馮玉祥果真最先提出一個編遣準則：強壯者編，老弱者遣；有槍者編，無槍者遣；有訓練者編，無訓練者遣；有革命功績者編，無革命功績者遣。根據這一準則，提出了編遣方案：第一、第二集團軍各編１２個師，第三、第四集團軍各編８個師，其他不屬於各集團軍的部隊共編８個師。馮玉祥提出這一方案，也是經過反複斟酌，費了一番心計。本來，他認為自己的部隊兵員最多，素質最好，訓練最精，戰功最大，按照自己提出的編遣準則，應編的人數理當最多。但他又考慮到，這樣勢必使自己部隊應編人數超過第一集團軍，而很難得到蔣的支持。於是，他在方案中把第一、第二集團軍拉平，將第三、第四集團軍和其他雜色部隊壓低，以為這樣可以獲得蔣的支持，從而形成蔣馮團結、控製其他的局麵。
馮玉祥的想法隻是一廂情願，蔣介石的心裏卻是另有打算。蔣介石意在徹底剪除異己，絕不讓他人部隊多編，更不願馮的力量與己相等，表麵上對馮的方案未置可否，暗地裏卻鼓動別人提出抑製馮玉祥的方案。
蔣介石多次派人密訪閻錫山，由何應欽出麵將閻請到自己宅邸共餐與密商，向閻示意，在四個集團軍之外，應再增加一個中央區，希望閻能考慮一個方案提交會議，與馮的方案一起討論。蔣介石授意閻錫山另提方案，既可挑動馮閻的關係，又可將馮的力量壓下去，可謂一箭雙雕。
閻錫山老謀深算，一眼就看透了蔣介石抑馮的意圖。他雖然與蔣有矛盾，不滿於蔣的消滅異己政策，但是抑馮卻符合他的心願。馮軍離他的老巢山西較近，馮軍擴大對他是個直接威脅；他與馮之間既有爭奪平津地盤的新仇，又有南口大戰截擊國民軍的舊恨，馮的勢力發展，尤其是馮蔣合作，將會與他不利。閻錫山早就想離間馮蔣的關係，現在蔣有意抑馮，正是求之不得，於是，便按蔣的意圖提出了一個編遣方案：第一、第二集團軍各編１０個師，第三、第四集團軍各編８個師，其他部隊編６至８個師，另有６至８個師由中央處理。當時，馮軍人數最多，有四十多萬，蔣軍接近四十萬，李宗仁的桂軍約二十萬，閻軍不足二十萬。按照閻的方案，馮軍裁減最多，閻軍裁減最少，蔣軍雖也裁減一部分，但由中央處理的部隊歸蔣掌握，同時又增加了６至８個師，實際上有增無減。因此，閻的方案是一個抑製馮玉祥，擁護蔣介石和有利於自己的方案。
桂係的李宗仁、白崇禧與蔣的矛盾由來已久，隻因懼怕蔣馮團結而不敢公開反蔣，他們認為閻的方案可以離間蔣馮關係，於己有利，因而表示讚同。
本來，在軍隊編遣問題上，各派首領都有反蔣的意向。可是，經過蔣介石的拉攏和挑動，他們都轉移了目標，為了各自的利害而互相爭鬥起來。蔣介石的目的達到了，編遣會議便正式開場了。
１９２９年１月7日，全國編遣會議開幕，國民黨中央執監委員、各集團軍總司令和總指揮，共六十餘人參加了會議。
會議開始，全體與會者麵對孫中山像宣誓：
“敬以至誠，宣誓於總理靈前：委員等遵奉總理遺教，實行裁兵救國。對於本黨之一切決議，竭誠奉行，不敢存絲毫偏私、假借、欺飾、中輟之弊。如有違犯，願受本黨最嚴厲之處罰。謹誓。”