藍藻是原核生物，又叫藍綠藻、藍細菌。大多數藍藻的細胞壁外麵有膠質衣，因此又叫黏藻。在所有藻類生物中，藍藻是最簡單、最原始的一種。藍藻是單細胞生物，沒有細胞核，但細胞中央含有核物質，通常呈顆粒狀或網狀，染色質和色素均勻地分布在細胞質中。
該核物質沒有核膜和核仁，但具有核的功能，故稱其為原核（或擬核）。在藍藻中還有一種環狀DNA-質粒，在基因工程中擔當了運載體的作用。和細菌一樣，藍藻屬於“原核生物”，它和具原核的細菌等一起，單立為原核生物界。所有的藍藻都含有一種特殊的藍色色素，藍藻就是因此得名。但是藍藻也不全是藍色的，不同的藍藻含有一些不同的色素，有的含葉綠素，有的含有藍藻葉黃素，有的含有胡蘿卜素，有的含有藍藻藻藍素，也有的含有藍藻藻紅素。紅海就是由於水中含有大量藻紅素的藍藻，使海水呈現出紅色。
藍藻細胞模式圖藍藻不具葉綠體、線粒體、高爾基體、中心體、內質網和液泡等細胞器，含葉綠素a，無葉綠素b，含數種葉黃素和胡蘿卜素，還含有藻膽素（是藻紅素、藻藍素和別藻藍素的總稱）。
藍藻的繁殖方式有兩類：①營養繁殖，包括細胞直接分裂（裂殖）、群體破裂和絲狀體產生藻殖段等幾種方法；②某些藍藻可產生內生孢子或外生孢子等，以進行無性生殖。目前尚未發現藍藻有真正的有性生殖。
藻毒素具有水溶性和耐熱性。易溶於水，甲醇或丙酮，不揮發，抗pH值變化。MC-LR的分子式為C_49H_74N_10O_12，平均分子量為995.2（計算時往往按1000計）。它是一種肝毒素，這種毒素是肝癌的強烈促癌劑。藍藻等藻類是鰱魚的食物，可以通過投放此類魚苗來治理藻類，防止藻類暴發。
知識點
線粒體
線粒體是人類於1850年發現，並於1898年命名。線粒體由兩層膜包被，外膜平滑，內膜向內折疊形成脊，兩層膜之間有腔，線粒體中央是基質。基質內含有與三羧酸循環所需的全部酶類，內膜上具有呼吸鏈酶係及ATP酶複合體。線粒體能為細胞的生命活動提供場所，是細胞內氧化磷酸化和形成ATP的主要場所，有細胞“動力工廠”（power plant）之稱。另外，線粒體有自身的DNA和遺傳體係，但線粒體基因組的基因數量有限，因此，線粒體隻是一種半自主性的細胞器。
延伸閱讀
藍藻的主要危害
在一些營養豐富的水體中，有些藍藻常於夏季大量繁殖，並在水麵形成一層藍綠色而有腥臭味的浮沫，稱為“水華”，大規模的藍藻暴發，被稱為“綠潮”（和海洋發生的赤潮對應）。綠潮引起水質惡化，嚴重時耗盡水中氧氣而造成魚類的死亡。更為嚴重的是，藍藻中有些種類（如微囊藻）還會產生毒素（簡稱MC），大約50%的綠潮中含有大量MC。MC除了直接對魚類、人畜產生毒害之外，也是肝癌的重要誘因。MC耐熱，不易被沸水分解，但可被活性碳吸收，所以可以用活性碳淨水器對被汙染水源進行淨化。
藍藻等藻類是鰱魚的食物，可以通過投放此類魚苗來治理藻類，防止藻類暴發。