清軍將士人人奮勇，個個爭先，以一當十。好一場廝殺，直殺得沙塵滾滾，汗雨澆地，聲嘶力竭。結局是清軍三戰三捷。叛軍敗入城中，苟延喘息。兆惠軍在葉爾羌河東岸紮營歇息。一夜間，安然無事。
次日平明，隻見遠處沙霾彌漫，原來是大和卓自喀什噶爾率叛軍五千馳援而來。兆惠不急於匆忙對敵，加固營房，在河邊扼守待援。畏兀兒稱這條河為黑水河，叫喀喇蘇，故人稱兆惠營為黑水營。
小和卓見援軍趕到，不再龜縮城中，氣焰頓時囂張起來，頻頻出兵，跟大和卓的援軍圍攻黑水營，餓狼撲食似的直打不懈。
延精忠一驍騎校，受兆惠將軍重托，單騎突圍飛馬求援。
阿克蘇辦事舒赫德積極籌措救援，阿訇、伯克紛紛捐馬匹駱駝，為清軍支助軍糧。
兆惠軍營動輒斷糧，幸好水源充沛，尚能忍饑堅守。
黑水營將士渴望救援，不免紛紛議論：
“頭一次增援的敗了，這次又敗了，咋辦呀？”
“派可憐巴嘰的幾百兵救援，能不敗麼？”
“何時才能解圍呀？”
定邊副將軍富德率赴南疆的索倫、察哈爾兵兩千及北路兵一千餘，冒著刺骨寒風，馬不停蹄，人不卸甲，星夜馳援。
南疆民眾十分關注黑水營的艱難處境。阿克蘇、庫車、和田軍民尤為殷切，因為黑水營的存亡關係到上述地區政局的穩定和反複。已脫離大小和卓的他們不願再淪入魔掌，他們反對分裂渴望統一與安定。
兆惠親自巡營，耐心慰藉兵勇：
“困守三月，全仗弟兄們士氣超人。援軍即至，稍安勿躁，堅持便是勝利。”被困將士聞“援軍即至”，情緒一時亢奮，但久盼不至，難免失落。一個個望眼欲穿，饑餓難耐，困乏不堪。
乾隆二十四年元月，延精忠帶著援軍即至的福音，斬將踏卒，衝破重圍，馳入兆惠軍營。
富德援軍打破大和卓的封鎖，大和卓軍營大亂。
兆惠率兵反擊，黑水營突圍成功，與援軍會師後，移駐阿克蘇休整。
畏兀兒百姓扶老攜幼，牽牛趕羊慰勞清軍。
哈密畏兀兒首領玉素甫、吐魯番額敏和卓、庫車阿奇木伯克鄂對和兒子鄂斯滿、阿克蘇阿奇木伯克霍集斯、拜城阿奇木伯克噶岱默特紛紛支援清軍，送糧、獻馬，絡繹不絕。
南來北調的清軍陸續開來，雲集阿克蘇。
小和卓趁兆惠退駐阿克蘇，無攻城之憂，遣兵再攻和田。剛剛脫離大小和卓的和田軍民告急。
定邊副將軍富德率一萬五千人馬馳援和田，副都統珊爾起領兵南下，為開路先鋒，縱穿塔克拉瑪幹大沙漠，直插和田。
小和卓的叛軍敗回葉爾羌，和田圍解。
乾隆二十四年六月，兵精糧足的清軍分兵出擊。兆惠率軍一萬五千，進攻喀什噶爾；富德率軍一萬五千，由和田西攻葉爾羌。清軍一路勢如破竹，斬將奪城，連下葉城、澤普，號稱三萬大軍的清兵威逼葉爾羌城下。
此時葉爾羌河水正旺，從城東流過，河東是熾熱浩瀚的塔克拉瑪幹大沙漠。富德攻城時，偏空東城不圍，沿葉爾羌河南北圍得嚴嚴實實，通往英吉沙的一麵虛張聲勢，尤其以夜間攻城最烈，慌得叛軍疲於應付，驚得賊子魂不附體。一連五天，擾得小和卓上下人心浮動，焦躁不安。小和卓生怕城破被俘，算計突圍。東邊一來河水正漲，難渡，即使渡過去，困在沙漠，是一條死路；南北圍得銅牆鐵壁，突擊無望；西麵雖攻勢猛烈，但突出後可奔英吉沙，走喀什噶爾。如此一算計，小和卓決定向西突圍，但不到糧盡箭絕，他還是不甘心冒險的。富德終於探到了虛實，東城因無攻勢而防守空虛。於是他命珊爾起帶敢死隊夜襲登城，南北各備威遠炮四門，同時轟擊城牆城門。表麵上令攻城聲勢更大更猛，暗地裏抽調生力軍兩支，在夜幕掩護下，悄悄西去。
城門被炸，城牆坍塌，攻城的清軍如潮水湧入，夜襲登城的清軍呐喊四擾，伴隨炮聲隆隆，小和卓大本營雜亂喧天。
“報！”“報！”
“官兵入城！”小和卓倉皇出逃，叛軍湧出西門。虛張聲勢的官軍掩殺一番。小和卓向西奪路逃命，心中倒也僥幸歡喜，未遇強大的截殺和追擊。逃至黎明，人困馬乏之際，接近買裏塔木，殺聲陡起，伏兵迭出，驚得小和卓叫苦不迭，拚命奪路，方知占小便宜吃大虧的道理，兩支伏兵堵截剿殺，驍勇無比。這一仗，叛軍失去城郭的遮掩和依托，叛軍死傷慘重，橫屍千計。
再說兆惠將軍，自率一萬五千勁旅，一路拉朽摧枯，奪了烏什，橫掃阿合奇，直奔喀什噶爾。慌得大和卓波羅泥都四處搜羅叛匪，積聚力量。
葉爾羌的光複，令各路清軍士氣大振；小和卓敗逃，使叛匪望風喪膽，朝秦暮楚。