由於竇憲正在涼州鎮守，和帝擔心一旦京城有變，他必然領兵叛亂。為了減少損失，保證事情成功，和帝下詔令竇憲來京輔政，先行把他調回來。等到竇憲回到京師，再抓捕他。事情著手的頭天晚上，和帝親自禦臨北宮，命令司徒兼衛官丁鴻，嚴兵守衛，緊閉城門；命令執金吾、五校尉等分頭捉拿郭氏父子和鄧氏兄弟，清除了有兵力的外圍勢力。次日，和帝派謁者仆射直入竇家，宣讀詔書，將竇憲的大將軍印綬收回，並限令竇憲與其弟竇固、竇景等各回封地。郭璜等人下獄處死，和帝因竇太後的養育之恩，沒有公開處死竇氏兄弟，等他們回到封地後才下令他們自殺。竇氏四兄弟中除竇環未參與謀反被免罪外，其餘全部斃命。
竇氏為維護專權，安插了大量黨羽，且竇氏家族權勢的貴盛造成了一些時臣趨炎附勢成風，因此朝廷上下多有附臣與親信。和帝執掌政權後，立即著手清理竇氏家族的餘黨。太尉宋由因為竇氏黨羽而被罷免後自殺，其他竇氏的親朋故舊，凡是依仗竇家的關係而做官的，全部遭貶官回家。
年僅14歲的和帝在這場奪權鬥爭中以勝利告終。整個過程幹淨利落，並沒有引起朝野的極大恐慌與混亂。由此可見和帝的機智、敏銳、幹練與穩重。在鏟除竇氏一黨的過程中，也免不了有一些挾私怨報私仇的現象發生，班固便是蒙冤而死的一位將軍。漢和帝後來知道了這些情況，便下詔譴責那些朝臣公報私仇的惡劣行徑，並將那些害死無辜之人的獄吏處死抵罪，充分表現了和帝處事公正、有錯必究的能力。
3.清明政治：以民為本，鞏固社稷
“民為邦本，本固邦寧”，國以民為本，民無信不立。民氣不順，那麼社會就難以穩定。解民憂、順民氣，國家才能走向和諧！
一舉掃平了外戚竇氏集團的勢力，和帝揚眉吐氣，開始親理政事。他非常勤懇，每天早早上朝，直到深夜仍然批閱奏章，可見他對自己皇權得之不易的珍惜。和帝親政以來從不荒怠政事，他的所作所為可以使他稱得上是一位英明之主。
永元九年（97年）竇太後死。由於宮廷緊守秘密，和帝為梁貴人所生的事實始終沒予公開。太後死後，梁家才敢奏明朝廷，為梁貴人討一個說法。和帝這才知道了自己的身世之謎，但在如何安置竇太後的問題上，和帝卻念及竇太後對自己的養育之恩，認為不應降黜，於是不降等號，諡為章德皇後。梁貴人被追封為皇太後。
和帝深感吏治建設對一個政權的重要性，因而非常重視官吏的選擇任用。據統計，和帝當政時期，曾四次專門下詔納賢。這不僅反映出東漢吏製的空虛與墮落，也表現出和帝為改變這種現狀而做出的積極努力。
和帝一朝，曾多次平定過少數民族的叛亂。西北有西域都護班超大破焉言，西域降附者五十餘國；東北有烏桓校尉任尚大破南單於，將遼東收歸，改為渤海郡。
和帝當政時期，曾多次下詔賑災救難、減免賦稅、安置流民，告誡臣下勿違農時。和帝在法製上也主張寬刑，他任用的掌管刑獄的廷尉陳寵運是一個富於同情心的仁愛之人，每次斷案，都依刑經而“務從和帝”，對有過失之人，也能根據情況從寬處理。和帝十分體恤民眾疾苦，多次詔令理冤獄，恤鰥寡，矜孤弱，薄賦斂，告誡上下官吏認真思考造成天災人禍的自身原因，而他也常常以此自責。如水元八年（96年）京城洛陽地區發生蝗災，他的憂民之心殷殷可見。嶺南（今廣東地區）出產龍眼、荔枝，為了滿足朝廷需要，往往“十裏一置，五裏一堠，晝夜傳送”，勞民傷財。唐羌上書，請求停止，和帝批示同意，愛民之意，發自肺腑。
從奪回政權到親理朝政，可以看出漢和帝是一個寬和仁愛的君主。
4.陰後鄧後：是非明辨，廢立後妃
作為一個英明的君主，明辨是非，甚為重要。是非應當明辨，這樣才能鞏固自己的皇權。
和帝明辨是非，當機立斷，在清除竇氏集團的鬥爭中，他做到了這一點；在其後的廢立後妃的事情上，這一點也表現得相當充分。