生物有機體，又稱為個體。除非是在實驗條件下，器官是不能脫離其母體而長期地單獨生存的。個體由器官組成，而個體卻是能在較長時期內單獨生存的最小單位。毫無疑問，個體是生物譜係中的基本結構層次之一。
盡管生物有機體大小差異甚大，但是，一棵樹，一隻鳥，一個人……看上去對個體的區分是輕而易舉的。實際上，由於克隆繁殖的存在給個體的界定帶來極大的困難。克隆就是用無性的方法得到的遺傳上完全一致的生物學單位，基因可以被克隆，細胞可以被克隆，有機體也可以被克隆。如果說哺乳動物的克隆在當今還是生命科學領域的一項引人注目的高新技術，那麼，在自然條件下高等植物中本來就較為普遍的存在克隆繁殖現象，正如一株草莓可以通過其匍匐莖繁殖出一株甚至數株新的草莓植株，一株百合可以通過其珠芽用無性的方式繁殖出多個新的百合植株，這類繁殖方式通常也稱為“營養繁殖”。
由於克隆繁殖的新的個體所攜帶的所有的基因與其母體是完全一致的，問題就是，到底應該將形態上相對獨立的單位看作是一個個體，還是應該將遺傳上一致的所有生物學單位都看作是一個個體？區分形態學的“個體”相對容易，但要真正識別每一個遺傳學上的個體卻是十分困難的事情。就像區分一株一株的百合相對容易，但如果把遺傳基因完全一致的單位全部看作一個個體，要確定哪些百合植株是由同一母株無性繁殖而來則要困難得多。