崇禎元年（1628）正月，禁止宮中穿文繡華麗衣飾，婦女不準戴金冠等。這是聽了禦史梁天奇的諫議後，崇禎帝作出的決定。敕命司禮監典賣魏忠賢田宅。有人請求將魏忠賢宅院加賜功臣。崇禎帝說：“俟東西底定，留賜策以待功臣。”並榜示其宅第為“策勳府”。戶部給事中黃承昊上疏說：太祖時，邊餉銀隻有四十九萬三千八十八兩，神宗時就增到二百八十五萬五千九百餘兩，熹宗時已達三百五十三萬七千七百餘兩。其他京支雜項，萬曆年間歲收不過三十四萬一千六百餘兩，而近年來竟增到六十八萬二千五百餘兩。今戶部開支共五百餘萬兩，而歲入不過三百二十三萬兩，虧空近二百萬兩。這樣邊兵無法不荒疏，而農官也無法不愁怨。請求敕令各邊都撫，清查曆年增餉用度。至於京支雜項，也要切令各衙門自加嚴汰。還建議西北邊塞，應督責當地官府開墾荒田，以定軍餉。
戶部給事中韓一良上言：以前皇上召大臣於平台，有“文臣不愛錢”之語，然而今天世上哪一個地方可以不用錢呢？又有哪一個官員不愛錢呢？韓一良認為，當時的官員，縣官是行賄的首惡，各部給事是納賄之魁。而當今說起蠹民之罪，沒有一個不歸罪於郡守縣令的。然而守令的薪俸又多不到位，又怎能養廉呢？他說，自己上任不到兩個月就辭退賂金500兩。他說自己交友很少，還有賄賂者，其餘官員貪贓情況就可想而知了。他建議嚴懲納賄貪贓者，首惡重辦，使所有官員視錢為汙，懼錢如禍，這樣文官不愛錢的風氣才能樹立。崇禎帝認為韓一良的建議很好，特將中外大臣召集於平台，讓韓一良宣讀他的建議，並予以褒獎，當即提升他做右僉都禦史。
崇禎元年（1628）七月，寧遠兵變。當時四川、湖廣兵駐寧遠的人，因為缺餉四個月，嘩變。其於13營也都響應，變兵將巡撫畢自肅、總兵官朱梅、通判張世榮、推官蘇涵淳捆綁於譙樓上。兵備副使郭廣剛剛到任，收集了兩萬金頒發給部眾，士兵仍不滿足，於是又向商民借了錢共足5萬兩。士兵怨恨稍平，釋放所縛官員。畢自肅引罪自縊。崇禎帝遣袁崇煥前去調解。袁崇煥八月抵山海關，與郭廣商議，先誘首惡張正朝、張思順，讓他們先抓15人斬於市。再斬中軍謀士吳國琦，杖責參將彭簪古，貶黜都司左良玉等人。然後讓張正朝、張思順為前鋒戴罪立功。張世榮、蘇涵淳以貪虐而引發兵變，也予以貶斥。隻有都司程大樂所轄一個營沒有附和嘩變，特予以褒獎。於是寧遠兵變始靖。十月，錦州又發生兵變，袁崇煥請增軍餉。崇禎帝召廷臣議，閣臣求允發增餉。崇禎責成戶部尚書畢自嚴全權辦理。禮部尚書周延儒說：“關門昔防敵，今且防兵。寧遠嘩餉之，錦州嘩複餉之，各邊且效尤。”帝曰：“‘卿謂何如？’延儒曰：‘事迫不得不發，但需求經久之策。’帝頷之，降旨責群臣。居數日，複召問，延儒曰：‘餉莫如粟，山海關粟不缺，缺銀耳。何故嘩，嘩必有隱情。安知非驕弁捕煽，以脅崇煥邪？’帝方疑邊將要挾，聞延儒言大悅，由此屬意延儒”。崇禎此時暗問周延儒，並聽信奸臣之言，對有功邊臣，始生狐疑猜度之心，為後來冤殺袁崇煥種下夙因。
崇禎二年（1629）四月，山陝大饑，起義發生，朝臣捐俸助餉。崇禎帝認為諸臣捐俸助餉是興利除弊，國家受益必多。順天府尹劉宗周說：陛下勵精圖治，召廷臣於文華殿，親理細務，朝令文考，急欲太平盛世速來。然而急功近利，就要見小利而慕近功。他說：朝廷汲汲所求者，邊事也。然而“竭天下之力以養饑軍，而軍愈驕，聚天下之軍以冀一戰，而戰無日，此計之左者矣”。邊塞防守，情況複雜，應從長計議，不應急求數年之效，這樣必會引發相反效果。他又舉例說：“今日所規規於小利者，理財也。民力已竭，司農告匱，而一時所講求者皆聚斂之術，水旱災傷，一切不問。有司以掊克為循吏，而撫字之政絕；大吏以催科為殿最，而黜陟之法亡，赤子無寧歲矣。頃者嚴贓吏之誅，自執政以下坐重典者十餘人，可謂得救時之權。然貪風不盡息者，由於道之未盡善，而功利之見不泯也。”崇禎帝不久又複故大學士張居正蔭，賜故都督戚繼光表忠祠堂。
八月，魏忠賢遺黨王永光、高捷、史堇，陰謀興大獄為魏忠賢及逆黨報仇。就以“擅主和議，專戮大帥”定袁崇煥罪名。還牽連到過去首輔錢龍錫，認為殺毛文龍，是錢龍錫首倡。史擎說：“袁崇煥離京時，以重金數萬賄賂錢龍錫，錢龍錫巧為營幹，轉禍於毛文龍，置國法於不顧。”崇禎覽奏後大怒，敕命刑部官五日內查明此案，案情查明後上報。崇禎帝召諸臣於平台，認為袁崇煥謀叛，當處以極典。群臣認為，斬帥雖錢龍錫開端，但有“處置慎重”等語，本意不在專殺；至於議和之事，首倡於袁崇煥，錢龍錫並未批準。然而軍國大計，兩臣私下商議就去執行，不上疏請示，造成惡果，罪責難逃。“遂磔崇煥於市，兄弟妻子流三千裏，籍其家。崇煥無子，家亦無餘貲，天下冤之”。劉宗周於十月“事稍定，乃上疏曰：‘己巳之變，誤國者袁崇煥一人。小人競修門戶之怨。異己者，概坐以崇煥黨，日造蜚語，次第去之。自此小人進而君子退。中官用事而外廷浸疏。文法日繁，欺罔日甚，朝廷日墮，邊防日壞，今日之禍，實已巳以來釀成之也。”’可見崇禎自錯殺袁崇煥後，對朝廷危害極大，奸臣競進，朝政日暗，明王朝危亡之勢已難挽回。