有兩個主要的原因：①血中尿酸的排泄主要通過腎髒，75%～80%的尿酸是由腎髒排出，20%左右的尿酸經由膽道入腸道，隨糞便排出。其他器官如肺、胰等幾乎不排泄尿酸，所以尿酸易在腎髒內沉積形成腎結石。尤其是血中尿酸濃度過高超過腎髒的排泄能力時，腎髒痛風石更容易發生。②尿酸沉積與局部組織環境的酸堿度有關（即pH）。當局部偏酸時，即pH偏低時尿酸容易沉積形成結石；當局部偏堿時，即pH偏高時，尿酸不易在局部沉積。正常人血液pH為7.35～7.45（中性）。肝、肺、心、腦等組織的pH與血液相近，而且又不是尿酸排泄的場所，所以尿酸不易沉積形成結石。而腎髒是尿液形成的場所，尿液的pH一般在5.5～6左右，呈酸性，加上尿酸主要由尿中排出，所以易在腎髒內沉積而形成結石。有時則在輸尿管及膀胱內沉積形成結石。當然，在少數情況下，痛風石也可在大血管壁、心內膜及膽道內形成，但這種病例是極少見的。