2001年的9·11事件以後，“覺醒派謝赫”十分明確地譴責9·11爆炸事件。
曾經在反對西方的問題上持激進態度的“覺醒派謝赫”領導人薩法爾·哈瓦裏在2001年末發表一份“對溫麥的聲明”，他在聲明中批評聖戰分子的計謀。隨後，薩法爾·哈瓦裏寫了一封給美國布什總統的公開信，他在信中表達了準備與西方和平共處的願望，隻要西方“停止對穆斯林世界的攻擊”。2002年4月，許多“覺醒派謝赫”與沙特阿拉伯新興的“伊斯蘭-自由主義者”聯合簽署了一份重要的宣言，題為“我們怎樣才能共存”。他們反複重申人類生命的神聖，指責用武力的方式強迫實施宗教的統治，號召尊重他人。宣言強調，美國頻繁地幹預和控製穆斯林世界，是穆斯林憎恨西方的一個主要原因。宣言號召西方要認識到，“穆斯林世界的大多數伊斯蘭主義運動在本質上都是溫和的……我們承諾要與恐怖主義對抗。”這份宣言明確地以外部世界為目標，試圖解釋和澄清包括“覺醒的謝赫”在內的沙特社會普遍的溫和傾向和立場。這份改革宣言及其簽署人受到了激進的“薩拉菲-聖戰主義”傾向宗教人士的猛烈攻擊。他們發表許多聲明並出版一係列書籍，攻擊簽署該宣言的薩勒曼·阿烏達和薩法爾·哈瓦裏。其中最有代表性的是：阿裏·庫代爾發表的“複興亞伯拉罕的團體：一份對失敗主義的叛徒的回答”；納斯爾·法赫德發表的“譴責知識分子宣言所包含的錯誤”。聖戰主義傾向的網上論壇中很快就出現了大量文章，譴責薩勒曼·阿烏達和薩法爾·哈瓦裏的“失敗主義”。薩勒曼·阿烏達的網站“今天的伊斯蘭教”還被稱之為“今天的投降”。支持宣言的“覺醒派謝赫”薩勒曼·阿烏達和薩法爾·哈瓦裏迫於極大壓力，不得不簽署一份“解釋性的聲明”，推翻了宣言中的所有觀點和原則。這次事件是兩個新興的沙特民間宗教政治反對派“聖戰派”運動和“伊斯蘭-自由主義”運動的第一次衝突，他們是在爭奪沙特阿拉伯曆史上唯一合法的民間宗教政治反對派“覺醒派謝赫”的支持。“覺醒派謝赫”的“解釋性的聲明”在一定程度上表現出薩拉菲-聖戰主義者的勝利和伊斯蘭-自由主義者的失敗，同時也體現出薩拉菲-聖戰主義者巨大的社會動員能力。
伴隨著暴力性反對派活動在沙特阿拉伯的爆發，“覺醒派謝赫”發起了對“阿拉伯半島伊斯蘭改革運動”及其負責人的攻擊。他們認為是薩阿德·法吉赫及其組織的思想激勵了沙特阿拉伯極端主義勢力和激進傾向的反政府活動。“覺醒派謝赫”穆赫辛·阿瓦吉領導了對薩阿德·法吉赫個人的攻擊，他號召薩阿德·法吉赫懺悔並回歸祖國。2003年10月，薩阿德·法吉赫成功地在利雅得號召了一次要求尊重人權和釋放政治犯的遊行示威，並在2004年12月，從倫敦號召了幾次在沙特城市中的遊行示威。“覺醒派謝赫”發表聲明反對薩阿德·法吉赫的行動，指責這些遊行示威是“以國外為基地的想要破壞我們的安全和繁榮”的行為。“覺醒派謝赫”還采用沙特阿拉伯官方宗教政治勢力的觀點，指責這些遊行示威是不合法的政治行動。2005年1月，有41名謝赫簽署了一份聲明，指責“引起伊斯蘭內戰的行動”。
“覺醒派謝赫”的重要人物接受沙特政府的邀請，參與了2003年開始舉行的多次國民對話會議。“覺醒派謝赫”的首領薩勒曼·阿烏達受邀參加國民對話會議。政府試圖利用薩勒曼·阿烏達在沙特民間宗教政治勢力中的巨大聲望，來壓製宗教政治反對派對沙特政權的攻擊。2003年，一群什葉派活動家向王儲阿卜杜拉遞交一份請願書，要求更多的宗教自由、平等和合作。“覺醒派謝赫”主要人物薩法爾·哈瓦裏指責什葉派的要求，並且嚴厲地警告沙特政府：什葉派的要求是受到了錯誤的引導，也可能是受到國外勢力的支持來破壞沙特國家的統一，並且最終將導致沙特國家的分裂。2003年5月12日，利雅得僑民住宅區發生爆炸。隨後，“覺醒派謝赫”薩法爾·哈瓦裏和薩勒曼·阿烏達領導47名沙特宗教機構職員、教授和教界人士簽署了一份聲明，澄清他們本人以及他們的伊斯蘭激進主義與恐怖主義者沒有任何關係，同時還號召增進對話，反對利用炸彈來攻擊穆斯林和造成穆斯林之間的分裂。