從11月11日開始，各代表團對大會主席團通過的中央委員會委員、中央委員會候補委員、中央紀律檢查委員會委員候選人預備人選名單進行了充分的醞釀。11月12日下午和13日上午，十六大各代表團分別對中央委員會委員、中央紀律檢查委員會委員和中央委員會候補委員進行了預選。預選采用差額選舉辦法。整個預選工作在預選監票人的監督下，嚴格按照大會選舉辦法進行。
6．大會舉行全體會議選舉新的中央委員會和中央紀律檢查委員會，通過各項決議
11月14日上午9時，中國共產黨第十六次全國代表大會在北京人民大會堂舉行全體會議，在江澤民主持下，大會以鼓掌的方式，通過了兩名總監票人和36名監票人名單。隨後，他們檢查了票箱。9時8分，工作人員開始發放選票。每位代表共領取3張選票，紅色選票上是中央委員會委員候選人名單，橘黃色選票上是中央委員會候補委員候選人名單，淺粉色選票上是中央紀律檢查委員會委員候選人名單。經過填寫選票和投票、計票，11時許，出席大會的2132名代表選舉產生了新一屆中央委員會和中央紀律檢查委員會。通過關於十五屆中央委員會報告的決議（草案）、關於中央紀律檢查委員會工作報告的決議（草案）和關於《中國共產黨章程（修正案）》的決議（草案）。
從中央委員會的組成人員看，除黨和國家領導人外，中央委員和候補委員分布於中央、國家機關，中央金融機構，國有重要骨幹企業，省區市和軍隊。其主體是省部級和大軍區級領導骨幹，也有地市級和軍隊軍級領導幹部及各方麵優秀人才。各方麵代表性人士33名，占9.3%。女幹部27名。少數民族幹部35名。尤其引入矚目的是，新進人中央委員會的委員和候補委員180名，占一半以上。十六屆中央委員會委員和候補委員，全部是新中國成立後參加工作的同誌，其中有一些是改革開放以來參加工作的年輕幹部。平均年齡55.4歲。50歲以下的占五分之一以上。具有大專以上文化程度的占98.6%。
中國共產黨第十六次全國代表大會在選出新一屆中央委員會、中央紀律檢查委員會，並通過關於十五屆中央委員會報告等決議後，11月14日上午在北京人民大會堂勝利閉幕。
7．十六屆一中全會召開，選出新的中央領導機構，順利實現新老交替
2002年11月15日，中國共產黨第十六屆中央委員會第一次全體會議在北京舉行。出席會議的有中央委員198人，候補中央委員158人。中央紀律檢查委員會委員列席會議。胡錦濤主持會議並作了重要講話。
全會選舉了中央政治局委員、候補委員，中央政治局常務委員會委員，中央委員會總書記；根據中央政治局常務委員會的提名，通過了中央書記處成員；決定了中央軍事委員會組成人員；批準了中央紀律檢查委員會第一次全體會議選舉產生的書記、副書記和常務委員會委員人選。名單如下：
一、中央政治局委員、候補委員中央政治局委員（按姓氏筆畫為序）
王樂泉、王兆國、回良玉（回族）、劉淇、劉雲山、李長春、吳儀（女）、吳邦國、吳官正、張立昌、張德江、陳良宇、羅幹、周永康、胡錦濤、俞正聲、賀國強、賈慶林、郭伯雄、黃菊、曹剛川、曾慶紅、曾培炎、溫家寶
中央政治局候補委員
王剛
二、中央政治局常務委員會委員
胡錦濤、吳邦國、溫家寶、賈慶林、曾慶紅、黃菊、吳官正、李長春、羅幹。
三、中央委員會總書記
胡錦濤
四、中央書記處書記
曾慶紅、劉雲山、周永康、賀國強、王剛、徐才厚、何勇
五、中央軍事委員會主席、副主席、委員主席
江澤民
副主席
胡錦濤、郭伯雄、曹剛川
委員
徐才厚、梁光烈、廖錫龍、李繼耐
六、中央紀律檢查委員會書記、副書記、常務委員會委員
書記
吳官正
副書記
何勇、夏讚忠、李至倫、張樹田、劉錫榮、張惠新、劉峰岩
常務委員會委員（按姓氏筆畫為序）
幹以勝馬文（女）馬誌鵬王振川劉峰岩劉家義
劉錫榮李至倫吳官正吳毓萍（女）何勇沈德詠
張樹田張惠新趙洪祝夏讚忠黃樹賢解厚銓
新的中央委員會和中央紀律檢查委員會及其中央領導機構的誕生，標誌著中國共產黨順利地實現了中央領導層的新老交替。
十六屆一中全會結束後，新一屆中央政治局成員立即舉行了新聞記者見麵會。胡錦濤在講話中說，中國共產黨第十六次全國代表大會，已於昨天閉幕。大會開得很成功，這是一次團結的大會、勝利的大會、奮進的大會、繼往開來的大會。他代表新當選的中央領導機構成員，感謝全黨同誌的信任。他說，我們一定不辜負全黨同誌的重托和全國人民的期望，高舉鄧小平理論偉大旗幟，全麵貫徹“三個代表”重要思想，認真落實十六大提出的各項任務，緊密團結和依靠全黨、全國各族人民，繼往開來，與時俱進，為全麵建設小康社會，加快推進社會主義現代化，開創中國特色社會主義事業新局麵而努力奮鬥。十六大把“三個代表”重要思想同馬克思列寧主義、毛澤東思想、鄧小平理論一道，確立為我們黨要長期堅持的指導思想，這是一個曆史性的決策，也是一個曆史性的貢獻，為我們指明了前進的方向。江澤民同誌在十六大所作的報告，係統總結了十三年來的基本經驗，全麵闡述了貫徹“三個代表”重要思想的根本要求，明確提出了在本世紀頭二十年我們黨和國家的奮鬥目標，以及經濟、政治、文化、國防、祖國統一、外交和我們黨的自身建設等各方麵的方針政策。所有這些，都體現了中國共產黨全黨的意誌，代表了全國各族人民的願望，是我們黨在新世紀新階段的政治宣言和行動綱領。我們新一屆中央領導集體將堅定不移、一以貫之地貫徹執行。