但實際上周氏兄弟和蔡幫主之間的關係，並不是那種單向單一的，至少現在已經有人撰文講述周氏兄弟對蔡先生的不滿情緒，關於周作人的不滿前麵已經提及，而魯迅這邊呢，可能跟他一時對人際關係的判斷失誤有關係吧。
1927年的時候，蔡元培做了中央研究院院長，魯迅在給同鄉章廷謙（川島）的信中發過牢騷，注意，當時魯迅固定發牢騷的有倆人，除了川島，還有一位就是許壽裳。魯迅說，“我和此公，氣味不投者也。民元以後，他所賞識者，袁希濤蔣維喬輩，則十六年之頃，其所賞識者，也就可以類推了。”這實際上是在講，蔡先生還不夠賞識自己。這一年的十月，魯迅遷居上海，到了上海，他也是先去訪跟蔡不同陣營裏的易培基和李石曾。同年12月，他給章廷謙的信中又說：“太史之類，不過傀儡，其實是不在話下的。他們的話聽了與否，不成問題，我以為該太史在中國無可為。”
但是後來的事實證明，蔡元培的對手，沒有蔡對魯迅好。1927年12月，蔡元培就給魯迅主動送上一個不用上班就可以拿到300元幹薪的特大飯碗：中華民國大學院特約撰述員。一年之後，這個飯碗又在蔣夢麟任部長的教育部裏改名為"教育部編輯費"。
也正是在這種背景下，魯迅於1932年3月2日致信許壽裳：“被裁之事，先已得教部通知，蔡先生如是為之設法，實深感激。惟數年以來，絕無成績，……教部付之淘汰之列，固非不當，受命之日，沒齒無怨。……今所懇望者，惟舍弟喬峰在商務印書館作館員十年，雖無赫赫之勳，而治事甚勤，始終如一，商務館被燹後，與一切人員，俱被停職，……可否乞兄轉蔡先生代為設法，……”
又由於有“蔡先生代為設法”，魯迅的弟弟周建人保住了商務印書館的編輯職位。不過也很奇怪，魯迅碰到這種事情，他不是直接找蔡元培，他都得請許壽裳轉述，不知這算不算一種生活的智慧。
所以說，蔡氏對周氏三兄弟，都是有恩之人，更不用說魯迅去世後，蔡元培擔任治喪委員會主席，並親致悼詞。他撰寫的《挽魯迅聯》中寫道：“著作最謹嚴，非徒中國小說史；遺言太沉痛，莫作空頭文學家。”隨後，蔡元培還出任魯迅紀念委員會主任，積極支持出版魯迅全集，並為《魯迅全集》作序言。這一點，連郭沫若都有過評價說：“影響到魯迅生活頗深的人應該推數蔡元培先生吧！這位有名的自由主義者，對於中國的文化教育界的貢獻相當大，而他對於魯迅始終是刮目相看的。魯迅進教育部乃至進入北京教育界都是由於蔡元培的援引。一直到魯迅的病歿，蔡元培是盡了沒世不渝的友誼的。”這個評價應該說是公正的，雖然郭沫若和魯迅生前同在上海，據說連麵都沒有見過，他們曾是兩個陣營裏的人，但是郭先生後來變換陣營也如同他的才思一樣迅捷的。