10月29日又通電惡毒攻擊《憲法草案》“顯違法理，陰加鼓煽，實為該黨破壞民國再接再厲之手段，與黃興等之謀逆構亂，一而二、二而一也。”嚎叫應“迅將國會解散，其國民黨之議員，並即驅逐回籍，交各省官司詳加察看。”
10月30日，《天壇憲法草案》全部殺青。次日，憲法起草委員會三讀通過，接著提交憲法會議。袁世凱遂決定攤牌，解散國民黨，搞垮國會，徹底解決問題。
11月4日早晨，在總統府擺設好了一個經過精心設計的圈套。總理熊希齡被約到總統府議事，熊希齡方到，即有外國公使來謁見袁世凱（這又是預先設計好的）。袁世凱先會見外賓，囑熊希齡暫入辦公室稍候。室內空無一人，熊希齡見袁世凱辦公桌上放著前司法總長許世英查報避暑山莊盜寶案卷，悄悄略加窺探，始知關係自身，麵色立變。
原來，熊希齡以前任熱河都統時，辦公、居住均在承德避暑山莊。該山莊是清廷的行宮，風景極其優美，皇帝每年都去避暑及行圍射獵。熊希齡在山莊居住時，曾派親信清點過莊內寶物，並慷國家之慨，將乾隆喜用的一把折扇送與袁世凱的親信薑桂題。薑桂題把所得古物轉交袁世凱，並做了密報。熊希齡以莊內寶物久經年所，恐前任經管人員有偷換之情事，亦曾向袁世凱請示運至北京統一保管，而袁世凱置不做答。
迨熊希齡奉命進京組閣後，袁世凱即派許世英查辦山莊失寶案。許世英明查暗訪，寫了一個報告呈交袁世凱。袁世凱抓住這個把柄，目的是一旦需要，即用以挾製熊希齡，今日恰是其時。
袁世凱會見完外賓，傳熊希齡到外室談話，見熊希齡神態有異，裝作極其“關切”地問道：“秉三，你昨晚別是因公忙沒有睡好覺吧？不然，為什麼麵色這樣不好看，精神很顯疲憊呢？”心虛情怯的熊希齡聞聽此言，忙謝過不迭。袁世凱隨即嚴詞厲聲地說：“國事不好向前推進，都因國民黨凡事故意刁難掣肘，真令人痛心！我國現在是責任內閣製，如不將國民黨這個障礙鏟除，內閣既不能順利執行職責，總統的權力也就不能行使了。根據目前形勢，我們要把國家治好，非立即解散國民黨、取消國民黨籍的議員資格不可。我的意見如此，秉三，你看怎樣？”
熊希齡處此威脅情勢之下，恐懼萬分，再也不敢說什麼，隻好俯首聽命。袁世凱見熊希齡無異言，即將準備好的解散國民黨的命令擺出，命熊希齡簽署。熊希齡簽畢，袁世凱立刻傳令在鄰室等候的內務總長朱啟鈐進來簽署。
接著，袁世凱下達了解散國民黨、取消國民黨議員資格的命令。命令宣稱：“此次內戰，該國民黨本部與該國民黨國會議員潛相搆煽”，“但知亂以便其私，早已置國家危亡、國民痛苦於度外，亂國殘民，於斯為極。”特飭令迅將國民黨京師本部立予解散；並令各地將國民黨所設機關，不論支部、分部、交通部及其他名稱，於三天內一律解散。“嗣後再有以國民黨名義發布印刷物品、公開演說或秘密集會者，均屬亂黨，應即一體拿辦，毋稍寬縱！”至於國民黨議員，“陽竊建設國家之高位，陰預傾覆國家之亂謀”，實已喪失議員資格。因此，自江西湖口地方倡亂之日起，凡國民黨議員，一律追繳議員證書、徽章。所缺議員名額，由內務總長速令各省分別查取本屆合法之參議院、眾議院議員候補當選人，如額遞補。
同日又向全國申告解散國民黨之理由說：“國民黨之所謂黨略，大率借改革政治之名，行攘奪權利之實。凡可以逞其野心者，雖滅國亡種、茶毒生靈，亦所不惜。……該黨標其名曰國民，而專以殘民為事，與民意違反，……陰謀詭計層出不窮，秘密機關逐經發現。本大總統何能寬容少數亂徒，置四萬萬人利害於不顧？不得已，始有解散該黨之令。”由於國民黨議員“曲庇作亂之逆黨”，“不知有國家，隻知有本黨；不知有團體，隻知有個人”，也隻能將其議員資格取消。
當天下午，如狼似虎的軍警撲向國民黨本部，連續搜查四小時之久，該黨黨員名冊、重要文件和檔案材料全部被收繳而去。同時大批巡警分頭闖到國民黨議員家裏，追繳證書、徽章，三百五十多名議員被取消了議員資格。袁世凱收繳的目的，並非如他所宣稱的是什麼“鞏固真正之共和，宣達真正之民意”，和“刷新共和之政治，俾我國民鹹享幸福”，而是為了解散國會，破壞共陽，殘民以逞。
他又計算了一下所餘兩院議員仍足法定人數，仍可繼續開會，便不顧所發命令中的時間限製，又命軍警追繳江西湖口起義前已脫離國民黨籍和跨黨的八十多名議員的證書、徽章。兩次總共非法追繳438位議員，占兩院議員總數的半數以上。
11月5日，參眾兩院開會，袁世凱派軍警緊緊把守門口，手持名單，逐一盤查，不準撤銷議員資格者人內。國會因不足法定人數不能開議而名存實亡。
憲法起草委員會由於二十多名國民黨議員被取消資格，加上數人辭職，無從開議而宣告解散。它的解散，標誌著《天壇憲法草案》已流產。袁世凱成為勝利者，用不著再為憲法問題大傷其腦筋了。
進步黨人對解散國民黨開始是拍手稱快、幸災樂禍的，以為從此國會便成了自己的天下；及至看到國會已不能繼續召開，才發覺袁世凱“醉翁之意不在酒”。
進步黨人前此由於袁世凱的真實麵目尚未徹底暴露，曾錯誤地依附袁世凱，同國民黨進行鬥爭，但他們中的絕大多數在辛亥革命以後已由原來的君主立憲立場逐漸轉變到民主立憲立場。現在發現袁世凱陰謀消滅國會、破壞民主政治，投入到反對袁世凱專製獨裁鬥爭行列的人更多了。為維持國會，他們考慮了兩個補救的步驟：第一步，恢複部分被迫繳證書、徽章的議員資格；如此著不行，再進行第二步，從候補當選人中遞補，以足法定人數。
11月7日，剩餘議員開會，議定由參眾兩院議長王家襄、物化龍出麵見袁世凱，談維持國會問題。其辦法是：湖口之役前已聲明脫離國民黨者，恢複其議員資格；確有證據證明反對江西起義者，恢複其議員資格；加入他黨者，不以國民黨議員看待。湯化龍見“國會一旦頓僵槁”，“痛之極，爭之切”，對袁世凱講：“議員罪應黜否在法，總統得黜議員否，事須別論，要不能藉口仆國會，無國會非立憲也。今憲法尚未成，即國會竟寐罷，公將何以外民國？”張謇、梁啟超也分別向袁世凱陳述了意見。袁世凱解散國會惟恐不速，何能再去補救？可是又無法公開表示，就把這個難題推給熊希齡去解決。果然，熊希齡以調查困難為借口予以否定了。
按照11月4日的命令，如果真的讓候補議員遞補，恢複國會的正常活動並不困難。但“遞補”雲雲純係欺人之談。為徹底破壞國會，11月12日，袁世凱一麵讓國務院電令各省迅即查明自湖口之役起籍隸國民黨的省議員，追繳證書、徽章，取消議員資格；一麵讓內務總長朱啟鈴出麵電告各省，遞補從緩，俟中央籌定劃一辦法再行舉辦。根本不打算遞補。進步黨恢複國會的第二步計劃又無法實現了。
11月13日，王家襄、湯化龍不得不通告在京議員，由於不足法定人數，無法開議，從14日起，議院暫行停發議事日程。
議員們不甘心國會被袁世凱消滅，起而與之鬥爭。17日，眾議院議員一百九十多人向政府提出《質問追繳國民黨議員證書徽章院章影響及於國會書》，指出：“議員資格之疑義，其審查權屬之兩院，《院法》規定，彰彰可證。今政府以隸籍國民黨之議員，早不以法律上合格之議員自居為理由，豈非以政府而審查議員資格，侵害國會法定之權限乎？至於追繳證書、徽章，直以命令取消議員，細按《約法》，大總統無此特權，不識政府毅然出此，根據何種法律？”
又說：在取消資格的議員中，“有已早脫該黨黨籍，改入他黨，或素稱穩健，曾通電反對贛亂者，亦一同取消。政府確為懲治內亂嫌疑耶，則應檢查證據，分別提交法院審判，不得以概括辦法，良莠不分，致令國會人數不足，使不蒙解散之名而受解散之實也。”