他認為人工流產是應該堅決反對的，要說侵犯人權，人工流產是有點這個意思，但我們要杜絕人工流產，馬寅初說，既然已經懷孕，“人”形成了，“他”就應該有生的權利，把他殺掉，就是犯罪。父母殺子女，這成什麼話！同時，人工流產對母親的健康也會帶來不好的影響。他還認為，如果讚成人工墮胎，就會把避孕意識衝淡了。
為了有效地控製人口增長，馬寅初當時提出了他的主張，這些主張在那時是從實際出發，切實可行的，是科學的。
第一步要依靠普遍宣傳，要破除宗嗣繼承觀念，破除“早生貴子”、“不孝有三，無後為大”等封建殘餘思想。第二步，“待到宣傳工作收到一定的效果以後，再行修改婚姻法”，實行晚婚，“大概男子25歲，女子23歲結婚是比較適當的”。第三步，如果“婚姻法修改之後，控製人口的力量還不夠大，自應輔之以更嚴厲更有效的行政力量。”
《新人口論》中還提到了“提高人口質量”的問題，原理大家都明白了，但實際上又如何呢？
中國實行計劃生育已經二十年了，人口增長得到了緩解，但不能不看到，真正得到緩解的是城市，因為城市居民文化素質高，觀念上、行政上都容易轉變和實施，而往往在貧窮的農村地區，“愈是貧窮——人口生產愈多——無法接受教育——愈是貧窮”的惡性循環還在延續。
馬寅初強調一定要把質與量配得適當，這一點上對於我們現在的“計劃生育”國策不能不說有強調的必要。
《新人口論》中的所有這些觀點曾經被說成“地地道道的馬爾薩斯主義”，理由是他把人看成了消費者，沒有首先想到人是生產者，是“見口不見手。”而實際上，馬寅初可比馬爾薩斯高明多了，他還對馬爾薩斯人口論作了批判。他指出其，“馬爾薩斯寫人口的本意，就在於從理論上維護資本主義製度及政府”；另一個根本不同之所在，馬爾薩斯鼓吹用戰爭、瘟疫和饑餓等手段來消滅現有人口，而馬寅初主張從人性出發，科學地引導，使人口漸漸地減少。
馬寅初的真知灼見是劃時代的，從根本上促成了中國經濟的發展，就這點而言，又有幾人能與馬寅初相比？
我們一談到中國人口問題，一定會馬上想到馬寅初的名字，這位中國著名的人口學專家、經濟學家，以其提出的“新人口論”而聞名於世，尤其當我們感受到人口問題一直在困擾我們的時候，不由自主地將作如下感歎：如果40年前就采用了馬寅初的人口論，那該有多麼好啊！
當我們從人口困惑中開始清醒的時候，才從曆史的塵埃中撿起這本已是傷痕斑斑的《新人口論》，發現它閃耀著理性之光，以至於被認為是“影響現代中國曆史進程的一本好書”。
而如今的事實也已經印證了馬寅初在被批判時所說的那一句名言：
“我個人被批判是小事情，沒有什麼，可是，我想所寫的《新人口論》，是有關國家和民族的大事。我相信，過幾十年後事實會證明我是對的。”