後來不久，洪福調在江西為清將席寶田抓獲，曾國藩也不能再說什麼了。但是從此曾左失和，二人幾乎斷絕往來。清人筆記都認為“洪福調事件”就是曾左失和的起因。
這次“失和”有許多可疑的地方。左宗棠和曾國藩在皇上麵前互相攻訐是很不合常理的。這不符合他們素以道德文章名重天下的大臣身份，也不符合他們一向情意孚洽、彼此提攜的交往曆史。再者，錯報一次軍情也不是大不了的事，曾國藩隻須上奏檢討一下，說是誤聽下屬報告，以他攻克南京之功，清廷決不會計較，何必如此大動肝火，還將克複杭州的情況硬扯上去。他明明知道杭州與金陵情況不同，杭州城並未被全部包圍，汪海洋等逃出，左宗棠也已據實上報。金陵明明錯報了軍情。曾國藩的水平無論如何是能見到這些的。他卻劍拔弩張，聲勢洶洶。左宗棠辯白幾句，也是理所當然，但何必又牽扯過去“不和”和事例？他二人豈非有意造成不和的氣氛，讓朝廷知道，二人成見由來已久，湘軍內部並不團結嗎？”
他們的作法也很可疑，每次上奏，必同時將奏折底稿互相抄送。20年後曾國藩去世，左宗棠這才說出真相，與孝威信說：“從前彼此爭論，每拜疏後，即錄稿谘送，可謂？去陵穀，絕無城府。”表麵上爭論如此激烈，但背後立即將攻訐內容抄送對方，使對方作好準備。大臣之間這種作法，誠屬少見。而且，既然彼此爭論絕無成見，何以事後又斷絕來往呢？
還有一些可疑之處：金陵是曾國荃攻陷的，謊報軍情一案曾國荃首當其衝。但是，左宗棠為此和曾國藩“失和”，和曾國荃卻一直友好，而且還相互幫助。光緒十年（1884年）左宗棠任兩江總督時，因病告退。奏薦曾國荃代理，兩個月後曾國荃受代。正當那時，為左宗棠西征籌款有功的胡光墉出了事，他所經營的錢鋪多處倒閉，京師王公大臣多有銀款存在胡光墉鋪內，慫恿朝廷下諭責成兩江總督查辦，並懷疑左宗棠與胡有私。曾國荃複奏詳細說明西征借款的必要，對左宗棠維護備至，胡案因此未牽涉左宗棠。對曾左失和這樣大事，當事人曾國荃卻似乎與他無幹。後來曾國荃和左宗棠還結了姻親。
從曾國藩和左宗棠的私交看，也不至於為幼主洪福調一案而絕交的。二人論交很早，曾國藩一直器重左宗棠，曾多次邀他出山和奏薦他。左宗棠也敬重曾國藩“為人正派，肯任事”。有時為公事也爭執，曾國藩比較虛心，常接受左宗棠的意見。他曾寫信給左宗棠，說他和胡林翼“當危迫之際，每每有不自持之說，獨閣下向無此失。……故知賢於弟遠矣。”可以看出曾國藩衷心佩服左宗棠，認為“遠勝”於他，也勝過胡林翼。“失和”若幹年後，曾國藩在兩江總督任內，聽到甘肅來人談及左宗棠經營西陲情況，還讚歎說：“此時西陲之任，倘左君一旦舍去，無論我不能為之繼，即使胡文忠於九泉，恐亦不能為之繼也。君謂朝端無兩，我以為天下第一耳。”曾國藩每談到左宗棠，就會想到胡林翼，可見三人交誼之真摯，曾、左、胡聯盟的影子躍躍可現。
曾國藩去世後，左宗棠對曾國藩親屬關照備至。曾國藩第三子紀鴻（栗誠）在京師貧病交加而卒，左宗棠送給生前醫藥費和死後殯殮衣棺、還喪鄉裏的費用。在兩江總督任內，又將潦倒在江寧候補的曾國藩女婿聶緝，保薦到上海製造局任會辦。他致函總辦李興銳，談及他和曾國藩的交情時說：“弟與文正論交最早，彼此推誠相與，天下所共知，晚歲凶終隙末，亦天下所共見。然文正逝後，待文正之子若弟，及其親友，無異文正之存也。”這樣的生死交情，怎能為一點區區小事失和？
最後，還有一個重要疑點：胡林翼委托左宗棠保全曾國藩，又叮囑曾國藩要絕對信任左宗棠。照理，他們二人應當互相信任，彼此幫助，一心一德，共度危難。這不單是實現胡林翼生前囑托的一件小事，而是關係到保全他們自身以及湘軍領袖的大事。何以他們不僅不親密團結，反而吵鬧起來，弄得天下皆知。這豈不是既不利於自己，也有負於亡友嗎？
隻有一個答案：他們的“失和”，隻是一個假象，正是為了實現亡友的遺願，也是保全自己的策略。 “曾左失和”後，社會上議論紛紛，有人認為左宗棠是曾國藩所薦，左宗棠不應該和曾國藩爭吵。更多的人則“右左而左曾”，認為多半是左宗棠對。因為左既是曾薦，“乃致中道乖違，疑曾公或有使之不堪者。”還有的說：“左公不感私恩，專尚公議，疑其卓卓能自樹立，而群相推重焉。”（薛福成《庸庵筆記》薛福成自己則站在曾一邊，認為左“不應背恩”。左宗棠對這些言論不屑一顧，與孝威信說：“我與侯所爭者國事兵略，非爭權趨勢比，同時纖儒妄生揣擬之詞，何值一哂焉！”
他們並非爭權趨勢，這是無可置疑的。但是對洪福調下落有分歧，還談不上是為國事兵略之爭。這是左宗棠的掩飾之詞。當時他還不能將真相完全暴露出來。但是在挽曾國藩的聯語中，也流露出了一些事情。聯雲：
謀國之忠，知人之明，自愧不如元輔；
同心若金，攻錯若石，相期無負平生！）
上聯推崇曾國藩，一筆勾銷了所謂“不和”。左宗棠告知孝威信說：“謀國之忠，知人之明。”這兩句話，早在曾國藩生前，他就在奏章中以此讚揚曾國藩，並非始毀今譽。上聯也透露出曾國藩比他更忠於清王朝。下聯說，二人是同心同德，堅若磐石，終身如此。他們互相攻錯則有之，至於互相攻訐，不過是有意製造的假象而已。
如果對“曾左失和”的前因後果，細心考查一番，就能發現若幹破綻，前人已有所懷疑。如徐一士雲：“益見宗棠之於國藩誠有異乎尋常之凶終隙末者矣。”亡兄左景清曾為文論述“失和內幕”，與保全湘軍有關。清廷看到湘軍二位主帥內訌，認為湘軍的威脅不足重視了，因此湘軍和將領們得以保全。這就是胡林翼生前委托左宗棠最後一道策劃的實現。
曆史結局確實如此，太平軍平定後，曾國藩立即交出兵權，慈禧對湘軍也不再猜忌，認為漢人無足畏了。當時強鄰壓境，西陲有事，還需要利用左宗棠和湘軍。兩年後左宗棠率兵西征，不久收複了淪陷於英俄走狗阿古柏之手13年的新疆，恢複了祖國六分之一的土地。足見曾、左、胡的謀劃是成功的，保全了力量，也卒成“大功”。這和湘軍打天下、做皇帝來比，其意義是不可同日而語的。