蒙古軍隊還有異常嚴密的組織，而且調動起來靈活迅速。蒙古的軍隊是根據十進位的體係，即由十人、百人、千人、萬人的部隊所組織而成。各個部隊的人數非常接近，可能是方便應付人員傷亡和損耗。萬人部隊是最大的作戰單位，能依靠自己的力量作持續的戰鬥。這萬名戰士由大汗的一個親戚或親信指揮。兩萬人可組成一軍。另外，大汗親選一萬名“體格矯健，技能好”的人，組成精銳的“護衛軍”，在平時分為四班守衛，戰時隨大汗出征。而被征服的人民會被拆散分派到其他的部隊之中，令其無法組織動員，以避免反叛。蒙古人在極其嚴厲的軍法約束之下作戰並共享戰利品。在戰爭中遺棄戰友會被判處死刑。這種嚴格的紀律，加上英明的領導和有效的組織，讓蒙古人的武力，從騎兵群提升為一支真正的軍隊。
在實戰中，蒙古軍隊還繼承和發展了先人的成功經驗，創造了“大迂回”戰術及“閃電”戰術。蒙古軍的“大迂回”戰術源於蒙古族的圍獵。他們把圍獵中的技藝嫻熟地運用到戰爭中，它不以擊潰敵人就算達到戰爭目的，而是用左右包抄的方式，將敵人包圍，從不給對方留下一條逃生的出路。蒙古軍隊在戰爭中，還經常使用“閃電”戰術。與蒙古軍隊相比，對手通常移動速度緩慢和謹慎，但蒙古人善於尋找機會去分散敵軍的力量，然後集中自己的力量，以快速的襲擊把敵人各個擊破。他們會試圖環繞或包圍敵軍，來製造局部優勢。蒙古的輕騎兵並不能對抗重騎兵的攻擊，所以他們會假裝敗逃來吸引敵軍騎兵的窮追猛打，藉此消耗他們的體力，以降低其攻擊實力。這時，原本走避的蒙古輕騎會突然折回反身成為攻擊者。蒙古軍隊精於設下埋伏和突襲。蒙古軍的將領也最擅長於應用偵察兵，並且在身處劣勢的情況下，通過武力的調動以夾擊敵軍。
後勤保障是戰爭成敗的重要因素，成吉思汗對此非常重視，由於部隊出征時隻能攜帶有限的羊馬，為充分食用這些牲畜，成吉思汗規定了專門的屠殺方法，使這些牲畜易於更長久的保存。據史料記載，成吉思汗差不多每到一處，就在五十、百裏以內各設一驛站，以便於互通信息。在作戰時軍隊之間相互聯絡信號方麵，蒙古軍隊也都采取了妥善的辦法和製定了必要的製度。例如除製定徒步和乘馬聯絡外，用吹號、色旗互相聯絡等。
此外，蒙古軍隊還有一種最有力的武器，就是計劃周詳、時時刻刻對敵人施行的心理戰術。如果蒙古軍隊想攻取的城市不願意投降，那麼，他們最終一定逃不掉屠城的下場。當時最大而興盛的撒馬爾罕和內沙布爾兩城，就由於這個原因先後被夷為平地，居民無一幸免。這個消息傳開後，別的城市就不敢抵抗。但是有的即使投降也不一定能避過厄運。基輔城中的俄羅斯王公投降前雖得到寬大保證，但最後還是給扔在飲酒祝捷的桌下活活壓死。阿富汗西北邊境赫拉特城的居民在聽到赦免消息後走出城外，卻被全部殺死，整座城也被夷為平地。
曾有史學家讚歎：“整個世界上，有什麼軍隊能跟蒙古軍相匹敵呢？戰爭時期，他們像受過訓練的野獸，去追逐獵物。但在太平無事的時候，他們又像是綿羊，生產乳汁、羊毛和其他許多有用之物……”蒙古軍隊在橫行歐亞的過程中，使眾多城池遭到滅頂之災，造成了巨大的經濟破壞，但同時卻打開了東西方文明交往的通道，此間中國古代四大發明中的三項——火藥、印刷術和指南針傳到了歐洲。成吉思汗個人輝煌的成就，也引得古今無數英雄競折腰，從這個意義上講，他不愧為“一代天驕”。
成吉思汗的陵寢為何在“馬背”上？
一代天驕成吉思汗是蒙古帝國的創始人，他不僅創建了有史以來疆域最大的中華版圖，也給後世留下無數的猜想與謎團。《環球時報》上稱其財富位列世界史上前十位，一位蒙古學專家預言：成吉思汗的陵墓裏可能埋藏著大量奇珍異寶，裏麵的工藝品甚至比秦始皇陵出土的兵馬俑還要壯觀。這並非誇大其詞，因為成吉思汗的陵墓裏可能埋藏著他東征西討，從 20多個王國得來的無價珍寶，這也是吸引考古界人士多年來前赴後繼、苦苦尋覓的原因。
但是，一代天驕成吉思汗殞落六盤山後，葬身何地一直是個謎，也是史學界久為爭議的一個問題。難道，真如傳說中的一樣，一代天驕成吉思汗的陵寢位於“馬背”之上，到處移動，難覓其蹤？
現存的成吉思汗陵園在伊金霍洛旗，隻是一個衣冠塚，號稱“八白室”。八白室顧名思義是由八間白色的建築構成的，建築雄偉，具有濃厚的蒙古民族風格。“八白室”原來是八座白色的氈帳，後來的蒙古人為了祭祀成吉思汗而為他建立了一座馬背上的陵園。氈帳裏供奉著成吉思汗的遺像，象征著墓地。這樣的陵園既便於遷移，也便於祭祀，很符合遊牧民族到處遷徙的特點。“八白室”遷移多處，最後遷到鄂爾多斯草原的伊金霍洛旗，裏麵有他的衣服、家譜，據說還有成吉思汗逝世前的最後一口氣的靈魂也在靈塔裏。但成吉思汗死後的遺骨究竟葬於何處，到現在為止還不能完全確定，這也成為了一個千古之謎。