公元前104年，在他寫完最後一篇奏章後不久，他便因病去世，被葬於西漢時期京師長安的西郊。
有一次，漢武帝經過董仲舒的墓地，為了表彰董仲舒為漢王朝的效勞盡忠，表達自己的哀思，他特地下馬致意。因此，董仲舒的墓地又被稱為“下馬陵”。
董仲舒的影響董仲舒的一生，走過了75個春秋。從一位傑出的學者到皇帝的智囊，從當相治國到歸家著書立說，他主要是作為一名思想家度過其一生的。他的廉潔正直，刻苦鑽研的精神，得到了後人的讚美、推崇。
西漢時期稱他是超過伊尹、管仲、薑子牙的相國大材，東漢時期王充稱他是孔子的繼承人。此後司馬光、二程、朱熹等極力推崇他。元代把他請入“聖廟”受祭，明代封他為“先儒”，給他蓋上了“董子廟”。
他的哲學思想，有一些可取之處，在當時也有適應曆史發展的要求，他的神學是統一於他的哲學之中的。但他以神學為目的，甚至搞一些裝神弄鬼之事，實不足取，不過，這並不妨礙他作為一個偉大的思想家，促進了我國曆史的發展。
[旁注]
劉非 （公元前168年～公元前127年），漢景帝之子，母程姬。公元前155年立為汝南王。公元前154年，吳楚七國叛亂，他年15歲，有勇力。上書自請擊吳，被任為將軍，吳破，被封為江都王，治故吳王所屬之地。
主父偃 （？～公元前126年），漢武帝時大臣。漢武帝為了加強皇帝的專製權力，在宮中設立內朝，主父偃在內朝備武帝顧問。他認為應該加強中央政令的推行，因此向武帝建議，令諸侯得推恩分封子弟為侯，這樣王國自析，諸侯王的權力也隨之削弱。他的建議多被采納。
公孫弘 （公元前200年～公元前121年），西漢時期淄川國薛人。淄川國郡治在壽光南紀台鄉。他起身於鄉鄙之間，居然為相，直至今日，人們依然對他推崇備至。尤其他的“非學無以廣才，非誌無以成學”的精神，已成為曆史長卷中最醒目的一章，永垂後世。
膠西 漢代的郡國名。公元前201年置郡，漢文帝以後或為國，或為郡，漢景帝時為參加叛乩的七國之一。治所在高密，漢武帝以後轄境約當今山東膠河以西，高密以北地區。公元前73年改為高密國。
關中 又稱“渭河平原”、“關中平原”，地處陝西省中部。西起寶雞大散關，東至渭南潼關，南接秦嶺，北至陝北黃土高原。東西長300 千米，平均海拔約500米，西窄東寬，號稱“八百裏秦川”。這裏自古灌溉發達，盛產小麥、棉花等，是我國重要的商品糧產區。
範仲淹 （989年～1052年），北宋時期著名的政治家、思想家、軍事家、文學家。曾經參與“慶曆新政”。提出了“明黜陟、抑僥幸、精貢舉”等十項改革建議。晚年知杭州期間，設立義莊。代表作品有《嶽陽樓記》、《明堂賦》等。
性三品說 我國古代一種主張人性分為三等的理論。性三品之說受孔子“唯上智與下愚不移”的先驗論影響。西漢時期董仲舒把人性分為上、中、下三等。東漢時期王充也據稟氣的多少把人性分為善、中、惡三種，唐代韓愈明確提出“性情三品說”，把性與情分為上、中、下三品。
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董仲舒喜歡談論神秘莫測之事。公元前130年，遼東高廟和長陵高園殿發生火災，董仲舒推說其意，寫成《災異之記》草稿，尚未上書皇帝。主父偃私見其稿，因為嫉妒董仲舒，所以將《災異之記》草稿偷竊出來上奏朝廷。
漢武帝將它交與朝中諸儒審閱。因其中有諷刺時政的文字，漢武帝一怒之下，把董仲舒打下了大獄，雖然後來漢武帝看重他是著名的經學大師，又下詔赦免其罪，複為中大夫，但是董仲舒從此不再談論災異。