阿遣馬隊防西安，劉蓉至漢中。多隆阿益力攻盩厔，部將多傷亡。二月癸酉，地雷發，城坍僅數尺。諸將踐登，士卒傷至三千餘，卒弗克。適陶茂林軍抵汧陽，曹克忠擊破麟遊各匪，雷正綰複大捷於靈台。援甘諸軍，所向皆利。多隆阿為川匪所，督戰愈急；甲午，令軍士攻月城，自登炮台親鼓之，槍子傷左目，鼓音不絕。次日克盩厔。捷聞，穆宗頒珍藥賜多隆阿，遣其子雙全隨侍。旋因傷病重，請以穆圖善權欽差大臣。詔允之。
三月，劉蓉至西安。甘回竄隴州之神峪河，陶茂林擊敗之。雷正綰大捷於平涼之四十裏鋪，殛回目楊自明等數千人。
四月，多隆阿卒於軍。德興阿真除西安將軍，穆圖善擢荊州將軍，與劉蓉會辦陝事。固原提督雷正綰仍偕陶茂林、曹克忠會師援甘。訥欽罷，以將軍都興阿接統寧夏軍。茂林已平神峪河，約正綰攻平涼城。城回乞援固原，糾悍黨八千來犯。茂林要擊於米家溝，大破之。回走大和溝，為正綰所截，馬隊乘之，追至紙坊川，殲焉。遂薄平涼而營。克忠連敗賊於長寧驛、馬麻鎮。李雲麟敗粵賊於仙河，以糧盡還興安。群賊集陝南，陝回導至灃河。
五月戊申，金順與賊戰灃河，陣斃七百人。賊退踞秦渡，彭基品渡河擊之。賊走鄠，金順、黃鼎追至盩厔之祖庵。雷正綰、陶茂林圍平涼，回糧、藥俱罄，閉門不敢出。官軍樹雲梯以登，戊午克平涼。回西保瓦亭，庚申攻克之。先是靖遠回張保隆款於恩麟，計取鹽茶、固原兩城，臬司楊柄鋥、總兵穆隆阿受之。固原在瓦亭北。北路既靖，官軍乃趨張家川。時粵賊分踞樓觀、黑水、西駝峪，連營四十裏。劉蓉調蕭慶高趨鄠，穆圖善率師助之。乙醜，劉蓉自率湘果營會穆圖善擊賊店子頭，敗績。何萬春中炮死，王謨、米方多爾、濟蘇彰阿俱受創。金順率馬隊突之，湘將唐友勝橫出夾擊，賊始奔。丁卯，曹克忠敗賊郿之西河口。戊辰，賊棄郿走入盩厔境。
六月丁醜，曹克忠敗賊黑水峪，郡賊多降。七月乙亥，劉蓉、穆圖善敗賊於大峪西堡，進攻樓觀。時偽扶王陳得才由陝入鄂，穆圖善前派二十八營赴援，無統帥。劉蓉奏請穆圖善往湖北，而以陝事自任。上令穆圖善移師赴甘。秋雨兼旬，雷正綰、陶茂林屯瓦亭未能進。而自隆德至張家川，山澗屋壘，回於石壁上堅築兩壘瞰我軍。
八月己巳朔，進攻木城。辛未克張家川，殲回六千餘，俘二百三十一人。殘回走龍山鎮，雷、陶兩軍躡之。回棄龍山，並入蓮花城。壬申，陝回孫義寶潛率四千人犯固原，赫明堂內應，固原陷。壬午，雷正綰、陶茂林克邵堡、馬堡；乙酉進攻蓮花城，失利。正綰受矛傷，兵弁死者千餘人。
先是，都興阿克寶豐，駐靈州花馬池。而河州紳民訴守將趙必達恇怯，詔曹克忠赴河州本任。蓮花城之敗，雷正綰奏催曹克忠速來。朝廷乃益促穆圖善、曹克忠統兵赴甘，而令都興阿花馬之軍與雷、陶聲勢相聯；授楊嶽斌陝甘總督。
九月丙午，粵賊陷階州，雷正綰創愈；策固原回且襲平、涇，分平涼戍兵，屯涇之合道街，令譚玉龍等還守涇。已而固原回果犯平涼，分黨圍合道，劉正高、譚玉龍擊卻之，回走鎮原。頃之，曹克忠至蓮花城，官軍勢益振。
十月癸酉，克蓮花城。川督駱秉章遣總兵周達武等會蕭慶高、劉厚基、黃鼎援階州。雷正綰念河州回氛尤熾，奏以陶茂林馬步十七營駐蘭州。旨報可；且以蓮花城毗連秦、階，令曹克忠屯戍之。雷正綰還軍平涼。
十一月，周達武等軍至階州，環城而壘。城賊出犯，頻破之，乃扼北山諸隘，阻舊城深溝以困賊。蕭慶高、黃鼎、周達武屢與賊戰，殺傷相當，蕭舉臣、薑福元陣歿。賊酋亦受創，賄遺番民二萬金，假道由南坪出走。番民以告周達武，達武疑而卻之；複訴之劉鶴齡。劉蓉慮番民難信，令諸將各揀一營前往，而留重兵於階。
十二月戊寅，蕭慶高銜枚出隊。賊撲我南山營。周達武、江忠淑兩麵夾擊。蕭慶高複令諸軍攻附城各壘，戰良久，弗克而還。曹克忠攻高家堡，下之；複敗回於楊家山。回分兩股，一趨平涼，一趨華亭。適雷正綰由瓦亭攻開城，聞之，乃返旆窮追，一晝夜行三百裏，及之平涼花所鎮。曹克忠部將亦追至華亭。回迫追師，複合為一，詐稱官軍，闖入靈台，殺知縣祝賓暘。雷正綰躡至，回奪門走涇州。官軍複擊之，乃越荔家堡而西。餘萬明截之於黨原，斬俘殆盡。雷正綰還軍開城，張集馨已卸陝撫，詔令赴蘭州助恩麟。集馨率三營行次隆靜，糧匱弗能進，雷正綰奏留行營。是時，回騎慓疾，官軍苦乏馬，難以製勝。而陳得才等在鄂、豫歸誠，東南事緩；乃疏調副都統蘇倫保、常興阿、溫德勒克西、富森保四起馬隊自鄂赴隴，皆多隆阿舊部也。
四年正月，雷正綰遣沈懋貴攻彰義堡，譚玉龍等攻固原。甲寅，克彰義堡。曹克忠攻蕭何城，下其附近回堡五。張保隆複降於我，率降回助攻固原。固原回酋孫義寶糧罄出戰，大敗入城。城回約內應。二月丁卯朔，克固原，孫義寶自殺。陝回還相戕，騎賊奪北門走，張保隆躡而擊之，俘斬五千，餘眾入黑城子。癸未，曹克忠敗回於馬家嘴；甲申，複敗之將台堡；進攻隆德堡，下之。蕭何城回目蘇上達詣張集馨降。集馨率所部由靜寧向省城，克青家驛，道威戎鎮至洛門，掃蕩而前，通渭、寧遠、隴西、會寧皆無寇。未幾，鞏昌陷。正綰乃移陶茂林屯安、會間，張集馨還駐固原。於時，諸軍所向皆捷，而饋餉不繼，正綰奏以林壽圖督糧運。詔允之。
三月丁未，雷正綰、張集馨會攻黑城子，降回張保隆、馬永和馬隊助之。環攻三日，回詭辭乞撫。集馨攻益力，庚戌克黑城子。次日，曹克忠克鹽茶廳城，皆甘回堅巢也。餘回並入李旺堡、同心城。捷聞，上大褒獎。時口外獵戶焚掠肅州，莠回乘之作亂，西寧回陷大通，圍郡城；寧夏回掠鹽場、花馬池。上慮都興阿兵單，飭雷正綰撥兵赴定邊，顧後路，促楊嶽斌兼程赴甘，道員蔣凝學先赴西寧，而切責辦事大臣玉通養寇殃民；蓋玉通諱飾已久，朝廷早察其奸矣。
自回逆煽變，甘肅地荒人少，耕種廢時；士卒忍饑血戰，朝不保夕。將帥征餉不至，則以空言撫慰，軍弁怨谘，而未有以發也。會陶茂林丁憂乞終喪，所部七營同時嘩潰。四月乙亥，掠隴州長寧驛，聲言赴陝。劉蓉遣弁遮之寶雞。適楊嶽斌至西安，增遣中軍赴寶雞招撫。而潰卒已入盩厔、兩當境，蓉乃檄標兵要擊之。陶茂林奉旨改署任，擊回安定，失利，部卒複潰，所領十七營，僅存其五。恩麟調曹克忠趨安定。克忠方攻同心城，雷正綰攻預望城。詔烏魯木齊提督成祿援安定。
五月丁未，周達武等克階州，移蕭慶高等軍還潼關，禦撚匪。楊嶽斌全軍度隴。雷正綰疊克預望城、下馬關，進攻靈州，奏訴餉匱，曹克忠亦以糧盡乞罷。朝廷以靈、夏諸軍久不得要領，切責都興阿、穆圖善，而令駱秉章助兵協餉，移陶茂林潰卒之餉濟克忠。時甘肅臬司楊能格駐慶陽督糧運，乃飛檄催之。雷軍夙倚糧涇州，曹軍倚糧鞏、秦，亦複資食於回。至是轉運不至，回糧亦罄，惟力攻賊巢乃可得食。曹克忠已下同心城，進駐寧安堡，聲言渡河援中衛，已乃徑趨金積堡，屯強家沙窩。雷正綰由靈州進兵與相聯。
閏五月己卯、庚辰，曹克忠連獲大捷，斬馘二千。其地距金積堡十五裏，卡壘林立，水鹹澀，飲者立病。軍初至，雜糠秕為食；已而草根掘盡，不得一飽。回偵我軍疲，率悍黨環攻之。克忠驅饑軍與戰。六月乙未，克其卡三；丁酉、戊戌，克其卡五，獲糧仍不能濟軍；乃益約雷正綰進攻，庚子複克卡五，遂薄金積堡。回預伏馬賊萬餘，自十裏外圍抄。雷營先挫，傷亡二千餘人。曹克忠方下高章三堡，見敗，徐令收隊。回勢益猛，營官周有貴、秦久勝、朱有文、董逢春等戰死，弁勇死者數百人，乃退二十裏而營。正綰上疏自劾，克忠白總督奏參。楊嶽斌初至，頗陳克忠戰功，得旨寬免。
七月，靖遠教匪丁建善等作亂，楊嶽斌親討平之。八月己亥，嶽斌還蘭州省城。初，陶營潰卒為陝兵擊敗，降者資送回籍。餘黨自隴州走鳳縣，劉玉興、蕭德揚等連破之，歸誠者二千三百餘人，分別留遣。
陶營亂靖，而雷營變複起。正綰部將雷恒者，與回首赫明堂通，煽全營謀叛。正綰涕泣勸阻不能止，憤極自刎不殊；諸將救之，乃率李啟高步隊四營、馬隊二起退固原。回襲奪之，再退平涼。提督譚玉龍、周顯承先督糧涇州，潰卒至，輒招撫之；留慶餉萬八千金濟用，遂得四營，合舊部為七營。
九月癸亥朔，雷恒、赫明堂掠涇之二十裏鋪，劫餉銀、麥麵，官軍不能製。時涇州防軍僅五營，譚玉龍新收潰卒及劉效忠、胡大貴之勇，旗械多闕。楊嶽斌悉發涇台存餉三萬金，催陝撫接濟餉械。而金積堡回窺延、鄜；河、狄回犯鞏昌，圍寧遠；馬營監、義岡川回竄張家川，分掠隴州之馬鹿鎮，另股竄慶陽之寧州。自蘭州至西安，千裏烽火相望，居民倉皇奔走，不知所向。楊嶽斌乃令譚玉龍等移屯慶陽，保糈台；李助發移屯隆德。雷軍西潰者，聯捷、林之望招撫成五營。
十月，甘涼道黎獻討肅州回。壬寅，遣楊天興馬隊截之大通，我軍大挫。丁未，米拉回陷臨水，擄糧台，黎獻軍饑潰。於是，甘省勁旅叛逃殆盡。自楊嶽斌楚軍外，僅曹克忠一軍與回相持而已。
十一月，嶽斌部將李助發敗回於會寧之乾溝，劉祥勝敗回於李家莊。十二月壬辰朔，回掠甘草店，營官餘華尤中槍殞，金縣守將楊明海擊走之。癸卯，曹克忠敗回於新市；傅先宗追至漳縣，複敗之。自諸軍潰亂以來，回勢益驕；由隆靜達蘭州六七百裏，山川複遝。楊嶽斌僅恃自統楚軍通驛路，乃奏調湘軍健將自助。疏曰：
“臣抵甘後，因兵餉兩絀，原欲就現有兵力以圖進取。自陶茂林軍潰於前，而兵不足；雷正綰勇變於後，而兵愈不足。是以不得已而有增兵之請。乃周達武因進剿番匪而不克來，蕭慶高因防守陝邊而不果來；而鮑超則調赴江西矣，李鶴章則奏留江南矣，蔣凝學則請假回籍矣，金國琛則因事留皖，一時未能赴任矣。鄰省既乏援師，而東南各軍之準調赴甘者，又複不能應手。現在河、狄之賊擾於南，平、固之賊擾於東，寧、靈之賊擾於北，涼、肅之賊擾於西，幾於剿不勝剿，防不勝防。臣若株守省城，則饑軍終成坐困；若出省剿辦，則根本時虞動搖。外察賊勢，內度兵力，實屬不敷分撥。查記名提督朱蘭桂，記名按察使劉連捷，勇略兼備，素所深知，聞現在江西防堵。該省兵力有餘，請飭該二員即率所部赴甘，以資援剿。”詔如所請。其後劉連捷等竟不至，總兵鶴齡率川兵千人抵蘭州。
五年正月戊辰，楊嶽斌發蘭州，道鞏昌以赴涇，留署藩司林之望、中軍羅宏裕等守省城。洮州回陷洮州廳城，檄曹克忠討之，留羅進賢防鞏。壬午，嶽斌至涇，彭楚漢連敗回於水阜河、棗楚坡。丙戌，曹克忠軍次李岐山，距洮州十裏。回目馬芳等乞降，克忠受之。二月，洮州同知淡殿臣率漢回繳械馬，克忠誅其酋丁重選等，壬子還鞏昌。楊嶽斌赴慶陽，與陝西藩司林壽圖籌防守。
三月壬戌，蘭州標兵叛。初省城糧絀，標兵王占鼇約十八人飲血臿盟，約回兵馬文、馬福等，勾狄河、北山回來省，將舉城以獻。是日，標兵集東門外，馬文毀城鎖放兵入；中軍羅宏裕、參將王金楷、遊擊李玉安訶斥，俱受創，搜協署幕客、委員悉戕之。叛弁席光鬥、馬耀祖呼標兵公圍總督署，殺委員、幕客數十人，仆從數十人，親兵十餘人，露刃向司道，逼林之望飾詞入奏。癸亥，北山回至廟灘，狄河回至尖山，遙為標兵聲援。標兵益驕，殺皋蘭縣鄧承偉，抬官民馬為騎隊，遠近剽掠。省城糧價每鬥易銀三四十兩，割人肉療饑，餓斃者不可勝數。司道百計安撫，弗應也。楊嶽斌在慶陽聞變，馳回涇州，檄曹克忠自鞏昌移駐蘭州。是時，回酋孫義章等陷隆德，圍莊浪，分股掠慶陽之西峰焦村，冀入陝就食。