大學士李蔚、王熙等奏稱：“台灣有地千裏，人民十萬，棄其地，恐為外國所據；遷其人，恐奸究生心，應如琅議。”
這是注入了新鮮血液、進取騰飛的龍的觀點。這種觀點已不再把中國之大勢等同於天下之大勢，而是在敏銳地體察世界之大勢，把中國之大勢放在世界之大勢之中思考。康熙帶著鳳的銳氣（雖然他從龍的角度出發），因而較少天朝大國的陳腐，因而勢必讚同後一種觀點。他說：“台灣棄取，所關重大，棄而不守，尤為不可！”他轉向李光地：“你恐台灣既擁重兵，尾大不掉，目下如何？”
李光地上前奏道：“目下何妨？以皇上聲威，幾十年可保無虞。”康熙豪爽大笑，朗聲道：“如此，且置郡縣。若計到久遠，十三省又能永保為我所有嗎？”康熙二十三年四月十四日，康熙正式批準在台灣設置地方軍政機構的疏請。自此，台灣設一府——台灣府、三縣——鳳山、諸羅、台灣（澎湖直轄於府）隸福建省，設總兵一員、副將二員，駐兵八千，分水陸八營（澎湖設副將一員，駐兵二千），營各設遊擊、守備、千總、把總等官。台灣軍政機構與內地完全相同，連衙署建築也改變了台灣坐東向西的習慣，而如內地“衙門口，朝南開”。
同年十二月，鄭克塽等奉旨到京，康熙說話算數，給予他們優厚待遇。鄭克塽封一等公；其叔、弟分別授四品職、驍騎校等；劉國軒、馮錫範等授漢軍伯，俱隸上三旗漢軍，由戶部“撥給房屋田地”。劉國軒“首先歸命”，並勸鄭氏“納土歸來”，受到康熙親自召見和特別表彰，實授直隸天津總兵官。其他投誠武職一千六百餘人，文職四百餘人，兵丁四萬餘人，“有願入伍及歸農者聽其自便”，均得到了妥善安置。同時歸來的明朝宗室，也給予屯田牛種，安插定居。
台灣回到了祖國的懷抱，人心凝聚到了康熙的龍庭。康熙精神振奮，展紙而書，墨翔鸞鳳，筆走龍蛇：萬裏扶桑早掛弓，水犀軍指島門空。來庭豈為修文德？柔遠初非黷武功。牙帳受降秋色外，羽林奏捷月明中。海隅久念蒼生困，耕鑿從今九壤同。
“耕鑿從今九壤同”，康熙此後像所有的開國之君一樣，把主要精力放在了迅速恢複和發展社會經濟之上。朝政，接受各少數民族王公貴族的朝覲。
鳳之銳氣康熙采用的是龍的手段，推行的是龍的文化，不同的是，康熙帶著鳳的銳氣，這使得他將龍的手段、龍的文化發展到了前所未有的高度。
康熙二十四年以後，康熙在親政之初實行獎勵墾荒、藩為更名等發展小農經濟政策的基礎上，開始大規模免除百姓上交的賦稅錢糧。
三月，康熙諭大學士：“今國帑充足，朕欲蠲免直隸各省明歲錢糧，以紓民困。爾等會同戶部，預行酌議。”
部議以為，為避免國家經費拮據，宜輪流蠲免。於是，三年之中，直隸、河南、湖北、湖南、江南、四川、山東、貴州、福建等九省輪免一周。此後，年年都有大規模蠲免。“有一年蠲及數省，有一省連蠲數年者”，其中，康熙四十九年十月到康熙五十一年十月短短的兩年間，蠲免錢糧涉及到所有的十九省區，共免地丁銀和曆年拖欠三千二百零六萬四千餘兩。而清朝每年地丁錢糧加上鹽課關榷，共為三千三百八十五萬四千餘兩。蠲免錢糧，近於全國一年的總收入。據載，終康熙一世，全國共有二十餘省區獲免稅糧、丁銀、逋賦五百四十五次，總數不下一億四千萬兩。蠲免，特別是大規模地普蠲輪蠲，能夠有效地防止官吏舞弊中飽，成為落實輕徭薄賦、發展生產的重要措施。如時人所雲：“惟蠲免錢糧，率土均沾實惠。”蠲免的基礎，除了增收，關係到康熙本人，更是在於節流。康熙曾不無自豪地說：“朕每歲供禦所需，概從儉約，各項奏銷浮冒，亦漸次消厘。外無師旅餉饋之煩，內無工役興作之費……朕屢行蠲免，而無國計不足之慮，也仰仗這些平素的經籌啊！”