在分析期相等的前提下，互斥多方案之間具備較好的可比性，由於互斥方案的比選是多選一的過程，方案收益水平的高低就成為多方案經濟性比選的基本因素。用於該類型方案比選的方法歸納起來主要有三種：價值性評判指標的直接比選法、增量方案比選法和最小費用法。
1.價值性評判指標的直接比選法
價值性評判指標的直接比選法是指多方案在依據價值性評判指標如淨現值或淨年值進行排序，從中選擇出指標值最大的方案為最優方案的方法。由於淨現值或淨年值小於零的方案在經濟上是不可行的，讓它們參與經濟比較沒有意義。所以，用價值性評判指標比較互斥方案，首先可將淨現值或淨年值小於零的方案排除後再比較其餘的方案。下麵用例子說明。
【例4.3】某企業關於一地塊的開發共提出了三個互斥方案A、B和C，基準收益率為10%，試對各方案交付運營後的現金流數據進行方案比選。
方案初始投資年淨現金流入分析期/年A500050020B8000110020C12000160020解：對該題分別應用淨現值和淨年值指標進行比選：
（1）淨現值法NPVA=-5000+500×（P/A，10%，20）=-743.20（萬元）NPVB=-8000+1100×（P/A，10%，20）=1364.92（萬元）NPVC=-12000+1600×（P/A，10%，20）=1621.70（萬元）由於A方案的淨現值為負，故將A方案排除。其他兩個方案中，NPVC>NPVB，方案C被選定為最優方案。
(2)淨年值法NAVA=-5000×（A/P，10%，20）+500=-87.50（萬元）NAVB=-8000×（A/P，10%，20）+1100=160.00（萬元）NAVC=-12000×（A/P，10%，20）+1600=190.00（萬元）依據淨年值最大的方案為最優方案的原則，方案C為最優方案，淨年值法與淨現值法得出的結論是一致的。
這裏要注意的是，效率型指標和時間型指標在多方案的經濟性比選中是不能直接應用的，但作為輔助性指標，效率型指標在直觀反映方案收益水平以及時間型指標在反映方案收益能力和風險上各有用處。例4.3的計算結果中，A方案為經濟不可行方案已排除。
方案初始投資年淨現金流入淨現值內部收益率(%)B800011001364.9212.63C1200016001621.7011.93B、C方案的NPV函數圖