當然，犯傻的還有那位跟著瞎出主意的黃子澄。他後來輔佐朱元璋的孫子朱允炆，麵對燕王朱棣的叛亂，身為兵部尚書的他卻傻主意不斷，雖然盡心竭力卻總是幫倒忙，害得朱允炆丟了江山。傻人，放到哪裏總逃不過一個“傻”字。
而在台灣問題上，明王朝的“傻主意”很快遭報應了——在朱元璋過世僅一年後。
明朝建文二年（1400年），正忙於和四叔朱棣爭皇位的明惠帝朱允炆，被日本人在背後捅了一刀。是年八月，大批倭寇以台灣島為基地，對明朝福建、浙江、廣東三省再次展開大規模侵擾。此時明王朝東南地區的大批軍隊正調往北方參加對朱棣的作戰，沿海防務空虛。倭寇背靠台灣島，來來回回牽著明軍的鼻子走。“兵至倭退，兵退倭兵複又來”。整整兩個月，倭寇連續襲擾明朝東南沿海寧波、溫州、泉州、惠州、海口五大城市，在中國東南沿海輕輕鬆鬆地搞起了“自由行”。日本曆史學家田中芳樹在記錄倭寇入侵時承認，當時日本侵擾中國東南沿海，有兩個重要的落腳點，一個是今天毗鄰韓國的對馬島，倭寇以此為基地，進犯朝鮮半島以及中國遼東半島、山東半島地區；另一個就是中國的台灣島。
靖難之役以朱棣的勝利告終。這位皇帝在位時勵精圖治，明王朝的綜合國力較朱元璋時代進一步增強。對倭寇問題，朱棣也采取軟硬兼施的手段，一方麵對日本展開“外交攻勢”，用“朝貢貿易”籠絡日本上層；另一方麵又采取強硬措施，全力絞殺進犯中國沿海的倭寇。永樂十七年（1419年），明軍在遼東望海窩全殲了入侵的兩千倭寇，導致日本倭寇元氣大傷。終永樂一朝，日本方麵極少有倭寇進犯，隻能夾起尾巴與明朝做生意。
對台灣島，朱棣也還惦記著。永樂時代震驚世界的“鄭和七下西洋”，其中有五次都曾在台灣島停留。鄭和艦隊不但在島上補充淡水食物，更接見當地部落首領，宣示明王朝主權。朱棣通過日本使者轉告當時日本的實際統治者足利義滿，宣稱“澎湖，小琉球（台灣島）之民，皆朕子民，不可欺也”。總之這段時間，懾於明王朝強大的國家實力，再加上日本此時“北朝”平滅“南朝”，國家短暫統一、政治暫時穩定，一時未敢造次，隻能老老實實與明王朝做生意。
老老實實了沒幾年，日本人開始不老實了。
強硬的永樂皇帝朱棣過世後，繼位的明仁宗朱高熾是個守成之君，不到一年即過世，之後的明宣宗朱瞻基，也是一個不願多生是非的人。此時明朝海疆承平日久，對倭寇入侵也就不像早年那般敏感了。明朝人好了傷疤忘了疼，日本人卻漸漸開始得寸進尺。早在宣德四年（1429年），就在南京發生了日本朝貢使團打死中國商人的事件。朱瞻基“襟懷寬廣”，下詔從寬處理，僅讓日本凶手賠償了一百兩白銀了事。兩年以後，日本貿易使團公然在山東劫掠商隊，殺死商隊成員、搶劫貨物，朱瞻基也一樣赦免不辦。明朝越“寬容”，日本人就越蹬鼻子上臉。本來明朝與日本的“朝貢貿易”，對日本商隊的規模、人數、攜帶武器，都有嚴格的限定。朱棣在世時，日本人老老實實守規矩，半個“不”字都沒有。朱棣過世後，日本人就開始“違禁”，經常是大批船隊攜帶武器來中國“做買賣”，開了價不許還價，價格談不攏就明搶。明朝官員稍有抗議，日本人就把臉一板，揚言要帶大批倭寇來華搶掠。連霸道帶嚇唬，每次都能逼得明朝方麵忍氣吞聲。當年製約日本的“朝貢貿易”，搞到明朝中期的成化、弘治時期，反成了明朝人自己作繭自縛。當然，強買強賣的日本人同樣不老實。明朝正統四年（1439年），就有一支日本商隊打著“朝貢貿易”的名義，突襲浙江沿海，攻破台州、寧波、定海三城，一路殺掠無數。
朝貢貿易時期，地理位置特殊的台灣島對日本人十分重要。日本國內各類史料都記錄，日本大批武裝船隊來華“貿易”時，其大部隊多停靠在台灣、澎湖列島觀望，先派小股船隊至南京“貿易”，若發現明軍防備不嚴，則大隊人馬隨後跟進，對中國沿海伺機進行劫掠。而一旦倭寇遭到明軍沉重打擊，甚至麵臨遭圍殲的滅頂之災時，在澎湖、台灣“望風”的倭寇船隊就會前來增援，幫助同夥突出重圍。台灣島地廣人稀，少數民族多是原始部落，不是倭寇的對手，隻好堅守自保了。倭寇在明朝成化十三年、弘治十二年兩次對浙江、蘇南發動大規模襲擾，都是在明軍即將殲滅敵人的情況下，遭到來自台灣島的倭寇艦隊襲擊，最終功虧一簣。對此，明朝弘治元年（1488年），時任福建巡撫的林俊曾在給明孝宗的奏折裏痛陳：“澎湖周遭，今海賊倭寇聚集，來去進退多憑依也，故倭寇屢剿屢不平，實因此也。”
明朝立國早期對台灣的政策，以及台灣早期遭到倭寇侵擾的曆史，無論在當時人的觀念裏，還是在後代史家的各種記錄中，都沒有被當作一件大事。倭寇侵擾？不過是幾個毛賊作亂而已。大規模的人口遷移在明朝曆史上不算稀罕事。比如台灣“被搬家”的同時，明王朝還曾遷移江南、湖廣地區的大批人口到北方屯墾。南宋時期人丁繁茂的湖北、湖南地區，一度竟成了“無人區”。大明將近一千萬平方公裏的國土上，台灣就像是芝麻粒大小的一個點兒。倭寇侵擾，對於明王朝來說不過是撓癢癢。
如果說曆史是一部電影，那麼這個時期的台灣，確實隻是一個龍套。波瀾壯闊的風雲變幻中，連個特寫鏡頭都撈不到。但曆史是一個高超的編劇，前麵故事中一個微不足道的小人物，沒準什麼時候，就會成為影響劇情的大人物，甚至是一段故事情節的主角。跑了上千年龍套的台灣，在中國曆史的這部大戲中，伴著零零星星的戰火，漸漸成為重要的角色。因為與之相關的，不僅僅是一個簡單的東南海防問題，更不隻是幾個打家劫舍的倭寇，而是牽連著一個中國從未經曆的新時代，它是一個細細的線頭，在未來的曆史中，牽起這個時代，牽動整個中華的變局。
這個新時代的名字，就是大航海時代。