1968年，七機部的混亂達到了頂峰。
6月8日，冶金學和航天材料專家姚桐斌在家中被造反派毆打致死。姚桐斌1945年畢業於上海交通大學，1951年獲得英國伯明翰大學博士學位，1957年回國後，一直致力於航天材料科學，被譽為中國第一代航天材料工藝專家和技術領路人。
這位後來被追授“兩彈一星功勳獎章”的專家之死，讓周恩來悲憤難抑。據說周恩來正參加一個外交宴會，有人把姚桐斌被打死的消息通報給他，他當即變色，手中的酒杯掉在地上，摔碎了。這恐怕是周恩來一生外交生涯中少有的失態。
10月10日深夜，長期遭受迫害難以忍受的趙九章寫完最後一份檢查，上交了家中最後一件屬於公家的東西——一塊小黑板之後，服下大量安眠藥自殺。
本來，周恩來為了保護包括趙九章在內的一些科學家，國慶節前親自擬定了邀請科學家參加國慶活動的名單，其中就有趙九章，而且是以他本人的名義發出的請柬。但是趙九章沒有接到這份也許能救命的請柬。後來一查，是科學院的造反派私自扣下了。
聽到趙九章自殺的消息，周恩來的氣憤之情難以言表，他的兩眼似乎冒出火來，瞪著天花板，半天沒有動……
趙九章是1935年通過庚款考試出國留學的，他去了柏林大學學氣象，他堪稱是中國空間科學的重要奠基人。
10年後，趙九章終於得到平反昭雪，開追悼會時，竟然找不到他的骨灰，骨灰盒內裝著的，是他生前戴過的一頂帽子。
1968年12月5日，傑出的空氣動力學家郭永懷赴羅布泊執行完又一次核試驗任務，從基地返回北京時，因飛機失事，不幸遇難。
本來，郭永懷是和王淦昌、朱光亞、陳能寬、鄧稼先等人一塊執行任務的，別人勸他坐火車，他為了省時間，執意坐飛機，火車太慢，到北京要好幾天。還說自己作為一名空氣動力學家，應該帶頭坐飛機。沒有想到，這成為永訣。
郭永懷犧牲時，懷裏還緊緊抱著一個保密包，都給燒焦了。與他一同遇難的，有40多人。這次飛機失事，沒有對外報道。
郭永懷的離去，令周恩來極度悲痛，他說：“我再次強調，以後我們國家重要的科學家，盡量不安排坐飛機，更不要集中乘坐飛機。”
錢學森與郭永懷感情深厚，二人情同兄弟，得知郭永懷遇難，錢學森淚流滿麵，他沉痛地說：“一個有智慧的人，一位世界知名的優秀力學家，離開了人生。生和死，就那麼10秒鍾。他才59歲……”
幾天後，錢學森、李覺、王淦昌、朱光亞、彭桓武、陳能寬、鄧稼先、於敏、周光召等人來看望郭永懷夫人李佩，錢學森握著李佩的手，悲痛不已地說：“回國後，我和永懷一起開創中國力學事業，原子彈攻關時候，我向錢三強推薦了他。永懷為中國核武器，立了大功。我們失去了一位好同事，好朋友，好戰友，國家失去了一個棟梁之材。”
李佩冷靜而堅強地對眾人說：“永懷說過，他對自己任何選擇，都不會後悔。如果他有來世，我相信，他還會選擇這個職業，選擇和你們各位做同誌，做兄弟，做戰友，一起為國家幹事情。”
眾人的眼裏，都是熱淚滾滾。