一些獨具慧眼的進步人士看法不盡相同，他們從各自的立場出發，把學潮當作籌碼或希望。張謇對於“各處摧折學界之文牘，不曰流血即曰革命，不曰把持地方即曰莠言亂政，甚至以苗沛霖、洪秀全相比例”的做法頗為不滿，認為風潮的根源在於“學堂性質與書院全然不同，書院則人人意中皆功名利祿之思想，學校則人人意中有生存競爭之思想；書院則人人意中有苟且依賴之思想，學校則人人意中有奮起獨立之思想。行政人設以待書院者待學校，則學校中人殆無一可滿行政人之意者矣”。但他不願坦率承認，反而說：“各處風潮迭起，全由於解釋之不明，積疑生嫌，積嫌生釁。”《張季直殿撰複兩江學務處沈觀察書》，《大公報》1906年。5月8—9日。把根深蒂固的社會矛盾衝突淡化為誤會引起的私怨，試圖設立學會居中調節。這實際上反映了實力不斷增長的紳商企圖利用矛盾，充當官民中介，以便更多地掌握社會控製權和行動主動權。不過，張謇本人創辦的南通師範，倒是清末為數不多的既卓有成效，又相對平靜的學堂之一。
革命黨人的態度十分鮮明，他們認為：“中國思想中退讓之風，平和之望，皆今日所大忌，而其毒深中於人心。亟宜獎自治之說，倡尚武之風。即有流弊，不見容於舊習，而權其輕重，亦當忍耐以待其成熟。吾輩以為，中國青年。不患其粗暴，而患其怯弱；不患其愚直，而患其纖柔；不患其不能為平時之學者，而患其不能為戰時之兵士。今各省學堂學生動作少背習慣，即責其囂張背謬，而不知青年。思想極屬單純，重秩序守規律之心，平時以身作範，化之以德，則崇朝可以養成。而其言行動作，即少出常規，亦當顧念時勢，善為誘導，以奔赴國家主義之大目的。不然者，即學生皆化為程、朱，舉動不苟，行必方步，其奈中國之亡何哉？”《敬告中央教育會員》，《民立報》1911年。7月26日。這種議論切中時弊，寓意深刻。從學校管理看，由強製性他律到民主性自律，往往發生適應性紊亂現象，而且不如權威式領導的效果顯著快捷。從政治上看，由專製而民主，幾乎必然伴以陣痛。把催生的痙攣誤認作死亡的先兆，因噎廢食，由變革的動蕩退回舊日的安寧，正是導致民主化進程一波三折的通病。其實，出格作為突破的副線，不僅帶有必然性，而且有助於打破僵死。革命前破壞舊秩序的學生，正是革命中與革命後建立和維持新秩序的骨幹。表現不同，本質一致，都反映了學生反對專製、追求自由平等的內心境界。這種理想化的追求以及由此帶來的超前舉動，成為推動近代中國社會變革的重要力源。
有些人也承認學潮與自由平等思潮的內在聯係，說：“慨夫自由平權之說出，而學界中人靡然歡迎，罷學風潮，亦實斯說之有以動蕩於其間。”但又認為：“自由平權亦非漫無權限之驕肆行為。天下人守夫權限，則各不可幹涉，而自由平權之道，乃能暢行天下。罷學非自由平權之道也。”《論奉天師範生之罷學》，《盛京時報》1907年。12月5日。這種指責政治上雖與官府有所區別，認識上卻同樣荒謬。自由平權當然要遵守一定的權限秩序。但要在專製秩序中尋找權限的準繩，等於否定自由平等。推翻專製製度，破壞封建秩序，既是實現自由平等的前提，也是規定民主權限的依據。非議自由平等思潮引起的社會波動，實際上是否認自由平等原則的可行性。不過，學生對共和秩序建立後民主與集權的矛盾對抗缺乏足夠認識和精神準備，沒有觸及更無力解決這一更為深刻重大的社會變革主題。
學潮促使社會矛盾暴露激化，但不能從根本上加以解決。這種衝擊明顯帶有突發性、鬆散性和分散性的局限。
所謂突發性，即學潮雖經長期孕育，但往往由偶然事件觸發，缺少主動的發起組織。時間突發是內容自發的表現。學潮的直接目的具體而微，趨勢相同，目標各異。即使聲勢較大的風潮，直接起因也多具偶然性、個別性和地域性，可以在一定範圍引起共鳴，卻難以形成更大規模的共振。在自由平等的內驅意識外，未能產生統一的行動綱領。學生們對專製製度極端不滿，行動起來卻是泄憤多於本質否定。對於自由平等的理解十分抽象，要麼是模糊的輪廓，要麼是怪異的西式框架。朦朧美對充滿幻想的青年。更具誘惑力，但也妨礙他們學理上登堂入室，並付諸實踐。因此，罷課退學雖不時被用作鬥爭手段，仍屬於局部衝突的應急措施。
鬆散性表現在學堂、區域和全國三個層次上。由於出身、閱曆、背景、年。齡、班級、地域的不同，學生彼此存在隔閡，有時激化起來，還會導致內訌。老童生與新少年。、城與鄉、官與紳、官與兵、不同籍貫以至不同班級的學生之間，都發生過摩擦。山東、廣東、廣西、福建、江蘇、湖北、安徽、浙江、奉天等省學界，曾因學額分配不均大起衝突。南京幾乎演出兩軍對陣的鬧劇。各校蘇籍學生“遍發傳單，以退學相持”《要聞》，《彙報》第8年。第88號，1905年。12月13日。。而外省在寧學生“亦合籌抵製之策，特開一十七省非同鄉會於劉公祠內，聯合各省學生集議其事，公推湘、皖兩省人代表，所議宗旨亦極激烈”《要聞》，《彙報》第8年。第93號，1905年。12月30日。。廣西學生“肄業於湖南教員者名為南黨，肄業於廣東教員者名為東黨，互相對峙，兩不相犯”《學界分黨可免》，《大公報》1908年。11月28日。。奉天學生組織了“排蠻會”，“凡山海關以內之人，均在被排之列”《學生秘密會》，《盛京時報》1907年。5月24日。。