有一次，太宗罷朝歸來，滿臉悻悻然，口中連聲憤憤道：“遲早我非殺掉這個鄉巴佬不可！”長孫皇後忙問他因什麼事要殺誰。太宗說：“就魏征這個老東西。他總是在朝廷上當眾忤逆，給我難堪，弄得我下不了台。”太宗罵魏征是鄉巴佬，是因為魏征出身於巨鹿下曲陽（今河北晉西縣）一個地方官吏家庭，由於父親較早去世，魏征從小生活孤貧，還曾一度做過道士。隋末農民起義爆發，他才參加了李密領導的瓦崗軍。長孫皇後見大宗越說越氣，便不發一言，隻悄悄地退入內室。也諳悉太宗的行事，生恐太宗因一時暴怒，殺掉了魏征。
長孫皇後退入內室，換上朝服，再來見太宗。太宗一見皇後這身打扮，十分驚愕。因為在唐代，按規定，皇後穿上朝服，是參加受冊、助祭或朝會等大事的隆重禮儀。長孫皇後還向大宗祝賀。太宗問：“賀從何來？”皇後說：“我讀古書，上麵寫道：君明臣直。隻有皇帝賢明，才能有直言進諫的賢臣。剛才聽你說的，魏征敢直言頂撞你，是因為你賢明。我哪能不祝賀呢？”太宗聽了，恍然大悟，立刻轉怒為喜，並準備照章給魏征賞帛五十段。長孫皇後又說：“我還聽古人說：‘夫以銅為鏡，可以正衣冠；以古為鏡，可以知興替；以人為鏡，可以明得失’。希望陛下掌握這三鏡，以防止自己出過錯。”太宗聽了，十分欽佩，拉著長孫皇後的手，十分親昵。長孫皇後接著說道：“古人還說：人欲自照，必須明鏡；主欲自照，必借忠臣。魏征乃忠臣，望陛下愛惜他。”太宗點頭稱是，並說：“朕定將魏征的奏章放在案頭，貼在屏風上，以便出入觀看。”乘太宗高興，長孫皇後又建議，對犯顏直諫的，除賞錢賞絹之外，還應該提高諫議官的地位，最好規定宰相入內議國事，必須有諫議官隨入，豫聞國事。這個意見，太宗也接受了，並且後來還作為一條規定，諭示朝廷。於是，“納諫之風大興”。
長孫皇後為了輔佐太宗，為了唐王朝的國家社稷大業，機智地救了魏征，彌補了太宗的闕失。又有一次，大臣房玄齡因一件小事，被太宗斥退，並要遣歸家門。房玄齡十分驚恐，忙入宮叩頭請罪，太宗盛怒之下，仍不準寬宥。當時，長孫皇後正病危，聽說此事，心中十分不安。她知道，房玄齡曾跟隨太宗多年，在太宗東征西討時，為太宗出謀劃策，屢建功勳，是一位賢臣。在彌留之際，長孫皇後仍不忘規勸太宗說：“房玄齡一直跟隨陛下，忠心耿耿，不愧為一名賢良功臣。如果不是犯了很大的過失，望陛下不要拋棄他。”長孫皇後訣別諍言，深深打動了大宗。長孫皇後死後，太宗便忙召回房玄齡，並恢複了他的職位，不僅使房玄齡，也使很多大臣都十分感動。
長孫皇後自幼隨舅父熟讀古史，深諳中國古代自漢魏以來，因外戚專權，擾亂國家社稷，以致天下不得太平。唐太宗繼位後，時時不忘“以隋為戒”，長孫皇後自然高興。但她常常提醒太宗，對外戚專權也不可掉以輕心。她曾著書立說，力陳外戚專權的危險。在著論駁漢明德馬皇後時，批評馬皇後在抑止外戚專權的作法上是舍本逐末：不是抑退外威，而隻是批評擁重權的外戚生活上腐敗奢糜。她以古為鏡，嚴格自律，絕“不願兄弟子侄布列朝廷。”
一次，唐太宗要封長長孫皇後的兄長長孫無忌為左武侯大將軍、吏部尚書、右仆射（宰相）。長孫皇後馬上上書大宗說：“我進宮為皇後，已是尊貴到極預了。我實在不願意我的兄弟和侄兒們都到朝廷做官。漢代就是因為皇後嬪妃的親戚都到朝廷當官，結果，外戚專權，天下大亂，漢王朝也就滅亡了。這個教訓銘心刻骨，應該引以為戒。”但長孫無忌與唐太宗是布衣之交，玄武門之變，長孫無忌功不可沒，他是唐太宗開國的元勳功臣。就是沒有長孫皇後這層關係，唐太宗封他高官厚祿，他也是當之無愧的。所以，這一次太宗不打算接受長孫皇後的建議。長孫皇後見太宗執意要加封自己的兄長，便又勸太宗說：因為自己是皇後，我的親戚就得到高官厚祿，這不是一種好的舉措，它容易導致危險。為了使他們和他們的子孫得以永久的保全，所以就得慎重，不要授予他們很大的權力，讓他們處在非常顯要的位置上。如果皇上定要加封，就請封他們到京部之外的地方作一些閑差吧！一麵還暗中密命長孫無忌經常向唐太宗“苦求遜職”。因為長孫皇後反對，長孫無忌又多次跑來請求辭職，唐太宗最後隻好封長孫無忌為“開府儀同三司，後意乃懌”，長孫皇後這才同意了。因為“開府儀同三司”隻是一品散文官，榮譽雖高而無實權。