9月26日，中共中央複電朱德、張國燾，不同意紅四方麵軍西進方案。接到電報後，張國燾當日連續數電中共中央，力陳采取新方案的理由。並說：“如無黨中央明令停止，決照原計實施，免西渡、北進兩失時機。”
對於張國燾與中共中央的分歧，中共中央進行了耐心的說服。9月27日，毛澤東、周恩來、彭德懷致電朱德、張國燾、徐向前、陳昌浩並賀龍、任弼時、劉伯承，明確指出：“我一、四方麵軍合則力厚；分則力薄。合則寧夏、甘西均可占領，完成國際所示任務；分則兩處均難占領，有事實上不能達到任務之危險。一、四方麵軍合力北進，則二方麵軍可在外翼製敵；一、四方麵軍分開，二方麵軍北上，則外翼無力，將使三個方麵軍均處於一偏狹地區。……有一著不慎，全局皆非之虞。”“因此，中央認為，四方麵軍仍宜依照朱、張、陳9月18日之部署，迅從通渭、隴西線北上，不過半月左右即可到達靖遠、海原地域，從靖遠渡河；一方麵軍跟即渡河或合力先取寧夏，或分途並取寧夏、甘西。二方麵軍仍在外翼製敵，是萬無一失。”
同日，中共中央再次致電朱德、張國燾、徐向前、陳昌浩：“中央明令已下，請電令通渭部隊仍回占通渭，其餘跟即北上。”
就在這時，帶領先頭部隊調查行軍路線的徐向前在洮州以北當地群眾那裏得知，黃河對岸已進入大雪封山的季節，氣候寒冷，道路難行。根據這樣的地形、氣候條件，徐向前認為渡河的計劃難以實現。他即返回洮州，向朱德、張國燾彙報了情況。朱德、張國燾在洮州召開會議，討論中共中央的指示。張國燾看到西渡黃河的計劃無法實現，隻好同意北上。洮州會議一致決定，放棄西渡黃河計劃。
9月27日當天，朱德、張國燾、徐向前、陳昌浩聯名致電中共中央並賀龍、任弼時、關向應、劉伯承，表示執行中共中央的指示，按照原計劃東出會寧，會合紅一方麵軍，先頭部隊10月8日到達界石鋪，決不再改變計劃。9月28日，朱德、張國燾發布《通莊靜會戰役計劃》。29日，紅四方麵軍總指揮部向各部隊下達北進靜、會地區的命令。至此，這次關於進軍方向的風波才告平息。
9月30日，紅四方麵軍4萬多人，分五路縱隊，向通渭、莊浪、會寧、靜寧急進。
中共中央得知紅四方麵軍回師北進的消息後，立即部署兵力策應紅四方麵軍北上。10月2日，紅十五軍團獨立支隊襲占會寧縣城。10月3日，敵人又糾集兩個團的兵力反撲，企圖把會寧城奪回去。緊張時刻，紅一軍團第一、第二師趕到，和紅七十三師一起，在會寧城外將反撲之敵擊潰，使會寧城牢牢地控製在紅軍手裏，為紅一、四方麵軍在會寧會師創造了條件。
10月5日，紅四方麵軍第三十一軍占領通渭城。第四軍先頭部隊於10月7日在會寧的青江驛與紅七十三師會合。
10月9日上午，碧空萬裏，陽光和煦，會寧城門樓前紮起了彩門，紅旗招展，鑼鼓喧天。朱德、張國燾、徐向前、陳昌浩等率領紅軍總部 和紅四方麵軍直屬隊自南門進入會寧城。會寧城內，萬象更新，標語、人群、歡聲笑語，使這座偏僻的小山城空前的熱鬧。經過會師——分裂——再會師、曆盡磨難的兩個方麵軍，真是悲喜交集。他們互贈禮品，互相傾吐分離後的期盼之情，談論一路走來的艱辛，詢問其他同誌的下落，都為能夠再次重逢而高興。
10月10日，紅一、紅四方麵軍在會寧文廟前的廣場上舉行慶祝會師大會。大會由紅四方麵軍政治部主任李卓然主持，徐向前、陳昌浩、陳賡先後講了話。最後由朱德講話。他闡述了長征勝利的偉大曆史意義，強調了團結的重要性，號召部隊會師以後“更要團結一心，互相尊重，並肩作戰，戰勝我們共同的敵人”。
慶祝大會上，還宣讀了中共中央、中革軍委、中華蘇維埃中央政府為紅軍三大主力會合給全軍的賀電。
紅四方麵軍的長征，從1935年3月強渡嘉陵江西進開始，到1936年10月會寧會師結束，曆時1年零7個月，途經川、康、青、甘四省，行程近萬裏。由於張國燾的分裂主義錯誤，使紅四方麵軍的長征經過了一個艱難曲折的過程，在朱德、徐向前、劉伯承等以及廣大紅軍指戰員的鬥爭下，紅四方麵軍排除了張國燾的幹擾，經曆無數次戰鬥，粉碎了數十萬敵人的圍追堵截，終於完成了北上的戰略轉移任務。
紅四方麵軍北上靜寧、會寧後，敵胡宗南、毛炳文、王均部一齊向紅二方麵軍猛撲過來。各路敵軍進一步靠攏，控製了西蘭大道，企圖將紅二方麵軍堵截在渭河以南聚殲之。在這種形勢下，如果紅二方麵軍單獨留在陝甘邊界，就有被敵人分割包圍、各個擊破的危險。由於敵情驟然變化，賀龍、任弼時、關向應、劉伯承向中革軍委提議，紅二方麵軍放棄甘南各縣，經天水、寶雞間北渡渭河，轉移到清水、張家川、蓮花鎮地域，一方麵策應紅一、紅四方麵軍會合，同時背靠紅一、四方麵軍，爭取部隊休整、補充。