天亮後，旗城周圍爆發了激戰。杭州將軍德濟指揮八旗駐屯軍，憑借之前配備的強大火力，負隅頑抗。城內槍炮聲隆隆不絕，驚得立憲派跑到旗城中，勸說德濟放下武器，顧全大局。德濟不答應，甩開膀子和起義軍大打起來，堅持到下午八旗子弟不敵，落入劣勢。參領貴林等人逼德濟投降，起義軍又答應隻要八旗駐屯軍繳械投降，保證旗民的生命財產安全，德濟這才下令投降。杭州全城光複。
接著，寧波、溫州、嘉興、紹興等地相繼光複。起義軍和立憲派推舉原諮議局議長湯壽潛為都督，成立軍政府。蔣介石等“苗正根紅”、浴血奮戰的革命者遭到排擠。蔣介石返回上海，好在陳其美對這個小兄弟很看好，提拔他當了滬軍團長。秋瑾餘部王金發因為湯壽潛與秋瑾被殺事件有關，反對湯壽潛任都督，但是王金發身上的綠林色彩過於濃厚，意見不被采納，最後被排擠回紹興，會黨分子也沒進入新政權。起義者流血犧牲，最終政權還是為原來社會中的強勢群體所占據。軍政府成立後，鑒於增韞、德濟為官尚可，並無大惡（增韞還曾違背聖旨，沒有鏟平秋瑾墳墓，而是暗中通知家屬遷走），把他們禮送出境。
上海、杭州相繼光複，蘇州的江蘇巡撫程德全的處境就危險了。尤其是上海光複後，蘇州失去了進出口的商埠和軍火供應地，官民人心動搖。從11月3日起，蘇州的紳商、立憲派和革命分子就包圍了程德全，勸說他反正。程德全和增韞一樣，猶猶豫豫，不說獨立也不說頑抗到底。拖延到4日晚上，蘇州城內的新軍、革命黨人等不及了，發動了起義，很快就占領了蘇州城。第二天一早，起義軍衝進巡撫衙門，逼出程德全。事到如今，起義軍也希望程德全能夠宣布獨立。程德全表態：“值此無可奈何之際，此舉未始不讚成。”為了表示順應革命，程德全叫人用大竹竿將巡撫衙門大堂屋簷上的瓦片挑去幾片。瓦片掉在地上摔成碎片。在清脆的破瓦聲中，清朝的江蘇巡撫衙門也就變成了革命後的軍政府。程德全比增韞幸運，在立憲派的支持下當上了江蘇都督。
至此，滬寧杭地區全部落入革命黨的掌握之中，從經濟和文化上動搖了清朝的根本。
東南光複，是同盟會和光複會共同努力的成果，雙方擁有各自的軍隊。同時，立憲派掌握著不少地區的政權。三方很快對滬寧杭三地的政權控製權展開了競爭。
三地中，上海的滬軍都督府最為重要。上海是當時中國最大的商埠、最繁榮的經濟重鎮，還是人口大市。光複後，陳其美利用在上海工商業群體中的龐大人脈，迅速擠掉李燮和，建立了清一色同盟會會員組成的都督府。李燮和被排擠到吳淞，索性另立了一個軍政分府，與陳其美對抗。雖說是分庭抗禮，但吳淞軍政分府完全不能與滬軍都督府相比，陳其美控製著豐裕的人力、物力和財力，將上海逐漸建設成同盟會堅固的堡壘。在辛亥革命期間，滬軍都督府向各地革命軍供應了大批軍火和相當數量的軍費，作出巨大的貢獻。軍政府多次召集大會號召各界助餉，黃興、陳其美、程德全等都曾親自登台動員。上海資本家紛紛認捐，並組織募捐團體，推動各行業助餉；文化界組織了宣講社、募餉團四處活動；京劇演員發起義演助餉；書畫界舉辦書畫助餉會，以墨潤助餉；清貧的文教界也不甘落後，學校師生踴躍捐款，同盟會控製的《民立報》館全體職工每月捐助薪金的五分之一資助革命。各地起義軍遇到後勤困難，都找滬軍都督府，向陳其美求助；南方獨立各省軍隊調動，都以上海為中轉樞紐和兵站。海外革命黨人也紛紛趕回上海，再奔赴各地革命。無形之中，武漢雖然是首義之地，但上海很快後者居上，成了事實上的革命中心。
因為上海為同盟會控製，也就意味著同盟會掌握著革命的事實中心。
上海行政上歸江蘇管轄，立憲派控製的江蘇軍政府試圖在行政上對滬軍都督府發號施令，進而控製上海。蘇州光複後，立憲派聯名上書滬軍都督府，借口“上海亦蘇省之一部分，若行政亦經分立，殊與全省統一有礙”，以行政統一為理由要陳其美拱手交出政權，交給程德全。陳其美在上海灘練就了一身精明，當然不會為冠冕堂皇的理由所誘惑。地盤，在亂世中永遠是最大的籌碼。陳其美對立憲派的建議不置一詞，將江蘇軍政府的指令一律置若罔聞。
立憲派於是咒罵陳其美是“無賴”，滬軍都督府經常受到掣肘。陳其美巋然不動，上海政權始終控製在同盟會手中。政權爭奪一直持續到臨時政府成立之後。陳其美的壓力越來越大，以退為進，三次呈請辭去都督，取消滬軍都督府。陳其美在呈文中揭露：“上海地處交通，人人得而求備，而地居下邑，事事為人阻撓……（江蘇）對於滬上各機關人員，委任非專，號令不便。管轄上既無統一之權，事實上乃有衝突之勢，牽製如此，無事可為。且凡百收入，均被各方麵爭之而去；凡百支出，均由各方麵諉之而來。縱係巧婦，無米難炊，雖極肝腦塗地之誠，豈能收戮力同心之效？”結果，滬軍將領、地方士紳聯名，分別電請孫中山任命陳其美為江蘇都督——既然他人一直借口上海是江蘇的一部分，那就幹脆任命陳其美為江蘇都督算了。有了上海方麵的強硬團結和孫中山的強力支持，陳其美屢次得到慰留。上海的特殊地位就此開端，最終從江蘇劃出成為一個獨立行政區域。
滬寧杭的獨立，是11月上旬的事情，可算是武昌起義後的第二波獨立浪潮。