左宗棠督軍入浙時，耆齡已經在福建督辦軍務，但朝旨卻把浙江劃歸曾國藩節製，左宗棠與他並無統屬關係。耆齡得授閩浙總督後，浙江已不再由曾國藩節製，自然重歸閩浙總督管轄。耆齡要參左宗棠，受官文挑唆隻是原因之一，還有另一層原因：朝廷幾次下旨命左宗棠調派兵勇援閩，左宗棠卻反複搪塞，根本不派一兵一卒，隻是一心經營浙事。耆齡是無論如何都咽不下這口氣的。
按他自己的話說，像左宗棠這種目空一切又自以為是的人，不狠狠參他一本，天理都難容。耆齡在參奏左宗棠不久，又暗上一本，密保正在江寧圍剿的吉字營統領江蘇布政使曾國荃出任浙江巡撫。
耆齡這麼做也是官文給出的主意。官文函告耆齡說：“保舉曾老九出任浙撫，使天下人相信，參奏左宗棠非耆九峰本意，實乃曾滌生指使也。無非是為江寧克複後，為胞弟謀一封疆缺分。”
官文老謀深算，此舉真正叫做惡毒，無非是想讓漢員之間相猜，最後再發展成相鬥，滿人才好從中取利。
心性率直的左宗棠怎麼能不被氣病呢？
幕後黑手
恭親王接到耆齡的第二篇折子後，當即對著幾位大軍機說道：“耆九峰這件事做的卻是有些過了。左宗棠隻是革職留任，以後怎麼樣還不知道，他怎麼就開始舉薦起浙撫的人選了呢？左宗棠到浙江後征剿還算得力，盡管他對援閩一事延誤不辦，也有他自家難處。他無非是想把浙省的事全部辦妥帖後，再全力去辦閩事。耆齡參他剿賊不能殲除也是有的，但把閩省的局麵變壞全推在他一人的身上，也是錯的，他耆齡自己也有錯處。本王以為，耆齡舉薦曾國荃出任浙撫的這個折子，還不能往上遞，先壓一壓，看看事情的進展再定。”
幾位大軍機互相看了看，誰也沒有言語，但每人心裏卻明鏡似的：耆齡的折子，軍機處想壓，怕是壓不住的。
軍機大臣此時是文祥、寶鋆、李棠階、曹毓瑛，連同領班大臣恭親王，共是五位。在五位軍機大臣中，寶鋆、文祥是滿員，二人唯恭親王是聽；李棠階、曹毓瑛是漢員，這也沒的話說。但軍機章京就有十幾位，其中就有醇親王奕譞和慈禧太後安插的眼線，還有一些人和各地督撫走得較近。軍機大臣李棠階一直就和兩江總督曾國藩來往密切，軍機章京潘祖蔭不僅和曾國藩有來往，他與湘係的所有人都有來往。每逢有外地奏折進京，到的第一站便是軍機處，而軍機處負責拆閱折子的並非軍機大臣們，而是一些辦事的章京，最後才能到恭親王的手上。無關緊要的折子，恭親王一般並不往宮裏遞，而是在早朝或者什麼時間，對著太後隨口說上一句也就是了，沒有人計較這些。但每逢有重大的折子進京，恭親王想壓卻壓不住。慈禧太後不是在早朝，就是別的什麼空閑時間裏，向恭親王或其他的軍機大臣問起這事，往往又都是陰著臉子，口裏講出的話也特別刺耳：“折子不遞進來，想怎麼著啊？皇上小，不懂事，總不濟我們也不懂事吧？”恭親王往往都很被動。這次也不例外。
慈禧太後先不發作，她先去見東太後慈安。慈安是滿洲鑲黃旗人，鈕祜祿氏，廣西右江道穆揚阿之女。鹹豐未即帝位時即娶其為妻，登基後，晉孝慈皇貴妃，鹹豐二年（公元1852年）立為皇後。同治帝即位，尊為皇太後，徽號慈安，與西太後慈禧共同垂簾聽政。慈安懦弱，不懂國事，名義上是共同聽政，其實權盡操於慈禧之手。
慈禧太後見了慈安太後，依禮先給慈安請了個安，口稱“姐姐”，然後才說道：“姐姐，我看這個小六子，是越來越不把我們姐妹當成個人了，他這是想幹什麼？”
慈安說道：“小六子就是那個脾氣，現在又是議政王。隨他怎麼折騰，隻要不亂了綱紀就行，我們哪，樂得清閑。”