吳又可還提出，瘟疫病有強烈的傳染性，不論是年老體邁的老人還是身強體壯的年輕人，都很容易感染瘟疫。並且在人和動物之間有著同等的機會感染瘟疫，有些瘟疫病可以在人和動物之間來回的傳播。導致這些瘟疫的戾氣也是不同的，不同的戾氣導致的瘟疫的臨床表現也是不一樣的。吳又可畢生從事醫學，治愈了很多傳染病患者，其中有難以治愈的疑難雜症，同時吳又可還往往是出奇製勝。相傳有一天，來了一位患者，這位患者被認為是傳染病患者，大便不通，脘腹脹滿，疼痛難忍，四肢強直不能動，臥如塑，目閉口張，舌強，問話不能答，脈實有力，苔生芒刺。根據證候，是一派實熱象，病情危重。據患者兒子代訴，三日來已服承氣湯三劑，每劑大黃用至一兩左右，病仍不減。一般醫家，遇到此況，一定會考慮另立治法的。然而，吳又可則不然，他仔細權衡了患者的脈症，認為“下證悉具，藥輕病重也”，不但不改方劑，反而將方中大黃增至一兩五錢，連服半月而痊愈。吳氏用藥之妙，可見一斑。
《溫疫論》，成書於公元1642年，是吳又可惟一一部傳世之作，共二卷。卷一載論文50篇，主要闡發溫疫之病因、病機、證候、治療，並從中參論溫疫與傷寒的區別。卷二載論文30篇，著重敘述溫疫的各種兼挾證治，還設立了多篇有關溫疫的質疑正誤及疫癘證治的辨論文章。
《溫疫論》對後世的影響很大，清代一些著名醫家如戴北山、楊栗山、劉鬆峰、葉天士、吳鞠通等，都或多或少地在《溫疫論》的基礎上有所發揮，有所創造。我國曆代醫家在與傳染病鬥爭的實踐中創造了溫病學說。溫病學說，淵源於《內經》，孕育於《傷寒論》，產生於金元，成熟於明清。在溫病學說的發展過程中，《溫疫論》作為我國第一部治療傳染病的專著的貢獻是很大的。直至今天，我國應用溫病學說的理、法、方、藥治療一些傳染病，如流行性乙型腦炎、流行性感冒、麻疹、猩紅熱、痢疾等，取得了很高的療效。
清代溫病四大家
溫病一詞，最早出於《素問》，以後的《傷寒論》、《難經》、《諸病源候論》、《備急幹金要方》等皆有記載。明代多次爆發大瘟疫。吳又可通過深入細致的臨床體察，明確指出溫疫並非傷寒，而創立一套辨證論治的方法，成為辨治外感溫熱病的新學術流派。清代中期以後，溫病學派日趨壯大。葉天士、薛雪、吳鞠通、王孟英等成為該時期的代表人物，並稱溫病四大家。
葉天士（1667—1746），名桂，號香岩，別號南陽先生，晚號上津老人，江蘇吳縣人，清代傑出的醫學家，是溫病學派的主要代表人物之一。葉天士出生在一個醫學世家，他的祖父、父親都精通醫術，尤其精通兒科。從12歲葉天士就開始跟隨父親學醫，14歲時，他父親辭世，於是拜他父親的門人朱某為師，學習醫術。十年的時間裏，葉天士拜了17位老師，因為他懂得融會貫通。所以他的進步突飛猛進，開始以兒科為主，後因師從多人，從而擴展至各科。
葉天士是清代眾多溫病學家的代表，被譽為“溫熱大師”，他創立的溫病衛氣營血辨證論治綱領，為溫病學說理論體係的形成奠定了堅實的基礎；他在治療雜病方麵成績也很突出，他提出的許多新見地和治法方藥，在今天的臨床上仍具有重要的指導意義和實用價值；由他口授、學生顧景文記錄整理的《溫熱論》是為溫病學奠定學科基礎的重要著作。
在《溫熱論》一書中，葉天士首先闡述了溫病的致病因素、感邪途徑、邪犯部位、傳變趨勢和治療方法，他明確提出了導致溫病的主要原因是感受了溫邪，突破了曆代醫家“伏寒化溫”的認識，從而真正擺脫了熱病皆傷寒的束縛，這就從根本上把溫病和傷寒區分開來。葉天士把感受溫邪的途徑概括為“溫邪上受，首先犯肺”。他又提出“衛氣營血”的辨證論治和“辨舌驗齒”等溫病獨特的診斷方法，從而形成了較完整的溫病學理論診治體係。
葉天士畢生醫案很多，有《溫熱論》、《臨證指南醫案》、《葉氏醫案存真》、《未刻本葉氏醫案》。但都不是他親筆著述，大都由他的門人整理而成。另外，還有一些著名的醫案和著述托名於葉天士，可考的有《景嶽全書發揮》、《葉氏醫衡》、《醫效秘傳》、《本事方釋義》、《女科症治》等等。
薛雪（166-1750），字生白，號一瓢、槐雲道人、磨劍道人、牧牛老朽，江蘇吳縣人，與葉天士是同鄉且與之齊名，但是二人常相互抨擊，所以薛雪稱自己的住所為“掃葉山莊”，稱自己為“掃葉山人”。
薛雪自幼好學，很有才氣，後來因為母親多病，從而潛心研究醫學，他一生的著作很多，有《醫經原旨》、《濕熱條辨》、《掃葉莊醫案》、《溫瘧論》及《日講雜記》等，他對溫病中的濕熱病症很有研究。在著作中專門對濕熱病證的病因病機、辨證治療進行了比較全麵、係統地分析和討論，特別是對濕熱之邪在上、中、下三焦的辨證和治療進行了係統論述。從而進一步充實、完善了溫病學的內容。