但是，也必須看到，製播分離改革是廣電核心業務領域的改革，涉及頻率頻道的使用管理、內部機構人員的調整、製播雙方的規則、版權保護和市場規範等一係列問題，具有相當的難度。在探索改革的過程中，個別地方也出現過某種失控和違規問題。2010年，廣電總局針對這一問題在指導口徑上收緊了製播分離的範圍，但未正式發文予以限製。製播分離改革總是在曲折中前行。這就需要及時總結經驗，隨時糾正偏差，堅持改革的正確方向，堅持從實際出發，因地製宜，循序漸進，積極而又穩妥地把製播分離改革推向前進。
二、廣播電視媒體整合
媒體整合是這一時期廣播電視傳媒改革的重要內容。媒體整合，包括廣播電台與電視台的整合，傳統廣播電視媒體與新媒體的融合。在文化體製改革從試點向全麵展開的新形勢下，根據中央有關文件和中央領導的批示精神，廣電總局把推進媒體整合作為廣播影視體製改革的重要內容，鼓勵和支持主流廣電媒體開辦新媒體。這種媒體整合，有利於消解廣播與電視之間的壁壘，充分利用和優化傳統廣電媒體的資源優勢，建立新型的內部運行機製；有利於加快傳統廣電媒體與新媒體的融合和建立聯動傳播新機製，構建現代多媒體傳播新體係，鞏固和壯大黨的輿論文化陣地。
2000年至2001年期間，廣電總局根據中央領導指示，統一部署實施全國各級有線電視台與無線電視台實行合並，整合有線、無線電視資源，拓展電視發展空間。到了2009年，省級廣播電台與電視台的整合開始啟動。截至2011年年底，全國已有上海、遼寧、北京、四川、湖南、天津、安徽等15個省、自治區、直轄市實行本級廣播電台與電視台的整合，組建起省級廣播電視台；已有廣州、武漢、成都、蘭州、濟南、沈陽等15個省會城市和計劃單列市實行廣播電台與電視台的整合，組建起本市廣播電視台；已有溫州、綿陽、東莞、六安、濰坊等234個地級市實行廣播電台與電視台的整合，組建起地級市廣播電視台；縣（市）級已全部實現兩台合並，共有縣級廣播電視台1985座。已經實現廣播與電視整合的廣播電視媒體，如上海、湖南、四川、遼寧、北京、天津、安徽等省級廣播電視台，同時將可經營性資產剝離出來組建經營性的傳媒公司，依托廣播電視媒體資源和品牌，發展廣播電視產業。組建於2009年12月的遼寧廣播電視台，將遼寧人民廣播電台、遼寧電視台、遼寧教育電視台合並，組建遼寧廣播電視台，實行統一呼號、統一新台標、統一機構建製、統一頻率頻道資源、統一服務管理、統一產業經營和統一規劃投資的新體製。上述兩台或三台合並，業界學界尚有不同看法，成效如何也有待實踐檢驗。
在傳統廣電媒體開辦新媒體方麵，中央人民廣播電台、中國國際廣播電台、中央電視台都走在前列，相繼開辦了網絡廣播電視、手機廣播電視等新媒體新業務，中國廣播網、國際在線影響日益擴大，在央視網基礎上擴建的中國網絡電視台開辦了多種新媒體業務，成為影響力頗大的視頻傳播新媒體。由此，三大國家級廣電媒體均已初步構建起傳統廣電媒體與新媒體融合發展的多媒體現代傳播新格局。地方廣電媒體也積極開辦新媒體，探索走融合發展的新路子。截至2010年年底，全國廣電係統已有中央三台和安徽廣播電視台、黑龍江電視台、遼寧廣播電視台、江蘇廣播電視總台、湖北廣播電視總台、深圳廣電集團等廣電媒體，開辦了10家網絡廣播電視台或網絡電視台。各級廣播電台、電視台共開辦了63個互聯網視聽節目服務網站。全國具有傳播網絡視聽節目資質的網站已達521家。