11月27日，劉鬱芬、趙席聘、戴靖宇同來河州。馬鴻賓等經多次會議，馬廷賢又提出以下就撫條件：
（1）西軍與起事回民分別收撫，即變兵屬西寧者由西寧收編，屬甘州者由甘州收編。原有二十七師（馬廷勷部原有番號）仍準存留舊部。其餘回眾雖多，槍支甚少，分別遣散。（2）改編後以導河、寧定、洮岷等地為駐紮地點，六個月後服從調遣。（3）保護起事頭目生命財產。（4）保護各處回教商民。（5）戰時被毀回教寺院、學校、拱北，由政府協款重修。（6）被毀回民房舍修補時，由政府酌予補助。（7）在蘭被押之眷口及關係人一律釋放。
劉鬱芬認為此項條件，儼然以戰勝者姿態，向政府要挾，實屬難堪。同時，馬麒見時機已到，也來電向劉表明心跡。略雲：“馬廷賢、馬仲英等阻兵抗撫，逆情昭著，早為路人所知。其對麒等不僅信口誣蔑，且複多方傾軋，肇亂已來，受侮不少。……為今之計，擬請采麒前議，電令各使，分途解散，隨撫就結，庶免團聚。並乞分別嚴電限期肅清，不得意存觀望。”他分明又成了馬仲英起事的受害者，完全站在國民軍的一邊了。個中就裏，劉鬱芬豈能不曉？不過，既然轉了過來，樂得多一助力，又何必戳破這層紙！是時，國民軍駐蓮花堡防地，又被馬仲英部突破，國民軍所有師旅長一致主戰，劉鬱芬遂決定停撫言戰。
在此期間，國民軍在河州集結的，有第二、第七兩方麵軍的十一師、十六師、二十一師、二十五師、三十師，共約6萬之眾（官方公布的數字）。劉鬱芬於11月29日下總攻擊令，劉親赴北塬督戰。佟麟閣率部由河州進攻西川正麵，劉兆祥率部由蓮花堡進攻側麵。當天下午占領大小香台塬、井溝等地，馬仲英率眾退向韓家集、雙城一帶。30日下午，國民軍又占韓家集。12月3日，馬仲英部漸呈總崩潰之勢，開始退出河州。國民軍在進攻中，沿途殘酷燒殺，進攻西鄉之一路，又發掘了馬廷勷未盡的窖藏。陳毓耀、劉兆祥、李鬆昆等部在大東鄉，捕殺了許多戰爭參加者，並在北莊石家溝截殺避難婦幼老弱2000餘人，不少房屋被燒。
馬仲英離開河州，劉鬱芬開始進行“安輯工作”。發出布告，說明用兵之“苦衷”。召告“回漢脅從民眾，如限於12月30日以前繳械投誠者，一概不追既往，並予保護。倘仍藏匿迷抗者，當按盜匪治罪。並嚴禁仇殺。所有以前搶奪婦孺，無論回漢，各歸原主”。12月6日成立“甘肅導河安輯委員會”，孫連仲任委員長，馬鴻賓任副委員長，馬玉清、喇世俊、駱力學、徐昭烈等13人為委員。任戴靖宇為河州衛戍司令。又成立“清理河州逆產委員會”，宣告對馬廷勷、馬廷賢、馬仲英、馬海淵、馬景良、馬鳳祥、韓進祿等的土地、房屋、森林、畜牧、果園、鋪麵、油坊等，一律清查沒收，歸為公有。12月14日，陝甘剿匪總司令部，發出懸賞緝捕馬廷賢、馬仲英的通令。據另一記載，懸有賞格是：“有生擒馬廷勷者，賞洋五萬元，有戮其屍將頭來獻者賞洋兩萬元；有生擒馬廷賢、馬仲英者各賞洋兩萬元，有戮其屍將頭來獻者賞洋一萬元。”馮玉祥在論功行賞中，對有功的門致中、佟麟閣、張允榮、陳毓耀、劉兆祥、樊曼雲等，給予“革命獎章”，各記“大功”一次。劉鬱芬對堅守6個月未破的寧河堡，派專員前往慰勞，但對其中嗷嗷待哺的難民卻僅口惠而已。
五、竄擾隴南
1928年12月初，馬仲英率眾出槐樹關，撤離河州，時馬仲英與馬廷賢意見已不統一。馬廷賢打算丟開部隊，逃往四川，另謀出路。馬仲英則想回西寧地區繼續抵抗，即率部走向臨潭。馬廷賢令其部眾在韓進祿率領下，隨馬仲英前進，自己挈帶妻孥財貨隨後慢行。馬仲英到臨潭舊城，與卓尼土司楊積慶商洽未妥，遂將其駐在臨潭的白連升隊解決，殺數十人，又殺警察數人。後到卓尼，燒毀卓尼寺一部分，又進駐岷縣。時馬廷賢行至完禾兒溝，被藏兵劫掠，殺死男女8人，未死之婦女被掠去，馬廷賢隻身逃走，請馬仲英為其報仇。馬仲英複自岷縣返臨潭，對斜藏溝、完禾兒溝等地燒殺兼施，以泄其忿。1929年元月14日馬仲英再到卓尼，焚毀著名的禪定寺。韓進祿所率馬廷賢部在岷縣、禮縣間的閭井地區，與多年盤踞在這一帶的悍匪王占林、馬應彪等會合。旋因部隊過多，勢難長期在此屯聚，乃商談進軍路線。馬仲英主張過隴西轉入寧夏；韓進祿則主張東撲天水進據隴南。意見不一，遂分途行進。馬仲英到達隴西城，圍攻不下，國民軍吉鴻昌部馳至救援，馬仲英仍退回岷縣。韓進祿陷秦安，又欲進據天水城，吉鴻昌已先從隴西馳至，入城後，偃旗息鼓，僅令民兵守城，以示空虛。韓進祿撲近城邊，吉鴻昌部即槍炮齊鳴，突然反擊。韓進祿敗退，走投無路，隻得折轉向西，跟隨馬仲英走向岷縣、臨潭。國民軍吉鴻昌、馮安邦等部尾追，馬仲英等走向拉卜楞寺。