正當蘇軾為鞏固北宋王朝的邊防而大費腦筋時，他曾經的學生宋哲宗卻以“譏斥先朝”的罪名把他貶到了偏遠的英州。哲宗紹聖元年（1094年）四月，蘇軾南遷。蘇軾在奔赴英州的途中，就擔心會有“後命”，他在《與子孫發書》中說：“言者尚紛紛，英州之命，未保無改。”事實果然如此，他還未到英州，就又被貶為遠寧節度副使（宋代，節度使是無權的虛銜），惠州安置。原來，哲宗親政以後，任用章惇為相，依附章惇的虞策、來之邵都是堅決反對舊黨的人物，對蘇軾兄弟恨之入骨。所以蘇軾還未到達英州，虞策認為“罪罰未當”，又降為正六品下的“充左承議郎”，再貶為建昌（今江西南城）軍司馬，惠州（廣東惠陽）安置。蘇軾隻好把家小安置在陽羨（今江蘇宜興），獨自與幼子蘇過等人南下惠州。蘇軾貶官惠州，一住又是幾年，他深感“中原北望無歸日”，就開始做長遠打算。短短數月中，一貶再貶，政敵們試圖將蘇軾置之死地。此時的蘇軾已經是年近六十的老翁，千裏奔波，對其精神和身體都是很嚴重的傷害。即使這樣，蘇軾在惠州仍然非常關心老百姓的疾苦，他運用自己多年的經驗和所積累的知識，著重改善當地居民的生活條件。廣州百姓因多食用鹹水，人們經常患有疫病。於是蘇軾就向知州王敏仲建議，從二十裏外的蒲澗山用竹筒將水引入城中。他還考慮到因路遠日久，竹筒可能堵塞，便提議在每節竹筒上鑽一小眼，“以驗通塞”。惠州博羅香積寺溪水湍急，蘇軾提出在這裏設碓磨，用來磨粉舂米，減輕農民負擔。他還多方研製醫藥，救死扶傷，深得當地百姓的敬重。
蘇軾62歲時又被貶到儋州。這次被貶的原因據說也是因為詩文。宋代的儋州，相當落後荒涼。蘇軾在自己的文章中詳細描繪了這裏的生活狀況：“食無肉，病無藥，居無室，出無友，冬無炭，夏無泉”，總之，這裏幾乎赤地一片，而且此地常年炎熱潮濕。年過六旬的蘇軾身體上遭受了巨大的痛苦，和三子蘇過在這荒島上過的生活可以用“苦行僧”來形容。元符三年（1100年），年僅17歲的哲宗病死，因無後代，由弟弟趙佶即位，是為宋徽宗，政局再一次發生變化。新皇帝寬赦了元祐舊臣，讓貶謫在外的人逐漸內遷。這一年五月，蘇軾奉命內遷濂州。他揮淚告別海南人民，七年的流放生涯讓他百感交集。66歲的老人，居然沒有被政敵折磨而死在嶺南，還獲得了北歸的機會。這年的八月，蘇軾又被改為舒州團練副使，永州安置。他再也不願意卷入朝廷的政治鬥爭，隻想挑一個清淨的地方安度餘生。本來，他打算和弟弟蘇轍一起住在穎昌（今河南許昌），但是得知朝廷又開始排斥元祐舊黨，便打定主意，留居常州。但是，多年的貶官、流放，惡劣的生活環境以及旅途的辛勞，使蘇軾再也無法支撐下去。建中靖國元年（1101年）七月二十八日，一代文豪蘇軾病逝於常州。他留下的最後一句話是“吾生不惡，死必不墜”。他死後，“吳越之民，相哭於市”，太學生還舉行了儀式來緬懷他。
蘇軾的一生，在政治上曆經艱難坎坷，備受政敵的折磨。但是他始終熱愛人民，始終盡力為人民謀福利，並取得了很大的成效。雖然後人更多是因為他巨大的文學成就而將他銘記於心，然而，蘇軾在政治上以天下為己任，兢兢業業為民謀福利的精神也同樣值得我們敬重。