卜式因為這次行為，再次得到了漢武帝的賞識，又兼他在齊國為官多年，政績卓著，這樣的好幹部，當然要提拔到中央裏來。就在這場“大清洗”運動後不久，卜式被提拔為禦史大夫，成為此時漢帝國的高官之一。漢武帝又特意“明告天下，使明知之”，此時的卜式，已經成為漢帝國出名的“愛國標兵”。 三
官升禦史大夫，標誌著卜式獲得的榮寵已經到了極點，但是他和漢武帝的關係，也從此開始惡化。
卜式和漢武帝之間的交惡，主要在對經濟改革的不同態度上。
前麵說過，當時漢武帝的經濟大改革，在全國引起了強烈的反對，包括鹽鐵官營，向商人征收個人所得稅，改革幣製等政策，都引發了強烈的不滿。比如西漢掌握財政的大司農顏異，就因為反對錢幣改革，被加了“腹誹”的罪名殺害。雖然酷烈如此，但是反對經濟改革的暗流仍在，漢武帝幾次要求商人們出錢捐助國家，都應者寥寥，也是因為當時整個商人階層對漢帝國財政政策的抵觸。提拔卜式為禦史大夫，是因為漢武帝認為卜式是經濟改革政策的支持者，足夠壓製反對派。但事與願違，卜式偏偏是經濟改革政策的反對者。
其實卜式對經濟改革的反對也是有限度的，他並不反對當時漢帝國實行調整稅收、增加商業稅的各項政策，這確實是增加國家稅收的重要手段，卜式反對的，是經濟改革中的暴利政策——鹽鐵官營。鹽鐵官營的實施，在當時收到了非常良好的效果，雖然商人們反對連連，但是國家從中收取了大量金錢，並且支持了國用，因此主流的士大夫們，還是積極讚揚的。真正看出其中潛藏問題的，還是卜式。卜式做禦史大夫的第一件事，就是上奏直斥鹽鐵官營的隱憂。他認為國家對鹽鐵業管得過死，一切的經營權利都由朝廷掌控壟斷，帶來的結果就是鐵器質量下降。而且國家將製鐵業收歸國有之後，同時也把鹽鐵的定價權收歸國有，鐵器價格過高，導致老百姓根本無力購買，而政府又強令老百姓購買，這樣就增加了老百姓的負擔，長此以往，甚至會激起民變。針對當時漢帝國難以遏製的物價上漲問題，卜式認為，問題的症結在於政府大張旗鼓實行的船稅政策。征收船稅原本沒錯，但稅率過高，增加了商人的負擔，為了彌補損失，商人們也隻有提高商品的價格。卜式還認為，如果商品價格上漲，超過了老百姓的個人購買能力，那麼後果將是非常可怕的。
卜式的這些觀點，從後麵發生的事實看，都是準得離譜的。鹽鐵官營的實行，確實挫傷了鋼鐵業的生產積極性，導致鐵器質量下降。而且鐵器的攤派購買，也增加了老百姓的負擔，到了漢武帝統治的後期，老百姓之所以扔下土地，紛紛逃亡，一個重要原因就是農具的價格遠遠超過了種地的收益。而漢帝國在這一點上，采取的是強製攤派的做法，每家每戶每年買多少鐵器，都有嚴格的規定，就算用不上也要買，錢是必須要交的。這樣做，漢帝國老百姓的負擔越發沉重，生產遭到的破壞是難以想象的。
卜式的這些看法，自然得罪了當時朝中的改革派，尤其是這場改革的倡導者桑弘羊。當時在朝堂上，桑弘羊曾經幾次和卜式發生爭論，桑弘羊洋洋自得地聲稱自己“民不加賦而國用足”，卜式卻斥責他“隻追小利，不識大體”。可桑弘羊這時候是漢武帝的寵臣，得罪了桑弘羊，也就等於得罪了漢武帝。與此同時，卜式還向漢武帝提出了“還富於民”的主張，即在對匈奴的戰爭已經取得決定性勝利的背景下，適當地把國家的稅收投入到農業生產之中，尤其是要補償各地農民的生產生活。這些主張是在挑戰漢武帝的忍耐底線，但念在卜式幾次毀家紓難的義舉，漢武帝並沒有對卜式進行太多懲罰，隻是在公元前111年，把卜式從禦史大夫改成了太子太傅，這個任免決定可以說是明升暗降，表麵上卜式的地位上升，其實被剝奪了實權。
但卜式還在繼續得罪漢武帝，特別是在他擔任太子劉據的老師期間。卜式多次向劉據灌輸養民的思想，得到了劉據的認同。劉據在做太子的後期，多次提議漢武帝減少戰爭，發展生產，父子交惡，源頭就在於此。在做太子太傅期間，卜式還做了另一件事情，公元前110年，因為連年幹旱，卜式趁機上奏，請求漢武帝殺掉此時炙手可熱的寵臣桑弘羊，他認為正是桑弘羊惹得天怒人怨。對卜式的這個奏疏，漢武帝自然不接受，但是也沒有處罰卜式。卜式就這樣在太子太傅位置上得到了善終。關於他去世的年份，曆史上的記錄很混亂，大多是說在長安動亂之前，所以說他還是很幸運的，如果他活到了太子劉據叛亂時，很可能會被漢武帝滅族。
卜式的人生雖然簡單，但是他卻提出了一種新的發展思路，即養民思路。在他一生的各種奏章中，疾呼最多的，就是國家要還富於民、藏富於民，即用國家的經濟儲備，給予老百姓充足的經濟利益，隻有這樣，才能保證國家收入的增加。他的這些理論，當時不被漢武帝所接受，終其一生，漢武帝隻是把他當作一個愛國的楷模。但是在他的身後，特別是兩漢之後，他的理論被越來越多的統治者所采納，比如北宋王安石改革中的青苗法，就是脫胎於此，而明朝的優老之禮等福利政策，也與卜式的政策有異曲同工之妙。我們說過，從公元前119年漠北大戰打敗匈奴後，戰禍連年的漢帝國其實麵臨著難得的休養生息的機會，然而在桑弘羊和卜式這兩種不同的發展思路麵前，誌在開疆拓土的漢武帝，卻選擇了前者。如果他可以重新再選擇一次，漢朝最後平滅匈奴的進程，也許會順利得多，曆史恐怕也就是另一個寫法了。