將同文館改建為京師大學堂的折子，正是光緒授意都察院左都禦史孫家鼐等人上的。
孫家鼐和翁同龢一樣，都曾擔任帝師，他們兩人在此時的朝廷中樞中，是最有威望的兩位大臣。不過在穿越而來的光緒心目中，孫家鼐比起翁同龢來，要更加務實和開明。曆史上，正是這位孫家鼐在甲午的時候，強烈反對為朝鮮的宗主權和日本開戰。戊戌時期，身為帝黨的他讚成光緒的許多新政，並擔任京師大學堂管學大臣一職。戊戌變法失敗後，慈禧“罷新法，悉複舊製”，卻獨留京師大學堂，而身為帝黨的孫家鼐也未獲罪。僅此一點便可以看出，孫家鼐絕非庸碌之輩，也不是空有書生意氣，不懂朝局政治的迂腐之人。
事實上，在光緒眼裏，這位孫家鼐也並非最合適的人選，孫家鼐雖然也主張向西方學習，走的卻仍然是後來張之洞提出的“中學為體，西學為用”的路子，這種縫縫補補的見識和光緒想要的差距甚遠。
從深心裏說，光緒也很希望像發現陳卓那樣，發現一個主持京師大學堂最合適的人選，但是曆史畢竟是曆史，哪裏又有那麼多金手指可以開。在這個舉國封閉，一片蒙昧的時代，能夠有這樣的見識已經很不錯了，況且光緒終日都在皇宮裏麵和那些大臣打轉，也沒有時間和條件去慢慢發掘。
所以從去年年末，光緒便有意識的頻繁和孫家鼐這樣的禦史清流們接觸，暢談國事，明晰學識，為的也正是開辦京師大學堂。而這些人當中，最有可能支持光緒的，恐怕也隻有孫家鼐了。
果然，在明白了光緒開辦京師大學堂的主張後，孫家鼐大為讚同，並立即聯絡了幾個禦史清流，一同向朝廷上折建言，請求將同文館改建為京師大學堂。
仁壽殿內，聽著這個忽然冒出來的京師大學堂，慈禧也是頗為躊躇。
聽了孫毓汶的解說，對這個京師大學堂慈禧也慢慢明白了所以，和當年讚同創辦同文館一樣，對開辦京師大學堂能夠給眼下的朝廷帶來的好處，慈禧內心中也是有幾分認同的。
這些年來，這個朝廷都是她在當家，她自然明白朝廷的根底。朝廷中這些老臣勳舊雖有忠心，但卻無辦事能力，守成尚且不足，更加談不上創新了。像李鴻章在北洋辦的那些礦山、鐵路、電報局、製造局等，哪一樣不需要精通西洋諸學的人才，而這樣的人才科舉是萬萬培養不出來的，培養新的人才，隻能改用新的辦法。
但是孫毓汶最後頗有深意的一句話，又讓慈禧大為頭痛。孫毓汶告訴慈禧，開辦京師大學堂是皇上的主意。
“皇上這些日子是怎麼了，朝廷是事務也沒見他這麼用心過，怎麼成天就琢磨開辦學校的事情啊？”慈禧皺眉說道。
“微臣也不是很明白，所以特來請太後的示下。”孫毓汶不置可否的說道。
他對京師大學堂倒並不是很在意，秀才造反，十年不成。把一些個書生弄在一起，遠遠比不上那個新建陸軍學校讓人驚心的。他顧忌的是慈禧的態度，以及帝黨一係，會不會因此逐漸得勢。
見孫毓汶沒有什麼態度，慈禧又把目光投向了坐在一旁的剛毅。
見慈禧望向自己，剛毅遲疑了片刻說道，“奴才對開辦京師大學堂有些異議，洋人的東西未必都是好的，不過是奇技淫巧罷了。綱常倫理，道德文章，向來是我朝取士的根本。倘若開辦京師大學堂，這些學子將來又能從朝廷獲得官職，我朝的科舉又將置於何處？豈不是寒了天下士子的心。”
孫家鼐的折子慈禧並沒有看，也不知道裏麵有著這麼一條，從京師大學堂畢業的學子，朝廷將實授官職。此刻聽剛毅一說，拿過桌上的折子仔細的看了一會兒說道，“我看孫家鼐的折子裏說的也不是沒有道理，倘若朝廷將來不給這些畢業的學子一定的官職，你們想想，又有誰會去讀這個京師大學堂呢？科舉連著官場，士子們才會趨之若鶩，這裏麵的道理你們都清楚，總還是要有點實在的利益，才會讓士子們棄舊學而就新學嘛。”
“太後的意思奴才明白，但是科舉是固國安邦的根本，國之重器不能輕動，還望太後深思。”剛毅垂首說道。
“科舉還是要辦的，這個京師大學堂嘛……”慈禧猶豫了一下說道，“回頭我再把皇上叫來斟酌一下，但是你們幾個軍機大臣心裏也要有個數，倘若咱們大清也能像洋人那樣造出堅船利炮，又何至於現在處處看洋人的臉色呢？就算是奇技淫巧，學一點也影響不了什麼大局。”