切鋸：大的玉璞需要切鋸，這是琢玉工藝的第一步。良渚人是采用何種方法分離玉料並使其基本成型的呢？從出土器物觀察，玉器上留下的工具切鋸痕跡大致有三類：直線痕、拋物線痕、圓弧線痕。直線痕相對簡單，大概是以高硬度石片等片狀硬性物件在玉料上加砂蘸水作往複的直線運動而留下的切割痕。“他山之石，可以攻玉”說的大概就是這層意思。拋物線痕是良渚玉器上所留較多的切鋸痕，如張陵山所出的玉蛙和玉環背麵的切鋸痕便是典型實例。它應是將麻纖維等韌性較大的線狀物結成弓鋸的弓弦，在玉料上往複拉鋸，並不斷添砂加水而留下的切鋸痕跡。用弓鋸來切鋸玉料的方法，在古代乃至近代都有廣泛的運用。漢代的“馬氂截玉”、清代至中華民國時代的“鋼絲絞成的弓鋸”開鋸玉料，用的都是類似的切鋸方法。圓弧線痕在玉器上也有體現。如草鞋山遺址出土的一件大玉璧上，一麵留有6條直徑為21.8厘米的同心圓弧線切鋸痕。
寺墩所出12節玉琮和13節玉琮上所留切鋸痕，似乎也是同心圓弧線，直徑分別為24厘米和12厘米。這是用何種工具或何種加工方法所留下的痕跡呢？明代宋應星在《天工開物》中說：“凡玉初剖時，冶鐵為圓盤，以盆水盛沙，足踏圓盤使轉，添沙剖玉，遂忽劃斷。”當代陳廉貞在《蘇州琢玉工藝》有這樣的描述：“玉璞安放在架上，不時需要蘸水抹砂，並由兩人慢慢拉動鋼絲絞成的弓鋸，把玉解成小塊或片子。如欲琢成一定的形體，那就需用黑線在玉璞上劃上輪廓，用附有利刃的圓鐵鋸裝在轆轤的軸端，玉上蘸抹了砂漿，用腳踏動轆轤，依著黑線，慢慢磋切。至於輪廓曲折凸凹複雜的形體，就需用精粗不同的圓鋸來修琢。”從已知的切鋸玉器方法逆推，良渚文化玉器上所留圓弧線痕或許就是一種類似後代砣即輪鋸切鋸時留下的痕跡。不過這僅是一種推測而言，良渚文化玉器製作中是否已經用砣或類似器具尚有待更多的證據來佐證。
不管采用哪種方法，隻有輔以解玉砂才能達到目的。在良渚文化墓葬中，已發現有當時使用的解玉砂遺存。如江蘇武進寺墩1號墓地的一塊玉璧上鋪有一層砂粒，經鑒定為花崗岩風化殼粗砂粒，主要成分有鉀長石、鈉長石、石英和黑雲母等，其中石英硬度為摩氏硬度7度，高於製琮、璧的玉料。從草鞋山玉璧上縱橫交錯的細密的磨紋看，用作解玉砂的砂粒很小，可能是事先已經過篩選。
鑽孔：良渚文化玉器大多有大小不一的穿孔，那麼這些孔又是如何加工的呢？
據推測玉器上的孔大概是用木棒、竹管、細石器加砂粒蘸水不斷在玉料上旋轉磋碾而成的。良渚時期實心鑽多用於小孔的鑽琢，通常是手執鑽具直接蘸砂碾磨。小件玉器的小孔，用燧石製成的細石器（石鑽、尖狀器）加細砂蘸水兩麵對鑽而成。有些先以燧石鑽對鑽出圓孔，再以線鋸穿入孔內切割而成。玉器的大孔用竹管從兩頭對鑽而成。竹管在旋轉磋碾中容易磨損，從而形成兩頭大、中間小的圓錐形孔壁。兩麵對鑽避免了一麵鑽穿通時的崩裂，但常因兩頭對得不準而造成錯縫，在孔內壁留下台階和鑽槽。
打磨：用形狀和大小不同的礪石把玉器上的鋸切痕或鑽孔的痕跡打磨掉，也是琢玉工藝的一個環節。打磨時同樣加入了顆粒均勻的砂粒，先粗後細，循序漸進。
從技術分析看，當時可能已采用了輪盤研磨技術。這種研磨技術顯然是受到輪製陶器的啟發，從而運用一種圓盤狀可做圓周運動的簡單研磨裝置來研磨玉器。反山20號墓出土玉環上的同心圓旋紋，或許就是當時已使用簡單輪磨機械的證據。
玉器研磨技術與其他琢製工藝一樣，是逐漸進步的，這一點在良渚玉璧器形的演變上得到了較好反映。良渚文化早期和中期的玉璧往往厚薄不均，器表大多留有切割痕跡。到中晚期，則出現了厚薄均勻、器表光滑平整的玉璧。
琢紋：精湛的琢紋技術又是良渚玉器的一絕。良渚玉器的琢紋主要有三種方式：一是淺浮雕結合陰線刻畫，這是最盛行的方法；二是純粹的陰線刻畫，線條纖細而淺顯；三是透雕結合陰線刻畫的鏤雕。淺浮雕可通過利用中介砂研磨減地的手段獲得，透雕是琢孔結合線切割完成的。那麼，刻畫陰線的工具是什麼呢？良渚玉器上的陰刻線往往細如毫發，有的甚至達到了微雕的程度。如彙觀山2號墓出土的一件琮式鐲，在寬僅3.5毫米的凸棱上鐫刻了14條細密的凹弦紋，不借助高倍放大鏡似乎不可能分辨出界限。又如反山出土的“琮王”上的神人的羽冠，以及手、胸和神獸的頭部與前肢都刻畫得生動逼真，線條細如發絲，甚至能在1毫米寬度內精刻出4、5條細線。有人認為隻有天然鑽石才能在高硬度的玉器上琢出這樣的紋線，良渚先民遠征遙遠的蘇北新沂花廳就是為了取得鑽石，因為再向北數10公裏的魯南臨沂一帶就是古代的鑽石產地。江蘇丹徒磨盤墩遺址和新沂花廳遺址先後出土過一些石英質料的小工具，器端尖銳，硬度超過摩氏7度。有學者認為，這類高硬度燧石工具，應當就是良渚人的琢紋工具。也有學者認為，鯊魚牙齒是玉器琢紋的工具，因為在福泉山、反山、瑤山等墓地中出土過鯊魚牙齒。不管運用哪種雕刻方式，當時很有可能采用了複合式工具，如將燧石鑽頭、鯊魚牙齒都裝上把柄成為複合工具而使用。