李氏朝鮮(公元1392—1910年)取代王氏高麗之後，拋棄佛教，全力推行儒教尤其是朱子學，尊為唯一正統思想。李朝推行儒教的方式大體上與前朝相同，不過由於指導思想變為獨尊儒術，所以無論在哪一方麵都不遺餘力。李朝重科舉，文武兩班官員都通過考試錄用，文官的生員試、進士試、文科考試要考漢文和儒學自不必說，即使武官的考試也必須加試儒學。在學校教育方麵，除在首都設成均館(下置四個學堂)外，各府縣都設鄉校，與此同時尚有無數私人辦的書堂，全部以儒家經典為教學內容。統治者對培養忠孝節義的禮俗教育非常重視，除了印刷出版儒家經典外，還命學者編輯大量通俗讀物乃至畫冊，解釋經典，表彰忠臣孝子，以漢文、朝文出版，這些書有《孝行錄》、《三綱行實》、《三綱行實圖》等等，通過它們把忠孝觀念灌輸到千家萬戶，使婦孺皆知。經過長期教化，原有的尚武之風被改變，李氏朝鮮成為“崇尚信義，篤好儒術，禮讓成俗，柔謹為風”(《朝鮮誌·風俗》)的國家。李朝被稱作“儒教王朝”，儒學在這個時期達到鼎盛。
公元7世紀的日本列島上，皇權與代表氏族製度的舊貴族矛盾日益尖銳。為加強皇權，聖德太子於公元604年製定17條憲法，除第二條要求篤敬佛家三寶之外，其他各條皆為儒家信條，主要是忠、信、仁、禮。“國非二君，民無兩主，率土兆民，以王為主。”(第12條)“無忠於君，無仁於民，是大亂之本。”(第六條)“信是義本，……君臣共信，何事不成！”(第九條)“君臣有禮，位次不亂；百姓有禮，國家自治。”(第四條)646年孝德天皇在曾長期留華的對隋唐社會、政治、文化、思想均有深刻了解的日本大儒南淵請安等人幫助下實行“大化改新”，廢除了舊貴族私有部民製，按唐朝的榜樣，建立中央集權的專製政體，使日本成為以儒家思想為指導的大一統的封建國家。聖德太子執政後，特別是大化改新後，日本不斷向中國派遣使節——遣隋使、遣唐使，和大批留學生、學問僧，學習儒家經典，搜求儒家書籍。並在首都設大學寮，在地方設國學，推進漢文化主要是儒學教育。
越南也是中國的近鄰，自古以來就接受中國文化，儒家學說是其中重要組成部分。秦始皇開始設置郡縣，交趾郡在今越南北部；後來從兩漢到隋唐五代，越南作為中國郡縣達一千多年；儒家思想在中國行政官員倡導下，逐漸在越南生根，成為越南的傳統思想文化，對越南較早結束奴隸製、建立封建社會，起了重要的推動作用。東漢交趾、九真(兩郡均在越南)太守錫光、任延教當地人農耕和中國嫁娶禮俗。三國時代的士燮為交州太守，政績斐然，受越人擁戴。他接納中原逃往交州避難的士人，帶動他們向越人傳播詩書禮樂知識，影響深遠。另一方麵，也有不少越南讀書人到中原遊學、為官；到了唐代，通過科舉考試，在中原得功名任官職的越人就更多了。
1192年之後，日本進入幕府時代，天皇大權旁落，幕府將軍實行獨裁統治。將軍、大名、武士組成的等級製的武士地主階級，控製從中央到地方的各級政權和土地。他們的理論家適應當時的需要，取儒家的忠、勇、信、禮、義、廉、恥等觀念和佛家不念生死的思想，加工形成武士道德或武士道精神。由於儒家思想是武士道精神來源之一，所以繼續受到社會各界的重視。1603年德川將軍削平群雄，建立江戶幕府，處理全國政務，管轄全國領地。一個中央集權的實行等級身份製的封建國家正式形成。從這時到明治維新的200多年間，稱為江戶時期或德川時期。這是日本封建社會高度發展的時期，也是儒學高度發展的時期。這時在日本占統治地位的，不是原始儒學，也不是漢唐經學，而是朱熹的理學。
由於儒學、朱子學的傳播和濡染，朝鮮出現了一批具有較高水平的理學家。高麗王朝後期，朝鮮朱子學派的重要代表人物李穡、鄭夢周、鄭道傳等嚴厲批判佛教，指出它的靈魂不滅、定數輪回都是錯誤的，抨擊它在政治、道德等方麵給社會帶來的危害，為在意識形態領域結束佛教的統治、確立朱子學的正統地位做出了貢獻。李朝時期的理學家們把朱子學的研究推進一步。徐敬德繼承張載傳統，大講氣不滅和氣一元論。正統派代表、具有“海東朱子”之稱的李滉(退溪)堅持理一元論，以為“理為氣之帥，氣為理之卒”。在人性問題上，主張嚴格區分性情，認為四端(仁義禮智之端)是由天理發出的，七情(喜、怒、哀、樂、愛、惡、欲)是由氣發出的，應該讓七情服從四端。他的學生李珥(栗穀)既不同意乃師，也不同意徐敬德，主張理氣二元，二者不能分離。在性情問題上以四端雖為理發，但發出便有氣(情)隨之，七情雖為氣發，但發出便有理來駕馭，四端七情不能分離。引發了“四七理氣”的多年爭論。通過這場爭論，朱子學的研究更深入了，但也漸漸走向繁瑣和教條化。後來，為朝鮮的振興富強、民主科學而奮鬥的各個學派都拋棄了朱子學，進步學者們吸收諸家思想，建立了朝鮮的實學、北學、東學以及開化思想、啟蒙思想體係。1910年以後，日本帝國主義滅亡李朝，占領朝鮮，一度廢止尊孔讀經，後轉而利用儒教奴化朝鮮人民。正統儒家學者，曾利用儒教宣傳動員群眾抗日複國。第二次世界大戰後，朝鮮南北兩方，分別實行社會主義和資本主義製度，儒家思想不再是統治思想，僅作為傳統文化為人們所研究利用。