嘉靖元年（1522）三月，禮部登記大能仁寺妖僧齊瑞竹資財及玄明宮佛像，毀像括金屑一千餘兩。齊瑞竹是武宗正德年間賜玉書金印的大法師，武宗賞賜他的財物，難以數計。至世宗嘉靖時，采納工部侍郎趙璜的建議加以查封毀括。奉世宗之命，禮部郎中屠塤發布檄文，普遍查封禁毀京師諸謠祠（指佛寺），把它們完全拆毀。
七月，嘉靖皇帝開始崇奉道教，逐漸興建寺觀。
嘉靖二年（1523）四月，太監崔文祈禱，引誘世宗在乾清官建禱仙道場，日夜不斷禱祭。又讓內監十幾人研習道教經藏於宮中。大學士楊廷和、九卿喬宇等上疏請求“斥遠僧道，停罷齋醮”①。給事中周瑯、張嵩、張汝、安磐等交章彈劾崔文以邪道誘帝之罪。閏四月，給事中鄭一鵬說，正德十六年以來禱祀繁興，製用漸廣，乾清、坤寧諸宮，各建齋醮，西天廠、西番廠、漢經廠以至於五花宮、西暖閣、東次閣也都設齋醮。或晝夜齋醮，或隔天一齋，甚至一天齋醮兩次。皇帝對儒家經典的學習幾乎全廢。他認為，破壞太平盛業，喪失天下人的期望，莫過於此。他斥責說，挾皇帝行齋醮之徒，必然是魏彬、張銳之輩的餘黨。過去武宗受欺蒙，使得生民塗炭，海內虛耗。先帝已誤，陛下怎能一誤再誤呢！他請求世宗立即疏遠斬殺這些興妖道之人。他還建議，改西天廠為寶訓廠，貯藏列宗列祖遺給後世的各種書籍文獻；改西番廠為古訓廠，貯存五經四書及子、史諸書；改漢經廠為聽納廠，貯存諸臣奏議。委派正派謹慎的官員掌管鎖鑰，這樣一來，皇帝攻讀儒家經典之餘，抽閑暇去三廠覽讀，自然可以成堯、舜之功業了。世宗覽畢說：“天時饑饉，齋祀暫且停止。”②嘉靖五年（1526）讓道士邵元節做“真人”，吳尚禮做“左至靈”。十年（1531）十一月，帝信道教益深，召大學士張孚敬還朝，建祈嗣醮於欽安殿，命禮部尚書夏言充當醮壇監禮使，侍郎諶若水、顧鼎臣充當迎嗣導引官。文武大臣按日進香，皇帝親自行初禮和終禮。十一年（1532）編修楊名上《修省疏》，斥責汪嬤、郭勳助帝齋醮之奸，請求停止禱祀齋醮。世宗大怒，下錦衣獄械訊，幾乎被整死，後被謫戍遠方。十三年（1534）五月，世宗於重華殿，召大學士張孚敬及武定侯郭勳等五人，入觀拜祀天青爵，還作《紀樂同遊詩》。嘉靖十五年（1536）正月，加致一真人邵元節道號，賜玉帶冠服。元節，興安人。仙源範文泰授予《龍圖龜範》，嘉靖初，召入京，對於便殿，元節以“立教主靜”之說進，帝款待厚遇之。不久，因為禱雪靈驗，命作致一真人，領金錄醮事，給玉及金銀象印各一。適逢嘉靖有事南郊，召邵元節分獻風雷靈雨壇，宴於奉天殿，授二品官，並封其師為“真人”。敕令建真人府於城西，建成後，讓夏言作記刻於庭。歲給祿100石，遣緹綺40人充掃除役，增田30頃，免其租徭。至此，寵待益隆。五月，拆除禁中佛殿。建慈慶、慈寧二宮。當時，世宗想除掉佛教殿堂。召武定侯郭勳、禮部尚書夏言入禁中瞻視大服千善殿，有銅鑄像神鬼淫褻的各種姿態。又有金匣藏佛首佛牙及支離傀儡等物約一萬三千多斤。夏言退後上疏力請將其置諸郊野，不能再瀆留大內宮禁之中。世宗認為，這些淫邪物狀，智者不想看，百姓無知，必以奇異供奉，雖然棄之中野，必有暗自挖掘用來蠱惑百姓者，不如搗毀，永遠清除。於是宮禁裏的邪穢物像一律清除。十二月，皇帝命中使到邵元節家鄉貴溪山中建仙源宮。建成後，邵元節請求暫時歸山。不久，世宗派錦衣千戶孫經往貴溪求邵元節歸京師，船到潞河，命中使迎接，賜彩蟒衣及“闡教輔國”玉印。當時世宗因為祈求皇子降生設醮齋祭，早晚都有雲氣見於祈壇。世宗大喜，過了三天，皇子降生，遂錄致一真人邵元節禱祀有功，加授禮部尚書，給一品服俸，賜白金、文綺、寶冠、法服、貂裘。授其徒邵啟為等不同秩祿。嘉靖初年，張顏人賀。皇帝賜以“清心寡欲”對。加封正一嗣教真人，賜金冠、玉帶、蟒衣、銀幣，於是留在京城。不久請求歸山。世宗差人持詔召還，不稱名而稱卿。住宅起火焚壞，又蓋新宅。給事中黃臣勸諫說，過去大師欒巴、郭憲見火起以酒滅火，今張彥宅火壞，還用重新翻蓋嗎？世宗不從。張彥不久死，詔以列侯例封諡，並賜郵典。上尊號“天師永緒”。
嘉靖十八年（1539）八月，致一真人邵元節死。當時嘉靖親自拜祭顯陵。元節留京師，一日晨起，元節招其徒說，我快要死了，怎能再見皇上一麵？話未了，死去。世宗正駐紮在裕州。聽到邵元節死前之言，大慟。手詔敕命行在禮部贈諡號，命中官錦衣護喪還。敕命有司營葬郵典均依伯爵之例。方士陶典真一名陶仲文，黃岡人。小時候作過縣掾，好神仙方術，曾經授符術於羅田萬玉山。邵元節未顯名時，也往來過仲文家。嘉靖初年，陶仲文受遼東庫大使，任滿回到京城。當時邵元節貴幸，年老後曾請求告老還鄉，未得應允。恰值宮中有黑氣出現，邵元節治之不靈驗，就推薦陶仲文代替自己除妖氛。試行於宮禁中，稍能祛除妖氛，世宗格外加寵。此時，護駕南巡至衛輝，白晝有旋風繞駕不散，世宗問陶仲文是何原因？仲文回答說，要身經一次大火。遣陶仲文齋醮禳除此災，陶仲文說，身臨大火之禍，終不得免，但僅可以一人庇護皇上龍體不受傷害。當天夜裏，行宮果然大火被災，宮中死傷人無算，錦衣衛中官陸炳冒火衝入寢殿，背世宗出焰火中，沒有受到任何傷害，果如陶仲文所言。次日，敕命行在吏部授陶仲文“神霄保國宣教高士”爵銜，授予誥印，允許攜眷人宮。九月，世宗諭輔臣說他想令東宮太子監國，靜休一兩年後再親政。太仆卿楊最上疏說：“聖上之所以下此聖諭，不過篤信方士調動罷了。堯舜也曾修性養心，湯、武也曾親身施行仙道，他們不是不懂得修養可以成仙，因為不易成仙，所以不去學習它。難道堯舜之世就沒有仙人，堯舜的智慧不懂得學習？孔子說老子是‘龍’，龍就是仙。孔子不是不知道老子是仙人，不能學習，而是學成仙人不是那麼容易。我聽到您的上諭，開始很吃驚，接下來就感到非常悲傷。我忠心相勸，您端理政務，每日想一想如何治理好國家，不近聲色，保住元陽之氣，不想成仙自然就會成仙，不想長壽自然就會得到長壽，黃白之術，金丹之藥，都會傷元氣，不可信。”世宗看疏大怒。把楊最押赴鎮撫司拷訊，最終死在獄中。八月，萬壽聖節，建三晝夜醮，告玄極殿。郭勳領方士段朝用見世宗，說段朝用能化物為金銀，然後將所化的銀器進獻。世宗大喜說，今日得段朝用真是天之所授。因此授段朝用“紫府宣忠高士”爵號。將他所化銀器薦於太廟，加郭勳祿米100石。十一月，進陶仲文為忠孝秉一真人，負責道教事宜。不久又加少保、禮部尚書，又加少傅，食一品俸。