可他萬萬沒想到，馮錫範自稱的“辭職”，其實是忽悠他的。幾天後，陳永華的辭呈送了上去，鄭經哪舍得他走，連忙找來馮錫範商量。麵對鄭經的垂詢，馮錫範又打感情牌，拿出給勞模做報告的派頭來，一個勁兒說陳永華這些年的艱辛，比如一心撲在工作上，身體每況愈下，家裏的事都顧不上雲雲。說得鄭經也感動了，既然如此辛苦，那還是準了吧。結果，陳永華的辭呈被批準了，但他“總製使”的官職卻被口口聲聲要辭職的馮錫範接替。陳永華這才明白，自己掉進了馮錫範早就策劃好的圈套裏：先騙你辭職，再頂你的缺。可現在為時已晚了，辭職是自己主動的，想找鄭經告狀也沒用。心灰意冷的陳永華不久鬱鬱而終，死後與夫人葬在台南大潭山。他的死意味著明鄭政權的頂梁柱塌了。大廈將傾，不可避免。
康熙二十年（1681年）正月二十八日，鄭經閉上了疲勞的眼睛。他的死因，有的說是中風，也有的說是腸梗阻。他走得還是很心安的。因為就在病重期間，長子鄭克臧衣不解帶，陪侍身邊。望著這個剛勇仁孝的兒子，後繼有人的喜悅令他很欣慰。臨終之前，鄭經專程把劉國軒叫到跟前，將跟隨自己一生的佩劍連同兒子都托付給了他，勉勵他輔佐幼主，抗清複明。然而他沒有想到，劉國軒辜負了他的希望。他寄托厚望的兒子，更是沒過多久便隨他而去。
就在鄭經過世後的第三天，即當年正月三十日，鄭經的四個弟弟，即鄭聰、鄭明、鄭仁、鄭柔，集體覲見董酉姑，大說鄭克臧的壞話。主要是說鄭克臧欺壓眾位叔叔，侵奪宗室財產。董酉姑雖然不待見鄭克臧，但也不敢輕信。董酉姑說，要不把鄭克臧叫來問問吧。馮錫範等的就是這句話。以董酉姑的名義，馮錫範召鄭克臧覲見。祖母召見，鄭克臧哪敢有疑，連忙進了董太夫人府。熟料他前腳剛進門，身後保護他的親兵毛洪、沈城就被擋在門外，接著馮錫範的親信蔡添迎麵衝來，伸手就是一刀，直刺入鄭克臧腹部。明白中計的鄭克臧忍痛瘋跑，還想著趕快脫身，可已經來不及了。他的四個叔叔手持大棒圍了過來，如狼似虎地把他圍住痛打。這位被鄭經寄予厚望的接班人，就這樣被活活打死。當董酉姑明白鄭克臧被害後，一切都已經晚了。隨後，馮錫範等人迅速解除了董府的武裝，董酉姑本人也被軟禁。台灣的大權落在了馮錫範手中。這場造成明鄭政權劇烈內耗的爭鬥，史稱“東寧之變”。
東寧之變後，明鄭政權的上層展開了一場大清洗。諸多曾是鄭克臧近臣的官員或被殺或被罷。先後發生了“沈瑞事件”等大案。陳永華嫁給鄭克臧的女兒自殺殉夫，侄兒陳繩武被撤職，台灣島上一片血雨腥風。為了遮人耳目，馮錫範發布文書，曆數鄭克臧罪惡，但畢竟是騙不了人的，結果“民心軍心盡喪”。但馮錫範不管這個，自己權力不喪才是最重要的。此後鄭克爽即位，馮錫範晉位忠誠伯，從此大權獨攬。董酉姑因痛惜長孫的被害，“日日啜泣鬱歎不已”，半年之後也撒手人寰。而在整個政變中“失語”的劉國軒，作為回報，被加封為“武平侯”，成為台灣軍界第一人。此後他離開東寧，趕赴台灣海防要塞澎湖，在當地抽傭調丁，擴充軍力，將澎湖守軍增加到了兩萬人，並且在極短的時間內修築起了堅固要塞，史載“星羅棋布，堅如鐵桶”。算是躲開是非做了點兒實在事。相比之下，大權獨攬的馮錫範就不幹正事了。比起陳永華的執法嚴明，他反其道而行之，帶頭圈占土地，並提高賦稅，盤剝商旅，更將製糖、販鹽等重利行業收歸自己名下，謀取暴利。台灣島從他當權後，連年物價暴漲，僅大米的價格，兩年裏就上漲了八倍多。陳永華一生嘔心瀝血、振興台灣的努力，幾乎被他敗壞殆盡。
眼見台灣島的經濟狀況越發惡化，馮錫範也無可奈何。他搞陰謀是好手，搞建設就是白癡了，因此他也就幹出了更白癡的事，竟然連年組織船隊到大陸打劫，結果自然損兵折將。不滿他統治的兵將們更紛紛向清王朝投誠。危急局勢下，馮錫範索性破罐子破摔，他勒令台灣全島廣修堡壘，家家出人丁入伍，把小小的台灣島，修成了碉堡林立的鐵桶陣。這更鬧得百姓怨聲載道，民變不斷。
台灣的“利好”消息，主要是通過福建總督姚啟聖傳來的。作為長期主持平台大計的封疆大吏，姚啟聖費盡心思。他的情報站做得很好，在台灣各處都安插有他的眼線。明鄭政權的一舉一動，清王朝都能及時得到消息。因此，麵對大好機會，清王朝自然開始了部署。除了施琅就任福建水師提督外，清政府更下令，命令全國各地的大型戰船盡數集結在福建沿海，用於給養輸送。同時，給予施琅絕對的信任。康熙本人在給施琅的詔書裏就說得很明白：陸地作戰，我也許還能部署。海上作戰，確實是你的專長，所以你可以便宜行事，不必事事奏報。
即使形勢一片大好，但清王朝反對“征台”的聲音依然很大。當時大多數大臣都認為遠洋作戰，勝負不可預測，不如不打。更有人荒唐地說什麼“以靜製動”。就在“東寧事變”發生的前後，北京上空突現彗星。這在古代屬於不吉祥的“掃把星”，這下可又給了反對派口實。以“天變”為名，戶部尚書梁清標又上書反對。重壓之下，康熙不為所動。偏偏這時候的施琅，又幹了一件“犯忌諱”的事。他於康熙二十二年（1683年）一月，上了著名的《秘陳專征疏》，要求朝廷給予他“專征”的大權，不受任何人節製。這下可引起了軒然大波。在高度專製的清王朝，又是漢臣，還是個“叛將”，提這樣的要求，和謀反也沒什麼兩樣了。而且施琅此舉，不但得罪了“反戰派”，連本與他一個陣營的福建總督姚啟聖也得罪了。姚啟聖這個人，後半輩子做的最主要的事情，就是謀劃平定台灣，包括情報搜集、物資準備、操練兵馬，樣樣都貢獻頗多。他時常對人說自己的人生理想，就是有朝一日能夠親自提兵東進，平定台灣島。沒想到大戰未開，理想先讓施琅斷了。
但施琅並非有意和姚啟聖過不去。姚啟聖是個能臣，但並非樣樣都能。打仗是一個需要獨斷專行的活兒，到時候兩個領導全去，大軍聽誰的？而且在進軍方略上，施琅和姚啟聖更是分歧嚴重。姚啟聖主張乘東北風進軍，但施琅的主張卻是南風。這就涉及了地理學問題。如果乘東北風進軍，就需要在十月出兵；如果乘南風，則需要在夏季出兵。在姚啟聖等人看來，南風風力微弱，船隻行進緩慢，根本不利於海上作戰。兩人各執一詞，爭吵了多次，最後實在爭吵累了，就奏請皇帝裁奪。
對於康熙來說，這些征討台灣前的風波，可以說樣樣都是兵家大忌。朝臣眾口一聲地反對，老天爺也出“凶兆”，寄予厚望的前線統帥還沒開打就先掐了起來。
但康熙收複台灣的決心是異常堅定的。在經過了反複權衡，並征求了大學士明珠等人的意見後，康熙做出了他的選擇：同意施琅的要求，將軍事指揮權完全交給他。要什麼給什麼，隻要你能做到一件事——收複台灣！
平台大業，從此進入了“施琅時間”。事實證明，康熙帝的選擇是對的。
乘南風還是乘東北風，表麵看來沒區別，其實卻區別極大。東北風猛，南風柔和。海洋作戰，如果乘東北風，則船速迅猛，衝擊劇烈。艦船對陣，風向選得對，就可事半功倍。
但施琅卻偏偏選擇了南風，原因很簡單：平定台灣，表麵上看是要打海戰，但實際上是要打攻堅戰，勝利的關鍵不是摧毀明鄭政權的水師，而是他們密密麻麻的堡壘，尤其是他們在澎湖苦心經營的防線。
所以南風才是最好的選擇。因為東北風劇烈，船隊很容易被吹散，到時候就成了人家的活靶子了。南風平穩，即使攻堅受挫，也能夠從容布置，穩健攻擊。所以南風才是最好的選擇。
平台的路線圖也早早確定了下來。此時的台灣島，就像一隻蜷縮成一團的刺蝟，等著紮你個鮮血淋漓。要吃掉他，就要拔刺。刺的名字，叫澎湖。
康熙二十二年（1683年）五月，福建總督姚啟聖奏報，攻台戰役一切準備已經就緒。康熙隨即下詔，命令全軍枕戈待旦，相機出征。六月，堅持南風進兵的施琅終於等到了他盼望已久的風信。乘著烈烈南風，兩萬清軍，六百三十艘戰船，在施琅的率領下誓師出征。他們誓師的地點，就是當年鄭氏水師曾經的光榮之地——銅山。五十七年前，草創時期的鄭氏水師第一次在這裏浴血奮戰，重創荷蘭，從此開始了爭霸海洋之路。
五十七年後，在六十三歲的施琅的率領下，這支大多由當年鄭氏水師後人組成的艦隊，跨海東征，去完成一項比前輩們更偉大的使命：結束海峽兩岸長達五十九年的分裂，收複台灣。
這支水師的將領，大多數都是鄭氏家將的後裔。比如在之後戰鬥中建功頗多的陳蟒、董義等人，其父輩都是鄭氏水師的幹將。從裝備上說，這支水師更可以算是中國曆史上空前強大的艦隊，其戰船同樣仿製歐洲戰艦，火力強大。其中由施琅親自坐鎮的大型炮船艦隊，擁有炮船五十六艘，每艘炮船的載炮都在五十門以上。這是一場誌在必得的跨海東征。
六月十五日，艦隊兵臨澎湖南大門八丈島，明鄭水師的巡邏船，很快發現了他們。劉國軒聞訊後大驚，命令澎湖列島全線戒備。當時宣毅總兵左鎮建議主動出擊，乘清軍立足未穩時發動進攻。這時清軍的大部分尚在後麵，如果此時出擊，尚有獲勝機會。黃昏時分，明鄭將領丘輝又意圖趁夜夜襲。但如上建議，皆被統帥劉國軒拒絕。這位一生戰功卓著的名將，此時的表現，卻像極了春秋時代的宋襄公，同樣，也將付出宋襄公的代價。
六月十六日，清軍第一輪攻擊開始。清晨時分，施琅發動攻擊。雙方在澎湖海麵惡戰，清軍出師不利，被劉國軒依托海島炮台猛轟加以側翼合圍，險些被包了餃子。危急時刻施琅親督戰船反撲敵陣，與興化鎮吳英前後夾擊，總算突出重圍，是役清軍傷亡慘重，陣亡兩千多人。連施琅本人也眼睛負傷。之後至二十一日，雙方在澎湖列島相互衝殺，互有勝負。犬牙交錯的態勢一直在持續。局勢的發展，越發對施琅不利。事實證明，以劉國軒在澎湖的苦心經營，壁壘縱橫，清軍欲突破澎湖，卻是何其難，一旦局麵膠著，等著台灣本島援軍到來，施琅的攻台大軍，很可能會陷入腹背受敵的絕境。
所以在二十一日戰罷後，當時清軍中，已經出現了暫且退兵的聲音。畢竟此時損失尚不大，同時台灣本島的援軍也勢必正火速增援，暫且退兵等待戰機，也許是最好的選擇。但施琅不為所動，更頒下嚴令：退兵者斬！他一生的理想、信念，皆維係在這慘烈的一戰上，更何況他堅信，他的判斷不會錯，苦苦等待的戰機，就在眼前了。
二十二日，戰機到來。
是日清晨開始，平靜的澎湖海麵忽然狂風大作，施琅的判斷是對的：西南風來了。激動的施琅火速布置，清軍兵分四路，施琅親自率領五十六艘巨型炮船，攻打劉國軒的主陣地娘宮廟。總兵陳莽率領五十艘戰船，從側翼攻打基隆嶼，牽製劉國軒的防禦。董毅率領的西路軍登陸牛心灣，夾擊西路明鄭軍隊。其餘戰船跟在施琅身後，作為後援。呼嘯的西南風，果然成了清軍進攻的助推，乘著風勢，清軍奮勇衝殺，一舉突破劉國軒的主陣地。關鍵時刻，劉國軒卻做出了錯誤的判斷：他本來有堡壘優勢，穩固防守是上策，但此時他卻一反常態，率領水師主動出擊，和施琅殺成一團。當然他也是有信心的，他率領的，正是從鄭經時代開始就揚威東亞海洋的王牌戰船——鳥船。這種載炮上百，擁有三千斤巨炮的巨無霸，火力遠遠強於清軍主力戰船。在劉國軒看來，施琅選擇攻擊，其實是一種“自殺式”打法，以明鄭水師優勢的配備，完全可以將清軍聚殲。