喇家遺址最突出的看點是遺址東北部高地上發掘出來的數座房址。它們在形式上都是齊家文化中比較平常的居址，、白灰麵半地穴式建築，保存有不太高的牆壁，但與眾不同的是，在這些殘破的房址內卻發現大量的人類遺骸。特別是4號房址內，在麵積隻有14平方米的室內，發現人骨多達14具。人骨呈不規則姿態一組組地分布在居住麵上，有的匍匐在地，有的側臥一旁，有的相擁而死。中心灶址處有一個成年人兩手高舉過頭頂，雙腿為弓步，死亡時身體還未完全著地，像是要托起即將倒塌的房頂的樣子。西南部有5人集中死在一處，其中4個是年少的兒童，另外一個年長的成年人似在用雙手護衛著身下的4人，5人或坐或倚或側。頭顱聚攏在一起。在7號房址內。室內西側還發現一個成年個體的下肢骨，而上肢骨骼在門道內。在室內中部還有一副兒童骨架，也俯臥於地麵上，骨架被向下壓平。室內東壁和西北角都保存了大量本為完整的陶器，皆被壓成了碎片。
最讓人震驚的是幾座房址中幾對“母子”形象。3號房址中的一對“母子”在房址的東牆邊，母親雙膝跪地，用雙手摟抱著幼兒，幼兒依偎其懷中，雙手也緊摟著母親腰部，顯示出十分恐懼的樣子。母親臉部向上，頷部前伸，像是在向蒼天祈求生路。4號房址內的母親屈膝倚牆坐在地上。懷中緊緊抱著孩子，臉頰緊緊貼著孩子的頭，孩子同樣用雙手緊緊抱著母親的腰。7號房址中，也發現一對“母子”，位於靠近門道的地方，俯身於地，骨骼因受壓而緊貼地麵，成人骨架折曲成V字形，兒童骨架位於成年人身體與手臂下麵，像是大人護著小孩向屋外逃脫不及而死於室內。
經過鑒定，在房址內抱著孩子的長者都是女性，年齡都在30歲上下。最小的孩子隻有2歲。3、4號房址的16人中男性隻有3人，其中2人都是18歲以下的未成年人，隻有1人年過40，屬於典型的幼弱婦孺群體。然而人骨DNA的鑒定結果卻出乎所有人的意料：其中兩對成年人與兒童卻並非母子關係！
這麼多未成年人，顯然不是出自同一個家庭。是臨時集中到了這些房子裏，而從人骨呈現的不規則姿態上看，都是意外死亡。可見當時確實發生了某種大的災難，使得這些尋求避難的人們終於在劫難逃。
究竟是什麼災難在4000年前的某一天降臨到了這裏呢？研究人員通過遺骸上覆蓋的棕紅色黏土找到了初步的答案。這些黏土形成於流水作用，都夾有較多的細小波狀沙質條帶，具有“漫洪沉積”的特征，與當地河流泛濫時洪水帶來的堆積性質相近，是黃河泛濫的產物，由此可推斷是洪水泛濫時，洶湧的洪峰衝上河邊台地，也湧進了當時居民的半地穴式建築裏，用泥沙淹埋了滯留在房子中的全部婦女兒童。因此黃河異常洪水是喇家遺址毀滅的主要原因。
然而接下來的研究卻表明，情況卻不這麼簡單，簡直是禍不單行，因為在洪水之前還發生了強烈地震以及山洪暴發等自然災害。在喇家遺址附近，地裂縫、沙管和地麵變形等古地震遺跡分布特別多，地裂縫有數十處，最大的一條寬0．5米，深1．5—2米，長約40米。覆蓋人骨的棕紅色黏土中也發現了大小不等的棕黃色粉沙團塊，也屬於地震造成的房屋倒塌跡象。根據這些地裂縫，沙管、沙堆的形狀和分布特征及粉沙團塊形成特點，可以肯定在洪水到來之前的幾個小時到一天的時間裏地震已經將喇家人的房屋建築全部摧毀了，把村裏人都埋在裏麵。而且在地勢較低的遺址南部土層裏，研究人員還找到很多沙質“透鏡體”，包含齊家文化的陶、骨和玉器等殘片，屬於古山洪堆積，表明在地震之後、洪水來臨之前山洪又衝毀了部分村落。因此關於喇家遺址史前災難一個比較完整的認識就是：首先遭受地震攻擊，房倒屋塌，然後受山洪侵襲，最終到黃河異常漲水、漫上台地，將整個遺址完全淹沒。
喇家遺址的史前災難遺跡，在中國尚屬首次發現，在國外也很少見於報道，是震驚世界的考古重大發現，被譽為“東方的龐貝古城”。它有世界末日般的壓抑氣氛，但更多的是透射出無比高尚的真情和愛心，體現了災難來臨之時，人們護佑幼小、相互友愛的情景，彰顯了一種原始的人性美。它是一幕封存了4000多年的人類悲劇。也是曆史發展的精確定格，對於探討西北地區古代文化變遷具有重要意義。