20世紀50年代，美蘇冷戰開始時的奧斯瓦爾德還是海軍陸戰隊中的一員，他的各項技能都有不錯的成績。當時，中央情報局動用了U—2偵察機對蘇聯進行高空偵探，這需要一批訓練有素而且反應靈敏的地麵人員來進行配合。於是，中央情報局選擇了在海軍陸戰隊中找一批這樣的人。毫無疑問，成績出色的奧斯瓦爾德被選中，成為打入蘇聯的一名特工。作為一名特工人員，奧斯瓦爾德在海軍陸戰隊及後來在蘇聯時所刻意表現出來的另類的信仰，不過都是他的偽裝，而他也表演得十分出色。他完成任務回到美國後，表麵上是在一家複製文件地圖的培訓班裏上課，但這家培訓班幕後的老大也正是中情局。1962年6月，聯邦調查局的兩位特工也找到了奧斯瓦爾德，顯然是他出色的工作能力引起了他們的注意。這兩位特工是來挖中情局牆角的，他們希望奧斯瓦爾德能參加他們的工作，打進斯拉夫移民組織獲取情報。
1962年7月，古巴導彈危機爆發。奧斯瓦爾德臨危受命，喬裝成一位對古巴共產黨熱愛到瘋狂的年輕人，試圖混進“爭取公平對待古巴委員會”。他在新奧爾良的大街小巷上為共產黨做宣傳，就是想讓委員會知道自己的存在。
這個時候的奧斯瓦爾德所表現出對蘇聯和古巴的狂熱崇拜都不過是在演戲而已，他對共產黨的熱烈信仰不過是在執行國家交給他的任務罷了。他名義上對卡斯特羅忠心耿耿，背後卻在賣力反對他。
到現在，這件案子似乎更加撲朔迷離。如果把奧斯瓦爾德理解為被迫參與了暗殺肯尼迪行動的話，那麼魯比又是怎麼回事？他開槍殺死奧斯瓦爾德的動機更像是殺人滅口。
根據調查，魯比跟奧斯瓦爾德是舊相識了，他們有一個共同的老大——中央情報局，所從事的同樣是反卡斯特羅的工作。魯比所開的夜總會，其實就是一個販賣武器的場所，他們專門為反對卡斯特羅的武裝分子提供武器。難道從刺殺總統開始，這所有的一切都跟中央情報局或聯邦調查局有關嗎？如果不是，那麼奧斯瓦爾德究竟是聽了誰的命令潛伏在總統的必經之路上，並且架起一支步槍的？
整個暗殺案件中，最能肯定的就是奧斯瓦爾德和魯比的特工身份。就在總統被殺害前3天，醫院裏曾經接收了一個負傷的女人，名叫羅莎·切米。
切米曾經是魯比的得力助手，因為得知了他們謀殺肯尼迪的計劃而又不願參加被滅口。幸運的是，她被人從飛馳的車上扔下來並沒有死。當時她把這些都告訴了前往醫院調查的工作人員，而且反複強調有個謀殺總統的邪惡計劃正在籌備中。然而，前來調查的工作人員並沒有把她的話當一回事兒。
當然，像切米這樣的關鍵人物，陰謀者是不會放過的。1965年9月，切米的藏身之地被發現，隨之而來的就是一場慘絕人寰的車禍。
現在，人們可以斷定魯比跟謀殺計劃有關，但卻不能確定他的幕後主使究竟是誰：是中情局，還是聯邦調查局？抑或是黑手黨？
還有一件事得到了肯定，魯比選擇在人最多的時候槍殺奧斯瓦爾德就是為了掩人耳目，遮掩他殺人滅口的真相，試圖給人以“總統粉絲”替總統報仇的假象。他原本以為，這樣做最起碼可以獲得社會輿論的同情，使自己免於法律的追究。然而，他想錯了，最終他還是被扔進了監獄。那一刻，魯比猛然醒悟，他的幕後主使已經拋棄他了，而且，他也知道，自己很有可能成為下一個奧斯瓦爾德。想明白了這些，魯比決定向沃倫委員會澄清所有事實。可惜的是，還沒等到沃倫委員會的回應，魯比就死了。他的死亡日期是1967年1月3日，死因是癌症。
線索再次斷了，如何下手又成了一個難題。不過，魯比的癌症倒是給案件留下了一個缺口，一個好端端的人竟然會在這個節骨眼上患癌症死了，這個巧合過於戲劇化了。
在魯比死後不久，又有兩個人相繼死亡。第一個人是曾被懷疑謀殺總統的某個組織的領袖戴維·費裏，第二個人是古巴著名的政治家埃拉迪奧·德爾巴列。前者的死因是腦血管破裂而死，有趣的是他在死的當天還寫下了一封遺魯比準備向國會吐露真相，卻在獄中突患癌症離奇死亡，從而成為肯尼迪一案中眾多死亡鏈條上的另外一環。
書，難道他知道自己會因腦血管破裂而死亡？還有一個細節值得注意，這位戴維·費裏是個癌症研究愛好者，他常常拿小白鼠做實驗然後寫成論文，還十分在行，他的死很容易讓人聯想到魯比的離奇死因。後者的死因是被謀殺，腦袋被斧子劈開，胸腔裏還留有一顆子彈。費裏和德爾巴列來往甚密，兩人經常在一起為古巴流亡分子找生計。這兩個人的先後死亡，讓這個案件更加雲山霧罩。