遷都宣言發表後，政府機關往武漢（國民政府在此設有行營）、重慶的遷移進入了最後的高潮。到11月底，除了有任務必須留在南京的公職人員外，就是幾十萬想走但走不了或不想走的市民了。
剛一走馬上任，唐生智就開了個記者招待會，會上他說了兩條：奉命衛戍南京，至少兩點最有把握：一是與南京共存亡，不惜犧牲於首都；二是這種犧牲會使日軍付出巨大代價。此前他向蔣介石的表態是：“臨危不亂，臨難不苟。”
南京衛戍司令部名單已出爐：
司令長官唐生智；
副司令長官羅卓英、劉興（保定陸軍軍官學校2期，湖南衡陽人）；
參謀長周斕（保定陸軍軍官學校2期，湖南衡陽人）；
劉興、周斕既是唐的湖南老鄉，又是他的老部下，在人員安排上，該想到的，蔣也確實為唐想到了。蔣介石把宋希濂第36師、王敬久第87師、孫元良第88師都放在了南京。
蔣介石問：還需要哪些部隊？
唐生智說：教導總隊您還帶走麼？
蔣介石說：桂永清的教導總隊，何部長計劃派到湖南休整。
唐生智說：連第36、第87和第88師的戰鬥力都下降了一半，其他部隊就更不敢用了。
蔣介石說：我把教導總隊給你留下，也不叫俞濟時的74軍走了。首都的憲兵部隊和警察部隊都歸你指揮。你不要擔心兵力的問題，我會想辦法。
唐生智向他保證，將以最大的限度固守南京。那麼好，既然是固守，就需要重兵，於是蔣介石把周圍能調動的軍隊都調到了南京。葉肇第66軍、鄧龍光（保定陸軍軍官學校6期，廣東茂名人）第83軍來了，就連待在湖北的徐源泉（南京講武堂，湖北黃岡人）第2軍團也被命令星夜馳援南京。
此外還有炮兵第8、第10團之一營、戰車防禦炮部隊（8門）、戰車部隊（10輛），以及防空司令部所屬高炮部隊（27門）。
兵力很龐大，但整個衛戍司令部的人很少，參謀長周瀾（副參謀長佘念慈）之下，設了個參謀處，處長廖肯（黃埔軍校5期，湖南長沙人），處下麵就兩個科，一是譚道平的作戰科，再就是後勤通信科。
南京戰，對中國軍隊來說有兩道防線：外圍和城郭。
外圍防線從京蕪（蕪湖）路上的大勝關起，經牛首山、江寧鎮、淳化鎮、湯水鎮（湯山）到龍潭，呈弧線形；城郭防線則為南京城外的雨花台、紫金山、烏龍山、幕府山及南京城垣。防線有用鋼筋混凝土構築的永久性工事，包括碉堡、觀察哨、指揮所。上海開戰後，又拉上了鐵絲網，挖了交通壕和反坦克戰壕。此外，以烏龍山炮台等地為依托，封鎖通往南京的長江江麵。
先看一下城郭陣地的部署：
宋希濂第36師守挹江門、下關、幕府山等南京城北陣地，同時作為總預備隊使用。
桂永清教導總隊守紫金山等南京城東陣地；
孫元良第88師守中華門、雨花台等南京城南陣地；
蕭山令（保定陸軍軍官學校3期，湖南益陽人）的憲兵部隊和警察部隊守城中清涼山附近的陣地，維持城內秩序。
再看外圍陣地：
葉肇第66軍守淳化鎮至鳳牛山一線，向句容派出前進部隊；
俞濟時第74軍守淳化鎮至牛首山一線，向秣陵關、湖熟鎮派出前進部隊；
鄧龍光第83軍守鳳牛山附近經拜經台至龍潭一線，向下蜀派出前進部隊；
徐源泉第2軍團（12月8日到南京）守棲霞山、烏龍山、龍潭一線；
王敬久第87師（師長沈發藻，王擔任軍長，但軍下隻轄該師）守鎮江一線，後退至南京。
1937年11月22日，蔣介石攜夫人宋美齡巡視南京，此時日機剛剛飛走。轉天，蔣到常州前線鼓舞士氣，此時無錫至江陰一線處處激戰。
這時候，汪精衛已經走了，乘船去了武漢。他走前，國民政府拒絕了德國駐華大使陶德曼轉達的日本方麵提出的7個停火條件：
一、在華北五省建立非軍事區，任命****官員；二、內蒙古自治；三、擴大上海的非軍事區，由國際共管；四、中國停止所有排日抗日活動；五、中日共同防蘇防共；六、降低日本商品關稅；七、各國在華權利得到尊重。
癡人夢話。
南京戒嚴了。日軍從東、南、西三個方向合圍而來，南京隻剩下北麵下關江邊一個出口。
唐生智為表示與南京共存亡的決心，叫俞飛鵬把從南京下關到江北浦口和上遊武漢的大部分渡輪都開走，留下的一小部分輪渡和被收繳的民船，交給了宋希濂第36師看管，任何人沒衛戍司令部的命令不許動用。開始的時候，衛戍司令部自己也沒留船，不是沒留幾艘，而是一艘也沒留。從這個細節看，此時的唐生智確實作好死守的準備了。參謀長周斕覺得不妥，極力請求下，唐才同意由司令部單獨掌握一艘小火輪。
唐生智下令：如有誰敢擅自渡江逃退，宋希濂第36師和長江北岸的胡宗南第1軍可立即開槍正法。