多爾袞入關後，接受漢族先進文化，表現出開明的一麵。他依仿明製，重用漢人。多爾袞認為“古來定天下者，必以網羅賢才為要圖”，清朝入關，百廢待舉，非漢人不能治理中原地區。在國家的軍政大事上，他倚重漢官範文程、洪承疇、馮銓等人，在他們的謀劃下，清朝製度基本沿用明朝。這也就是史家通常所說的“清承明製”。
此外，為了化解滿漢矛盾，多爾袞大力宣傳滿漢一體，鼓勵滿漢通婚。福臨選漢官女為六宮嬪妃，恪妃就是其中之一，她是灤州人，吏部侍郎石申的女兒，居永壽宮。在皇帝的表率下，鼓勵滿漢官民互相婚娶。滿漢矛盾的激化，歸根結底是因為滿族貴族對漢族實施的一係列民族壓迫政策，這不是僅憑鼓勵通婚就能夠緩和的。但多爾袞提出“滿漢一家”的思想，還是難能可貴的。
此外，他致力於平反冤獄，化解矛盾。努爾哈赤、皇太極統治時代，由於內部爭權奪勢，一些宗室貴族被囚禁、處死，子孫弟侄受到株連。幾十年中，積怨越來越深，渙散了皇族內部的凝聚力，削弱了統治效能。清朝定鼎北京後，國家百廢待興，迫切需要皇族成員的同心同德。多爾袞敢於平反父、兄鑄成的冤獄，通過起用被削爵者子孫並恢複其宗籍的辦法，化解固有矛盾。這是很需要一些魄力的。
在皇族內部，積怨最深的莫過於努爾哈赤與舒爾哈齊兩家。從努爾哈赤殺死其弟舒爾哈齊，到皇太極囚死其堂兄阿敏，在豆萁相煎的表象背後，是一個家庭對另一個家庭的永久勝利。何況皇太極並沒就此罷休。崇德四年（1639年），皇太極重提當年阿敏對己不敬、欲將本旗拉出分立的往事，下令削除阿敏第三子固爾瑪琿的爵位，黜去宗籍，同時被黜的還有他的弟弟恭阿。多爾袞攝政後，首先恢複了舒爾哈齊諸孫的宗籍。固爾瑪琿複封輔國公，因家貧又賞銀三千兩，晉爵固山貝子。弟恭阿封鎮國公。這為舒爾哈齊的平反開了一個好頭。順治十年（1653年），舒爾哈齊在死後43年終於被重新恢複榮譽，追封和碩莊親王。
努爾哈赤的長子褚英被賜死後，子孫一蹶不振。崇德七年（1642年），褚英的孫子杜爾祜、穆爾祜、特爾祜因“心懷怨望”的罪名，被皇太極革去公爵，黜宗室籍，幼子薩弼也受株連。多爾袞使杜爾祜兄弟重入宗籍，並恢複封爵。杜爾祜後晉封多羅貝勒，穆爾祜、特爾祜、薩弼晉固山貝子。
努爾哈赤第二子代善的兒子瓦克達，因事被廢宗籍，多爾袞也恢複了他的宗籍。代善的孫子阿達禮因謀立多爾袞為帝被誅，其弟勒克德渾受到牽連，被削去宗籍，廢為庶人。多爾袞恢複了他的宗籍，封為貝勒。勒克德渾後以軍功晉封順承郡王，後世“世襲罔替”。
多爾袞攝政期間，為這些身敗名裂的貴族子孫恢複宗籍，封給爵位，孤立了潛在的對手，也擴大了自己的勢力。褚英的兒子敬謹親王尼堪，代善的兒子巽親王滿達海，阿巴泰的兒子端重郡王博洛，舒爾哈齊孫子鞏阿岱、錫翰等人都成為多爾袞的親信，並不因為他們都是生性諂媚的小人。鞏阿岱、錫翰對多爾袞言聽計從，最為忠誠，後來因多爾袞“謀篡”一案被誅殺。
但是由於威服自專的秉性，多爾袞在為宗室平反昭雪的同時，政治上誅除異己，又在皇族內部引發出新的矛盾，製造出新的冤獄。這突出表現在對肅親王豪格的迫害上。多爾袞與豪格爭位一事雖以雙方妥協解決，但多爾袞對豪格一直存有戒心，想方設法削弱他的勢力。早在順治元年（1644年）三月，多爾袞就以豪格“圖謀不軌”，削去他的王爵，奪所屬七牛錄人員，罰銀五千兩，廢為庶人。當時豪格仍有很大勢力，不久又恢複了他的王爵。順治三年，多爾袞派豪格為靖遠大將軍，統兵往四川鎮壓張獻忠大西軍。五年，豪格凱旋回京，沒有舉行盛大的歡迎儀式。緊接著，多爾袞就以豪格犯有包庇部屬、冒領軍功等微小罪名，將他囚禁，沒收全部財產。豪格義憤填膺，數日後死在獄中。接著，多爾袞興起大獄，對反對過自己的開國功臣及其子弟橫加迫害。
曆史上的專製統治者，總是在重蹈冤冤相報的覆轍。一麵在為前輩君主製造的舊冤獄平反，一麵又在誅除異己的過程中製造新的冤獄。這樣的例子，不勝枚舉，即便如多爾袞般雄才大略，也無力擺脫這個怪圈。
多爾袞主持朝政七年，功績顯赫，但同時也鑄就了三大弊政：
一是強迫漢族剃發易服。多爾袞頒布“剃發易服”令，強迫漢人剃發，改從滿族發式，作為降順的重要標誌。同時，規定漢人必須著滿式衣冠。
當時有一個說法，叫做“留頭不留發，留發不留頭”。強迫剃發易服，是對漢族傳統習俗的嚴重破壞，必然引起強烈的反抗。朝鮮《李朝實錄》記載：“入關之初，嚴禁殺掠，故中原人士無不悅服。及有剃頭之舉，民皆憤怒。”江南等地漢民的反抗尤其強烈，遭到清軍的殘酷屠殺。
二是占房圈地，引發民族矛盾。
三是強迫投充，抓捕逃人。這兩項前麵已經說過，不再贅述。