因此，女王對埃塞克斯更加信任，埃塞克斯成為大權在握的重臣，地位顯赫，還進了樞密院。這對博萊政治集團來說，則是一個沉重的打擊。
1593年，埃塞克斯憑借伊麗莎白女王對自己的寵愛和自己的社會地位，曾多次對女王說：“我發現您平時特別喜歡讀一些小說作為消遣。”
女王說：“不錯，我尤其愛讀優秀的拉丁文古典名著。”
埃塞克斯說：“自己讀太費眼力，如果找一個人來給您念，再加以分析不是更好嗎？”
女王說：“這個辦法不錯，不過有這樣合適的人嗎？”
埃塞克斯說：“人倒有一個，您也認識，就是頗具才華的培根，他對拉丁文名著非常有研究。”女王聽後，總是一笑，不予答複。
1594年，總檢察長職位空缺。埃塞克斯便在女王麵前極力推薦培根出任。
女王笑笑，斷然拒絕說：“培根太年輕，擔任這麼重要的職位恐怕不合適吧！”
埃塞克斯認為女王的理由太荒唐，便說：“我17歲入宮做官，20歲就在宮廷內擔任要職。32歲的培根出任總檢察長不算年輕了。”
女王麵帶慍色，她伸手從身邊的公案上拿起一份奏折來看，不再理會埃塞克斯。
但是，埃塞克斯並不死心，他繼續為培根奔波。許多人勸他不要白費勁，他不但不聽，反而發脾氣說：“我利用我的權力、能力、勢力和朋友關係，一定要讓弗朗西斯·培根得到這個職位。我一定要達到這個目的！我拚命也要幫他爭取到這個職位，誰要想從我手中為另外一個人奪走這個職位，那麼，還不等他弄到手，我就要他付出代價！”
正當埃塞克斯為培根出任總檢察長四處遊說之時，女王下令：“此事緩議。”
這是伊麗莎白女王處理棘手問題的慣用手法。當埃塞克斯厚著臉皮又向女王提及此事時，女王板著麵孔，對他說：“你回家休息去吧！”便把埃塞克斯攆出了皇宮。
培根在知道此事後，不禁長歎了一聲，說：“世界上還沒有一個人受到過這樣微妙的恥辱！”
從1595年培根寫給埃塞克斯伯爵的信中可以看出，一開始培根對在政府裏取得一個職位，並不十分熱心。他經常掛在嘴邊的一句話是，他在國家事務上，“更適合拿本書，而不是親身參與”。
埃塞克斯直接請求女王時，所選的時機欠佳。因為培根剛在國會辯論給王室提供特殊津貼時，給了女王一個下馬威。為了懲罰培根，女王拒絕見他。而沒有覲見女王的人，在所有國務事情上都沒有位置，他的事情就因此被擱置了下來，隻好等埃塞克斯伯爵再次幫他請求。由於請求頻繁，致使女王厭倦，女王命令埃塞克斯“談別的問題”。
女王雖然寵愛埃塞克斯，但曆來都極其小心地避免寵臣在政治上利用她的感情。而在國家事務上，女王對博萊更為信任，而博萊是不願培根晉升的。
伊麗莎白女王在國家大事方麵看得很遠，如果把重臣的追隨者都放在宮中，將會給王權造成極大的威脅，久而久之自己便會淪為傀儡。
在無可奈何之下，埃塞克斯為緩和培根求職不成的沮喪，1595年，埃塞克斯把他的一處價值1800鎊的蒂凱漢莊園贈與培根。
埃塞克斯在給培根的信中說：
你倒黴地選擇了我作為你的依靠。在我的事情上，你已花費了許多時間和精力。我希望你不會拒絕接受贈給你的這一塊土地。
此時兩人感情甚篤，伯爵的各種交際遊樂，培根也常常被邀請參加，並且寫過一本宮廷劇本作為宴樂之助。培根對於這種文藝表現出特殊的才能。後來，他又為葛萊公會寫過兩部戲，即《學問之宮》與《葛萊曆史》。
1595年，安東尼·培根搬進埃塞克斯大院與伯爵一起住。在歐洲時，安東尼一直很活躍地秘密收集情報。如果讓他當埃塞克斯伯爵的外交秘書，那是非常適合的。
此時，原來的萊斯特大院已改名為埃塞克斯大院了，進進出出的都是間諜、特務、詩人、劇作家、朝臣和貴族，以及伯爵的親戚朋友。這裏簡直就是一個小型的王室。於是，在國務大臣塞西爾的眼中，它成了一種威脅。於是，他很快就到女王那裏去報信了。
埃塞克斯伯爵對女王有影響力，而且他在公眾中也受到了歡迎。他隻要騎馬在街上走過，就會受到民眾的熱情歡呼。他一路走過，人們紛紛脫帽致意。他也風度翩翩地摘下自己的帽子回應人們的熱情，並謙卑地彎腰致意。
對此情形，培根關心地提醒埃塞克斯伯爵說，要謹言慎行，不可太過張揚，因為女王不喜歡有太多的競爭者。但是埃塞克斯卻依然故我，根本沒有意識到危險已經產生了。
埃塞克斯伯爵再次求見女王，隨後寫信給弗朗西斯，說她的態度非常保守。無論埃塞克斯如何替培根說話，女王就是不予恩準。
沒過多久，經過慎重考慮，伊麗莎白將總檢察長的位置給了國務大臣塞西爾提出的人選愛德華·庫克。庫克的年齡比培根還要小9歲。此時，塞西爾已經成為培根的政治敵手，在以後的日子裏他更是變本加厲。
埃塞克斯伯爵並不甘心就此失敗，他繼而為培根請求副檢察長的職位。經過兩年半的努力，副檢察長的職位還是落到了別人的頭上。
埃塞克斯對培根的請求總是有求必應。當埃塞克斯第二次率艦隊遠征西班牙途中之時，他接到培根的求助信稱：案卷司司長職位空缺。埃塞克斯立即給掌管司法的三位大臣寫信，力薦培根，但是最終還是毫無結果。
在埃塞克斯伯爵看來，這是女王對他的不留情麵。他們退而求其次，開始爭取大律師的職位。但女王已經開始很不耐煩了，她幹脆拒絕了這個要求。
這使培根簡直不能承受。他寫信給埃塞克斯伯爵說：“我不得不做出結論，沒有任何人受到過如此不公的待遇。我的本質不可能充滿惡意，但在上帝的幫助下，我將帶上這份不公待遇，也帶上太多光明正大的人以及值得我交往的人對鄙人的美好印象，和其他幾個朋友一起遠離政壇，隱入劍橋大學，做一輩子研究工作，深刻思考人生，永遠不再回來。”
在收下埃塞克斯贈給自己的豪華莊園之後，培根想，明智的婚姻可以給他提供良好的機會，使他的失意得到補償。
在培根的計劃中，最缺的就是金錢上的支持。此時如能娶一位富家大小姐，也是一個不錯的選擇。想到結婚，培根心裏感覺好了一些。因為他已經不年輕了，有個妻子陪伴，也不失為一件好事。他也曾說過，自己連個說話的人都沒有。
培根從十幾歲愛上法國公主，到決定徹底忘掉她，至今已過去許多年了。培根忘掉她的結果，就是把她的畫像“掛到了記憶的牆上……”
此時，培根看上了威廉·海頓爵士的年輕遺孀貝蒂·塞西爾。從孩提時起，貝蒂就是培根的好朋友。她是威廉·塞西爾第一次婚姻所生兒子托馬斯·塞西爾的女兒。
國務大臣一心想讓自己的子孫通過聯姻的方式，取得地位與財富，不惜給貝蒂選了一個老頭當丈夫。這老頭就是威廉·海頓爵士——終身未娶的王朝要臣斯多夫·海頓爵士的侄子和繼承人。
貝蒂·塞西爾從小就是個迷人的小精靈，長大後更加嫵媚動人。培根16歲時，她才來到這個世界。但這個美麗動人的小妹妹，很早就在培根的心中留下了極好的印象。
培根與貝蒂一直保持著友誼，包括貝蒂結婚後的幾年，友誼也不曾中斷。她在20歲時成了寡婦。在培根眼中，她最適合做自己的妻子了。她不僅聰明、機智，還很漂亮，而且非常活潑。最重要的是，她現在相當富有。
當時，年輕婦女守寡，要一直等到摘掉悼夫頭紗之後很長時間，才能談婚論嫁。貝蒂的身邊不乏追求者，她那幢氣派的海頓大院裏，有好幾個豪華的大花園，離培根所在的葛萊學校隻有幾分鍾的路程。
帶著極大的期望，有一天，培根去拜訪她，作為老朋友出現在她的麵前。但最終，貝蒂拒絕了培根的求婚，而嫁給了愛德華·庫克爵士。愛德華·庫克是一位律師，他被女王任命為檢察長。培根自嘲地聳了聳肩，他怎麼也弄不明白這位貴婦人怎麼會選擇一個大家都不喜歡的老紳士。
貝蒂對這次婚姻顯然並不滿意。她拒絕公開向外界宣布此消息，並堅持秘密舉行婚禮。她隻讓自己的父親和一個見證者參加了婚禮儀式。婚禮是在晚上舉行的。貝蒂宣稱，自己絕對不取庫克的姓氏，而保持原來海頓夫人的稱呼。
其中的緣由是，羅伯特·塞西爾此時最得女王的寵愛，他一直信誓旦旦地要與培根作對。如果培根娶了貝蒂·塞西爾，那麼，他就等於進了塞西爾家族的大門，這無疑會給羅伯特·塞西爾以很大的打擊。羅伯特·塞西爾根本不可能讓培根有任何機會得到侄女的財產。
如此一來，培根再次被塞西爾家族擊敗。為了發泄心中的苦悶，培根還寫了一篇論非正義的文章。他故態複萌，縱欲揮霍，結果在1598年因負債問題被關進了監獄。後來又是埃塞克斯來解救他。
生活和仕途上的種種不順利，並沒有使培根停止在哲理方麵的追求。他要把人類的精神從亞裏士多德式的經院哲學的桎梏中解放出來。