潯溪公學第二次風潮以學生散學而告結束，帶給相關各方的影響卻相當深遠。
就公學而言，其主辦者和管理者均為社會開明進步人士，可是公學有名於時，卻以其在學界風潮史上占據重要位置。該校既是首次近代學堂退學風潮的發源地，又率先起而響應影響廣泛的南洋公學退學風潮。南洋公學退學生所編《教育界之風潮》和《選報》的南洋公學學潮專號分別刊登《南潯潯溪公學之衝突》、《潯溪公學第二次衝突之原因》等文章，正是將其視為南洋公學風潮影響的結果。自此，學界風潮風起雲湧，一發不可收拾，對既定統治秩序產生了巨大的衝擊。而潯溪公學自身也成為反抗專製秩序的犧牲。經過兩次風潮的震蕩，潯溪公學雖然沒有像蔡元培所說“遂爾停辦”蔡元培：《杜亞泉傳》，高平叔編：《蔡元培全集》第7卷，第169頁。勉強維持，卻再也無法平靜下來。1903年。10月，章炳麟致函柳亞廬稱：“昨聞潯溪公學又以小釁分裂。自茲以往，私設諸校，益淩遲衰微矣。”湯誌鈞編：《章太炎政論選集》上冊，中華書局1977年。版，第249頁。“後此校果以管理不得法而敗。”葉瀚：《塊餘生自紀》，《中國文化研究集刊》第5輯，第485頁。1904年。8月《警鍾日報》特派員對南潯學界進行調查，於“潯溪公學”項下標明“今改述誌醫院”本社特派員調查：《南潯學界》，《警鍾日報》1904年。8月21日。。
總董龐青城風潮之後逐漸走上反清革命道路。1906年。冬，楊篤生創議收回《神州報》館，向龐青城募資3千元，龐慨然應之。1907年。龐青城加入同盟會，鎮南關之役，接濟軍餉5千元，又出錢請律師為被捕同誌辯護。次年。秋，與排名“四象”次席的同鄉張靜江共設東益昌票號，欲為革命金融機關，並捐萬金倡辦《民呼日報》。該報主筆於右任因披露當道劣跡被捕，龐以4千金延律師，救其出獄。1910年。東益昌為經理李燧生盜吞巨款14萬，龐青城從此破家資之半，但次年。仍以千金接濟廣州起義，以5千金接濟武昌起義，又抵押家屋得3萬金，助藍天蔚北伐軍軍餉。1911年。11月，他和章炳麟、伍廷芳、沈縵雲、李平書、馬君武等人響應武昌軍政府臨時代表的建議，組織中華民國聯合會，促成臨時政府的建立。《中華民國聯合會開會通告》，《民立報》1911年。11月19日。1912年。又和戴季陶等人組織中國同盟會本部於上海，擔任評議員。《上海同盟會大會》，《民立報》1912年。5月5日。辛亥革命中，這樣毀家赴難的資本家的確罕見。難怪戴季陶感慨萬端道：“喜安惡危，人之常情，處和平之局，而致力於危險之事，非有卓識者，其孰能之哉。自胡虜肆虐，炎黃聲教，淪胥幾盡。及乎西潮東漸，革命思想，入人日深，而同盟會於以創焉。吾鄉中人抱革命之思想，而得列於健兒班中者，以南潯之張靜江、龐青城為最早。然靜江少遊歐美，久居巴黎，羨自由之樂，讀革命之史，而回顧祖國，奄然待斃於胡氛蠻障之中，思想之起步，腦筋之刺激日益甚，自非伏處專製政府下之盲民所可同日語者。青城以富家翁生長於華屋之裏，未能如靜江之乘風破萬裏浪也，而始則從事社會事業，繼則投身革命團體，不惜毀家以促成共和之新國焉，可謂人傑矣。”並特述其生平事跡，“以為新國史之資料”天仇（戴季陶）：《龐青城事略》，《民權報》1912年。5月8日。。
風潮衝擊對象的杜亞泉，本屬急進派。任教紹興中西學堂時，除治數理化外，“亦喜研究哲理，對於革新政治、改良社會諸問題，常主急進”蔡元培：《自寫年。譜》，高平叔編：《蔡元培全集》第7卷，第287頁。因而與舊派常有衝突。不過他很快便放棄了激進的傾向。蔡元培說：“先生既以科學方法研求哲理，故周詳審慎，力避偏宕，對於各種學說，往往執兩端而取其中，如惟物與惟心，個人與社會，歐化與國粹，國粹中之漢學與宋學，動機論與功利論，樂天觀與厭世觀，種種相對的主張，無不以折衷之法，兼取其長而調和之。”蔡元培：《書杜亞泉先生遺事》，高平叔編：《蔡元培全集》第6卷，第361頁。關於杜亞泉轉向的原因，蔡元培有所推測。1901年。1月，杜亞泉來函談及上海國會答張之洞書，蔡元培認為：“南皮書迂鄙無理，答書則義正辭嚴，非邃學人不辦。而亞泉乃謂南皮書甚合我意，……又謂答書多牽強，隻以見黨人窮苦失敗之狀”，覺得杜氏的態度“殊不可解”。杜亞泉又說：“上海通日文者，往往自謂通教育、哲學兩科，凡理化動植無不當行，輒挾所知以難人，誠無法待之。”蔡元培據此揣測：“亞泉專心西藝，於哲學家言不甚尋繹，或偶為此流所傲，故惡之耳。其薄國會黨人，亦此意也。”中國蔡元培研究會編：《蔡元培全集》第15卷，浙江教育出版社。1998年。版。