周立波在“文化大革命”中遭受劫難，作品也被汙蔑為毒草無法出版。1977年，《暴風驟雨》終於再次出版，作者在後記中說：“我隻刪去了幾句，並在全書文字上略有改動。”這次版本變動上最大的特點就是進行了潔化處理，對某些涉及兩性關係的段落進行了大刀闊斧地刪除。第一節中老孫頭談到土匪的胡作非為“白日放哨，下晚紮古丁，叫娘們把褲子脫光，還得站起來，給他們瞅瞅，真不是人作得出的呀”（1956年版，9頁）。在新版本中把侮辱女性的細節去掉，簡化為“還糟蹋娘們，真不是人”（1977年版，9頁）。1956年版本中，在鬥爭會上韓老六嬉皮笑臉地承認自己玩弄過十幾個婦女，借此機會轉移鬥爭會中群眾的注意力。1977年的版本中，韓老六的態度由油滑輕浮變為老實認罪，更符合鬥爭會上嚴肅莊重的氣氛。
第一部中韓愛貞勾引楊老疙瘩的情節，刪去了一些具有挑逗意味的細節，如韓穿著水紅小褂，胸脯突出，頭發鬆散，楊見了之後“神魂動蕩，手腳飄飄”等。這樣，韓的極具異性吸引力的身體敘述被簡化，對楊的心理衝擊力也減少了。下文中因楊老疙瘩慌裏慌張不慎摔壞了扇子，韓哈哈大笑起來。1956年版本中有對此的議論：“民歌裏說：‘多少私情笑裏來。’破鞋勁的女人本能地領會這一點。這女人用笑聲，用她胖手背上的梅花坑，用她從日本人森田那裏練習得來的本領，來勾引老楊。”（1956年版本，163頁）敘述者出於強烈的道德感十分鄙夷韓的無恥行為，不屑之意溢於言表，這在一定程度上損害了文本冷靜客觀的敘述，而且也隱含男性作者意識深處“紅顏禍水”的菲勒斯中心文化想象，女性隻是一具誘惑異性的軀殼。1977年版本中，這段話被刪掉。而楊老疙瘩的“心魂飄蕩”以及聽到韓的嬌笑後“這下越發撩起了他心頭的火焰”，這些人物內心的心理變化雖生動形象，但這樣的細節與全書嚴肅的革命曆史主題構成了潛在的衝突，作者在1977年版本中進行了刪改。
第二部中刪去的主要是張富英和小糜子偷情的情節、劉桂蘭被公公欺負的細節。經過大幅度的改動，作品中關於性的內容基本已經刪幹淨了，盡管在農村“性的方麵也比較的有自由，農村中三角及多角關係，在貧農階級幾乎是普遍的”。這些普遍存在的事實不適於在作品中呈現，因為革命曆史小說要擔負起傳承革命精神、教育後來者的重大責任。較多的情愛描寫固然容易引起讀者的閱讀趣味，但也會將讀者的注意力由激烈的階級鬥爭加以轉移，違背作者的本意。
除此之外，隨著時代的變遷，政治層麵上的敘述也需要進行必要的修改。較為明顯的是對於林彪、蘇聯敘述的改動，林彪由革命的功臣成為了反黨分子，其在解放戰爭中的功績不宜再提起。第一節，蕭隊長在路上“想起了林彪同誌在哈爾濱南崗鐵道俱樂部裏的講話”（1956年版，10頁）改為“想起了鬆江省委的傳達報告”（1977年版，9頁），“林彪將軍率領的民主聯軍，遵照毛主席的戰略，把蔣匪的美械軍隊打得大敗了”（1956年版，153頁）改為“人民軍隊遵照毛主席的戰略，把蔣匪的美械軍隊打得大敗了”（1977年版，144頁），“咱們林司令員帶的兵，在前方打了大勝仗”（1956年版，491頁）改為“毛主席的軍隊在前方打了大勝仗”（1977年版，447頁），在婚禮現場“現在貼著毛主席、朱德司令和林司令員的放大的照片”（1956年版，511頁）改為“現在貼著毛主席和朱總司令的肖像”（1977年版，464頁）。
蘇聯從早期的親密無間的老大哥成了敵對關係，有關蘇聯的敘述也進行了修改。送給趙玉林衣裳的由蘇聯紅軍戰士改成了八路軍。“光複那年，蘇聯紅軍駐紮在他們屯子裏，聽說這情形，送了兩套軍裝給他們”（1956年版，30頁）改為“八路軍三五九旅三營，來這屯子打胡子，聽說這情形，送了兩套灰軍裝給他們”（1977年版，28頁），“不是八一五蘇聯紅軍的大炮聲，咱們都進了冰窟窿了”（1956年版，52頁）改為“不是三營來，咱們都進了冰窟窿了”（1977年版，48頁），“往後就用拖拉機，跟咱們老大哥蘇聯一樣（1956年版，539頁）”改為“往後就用拖拉機”（1977年版，489頁）。還對一些名詞進行了改動，東北民主聯軍是東北人民解放軍的前身，在1977年版中，對這一舊有的稱呼進行了調整。另外，對紀年方式也進行了修改，將原來的中華民國紀年改為公元紀年。