商王朝建立後，伊尹和鍾虺繼續為右相和左相，一直陪伴成湯，治理商國。伊尹又總結海內邦國存亡教訓，製定出君臣關係準則。商湯去世後，他又先後輔佐商湯的兒子外丙、中壬兩王治國。中壬去世後，伊尹以開國元老身份立商湯的孫子太甲繼承王位。
太甲生性好玩，不諳世事。伊尹便將他留在身邊，整日以古為訓，給他講堯舜禹怎樣治國、夏桀為何亡國、商湯的興國之道以及國家的法度。開始太甲還可以硬著頭皮聽下去，漸漸心生厭煩情緒，對伊尹的話隻當耳旁風。伊尹憂心忡忡，常常麵對商湯的遺像暗暗自責。
幾年過去了，太甲依然我行我素，對國事置之不理。
轉眼商湯的祭日就要到了，又該為先王祭禮了，但目前這種局麵，伊尹感到實在愧對先王。一連幾天伊尹夜不安枕、食不甘味，他不忍心看著太甲繼續荒廢政事。終於，在熬過一個不眠之夜後，他下定決心要真正給太甲上一課。
祭祀的日子到了，太甲極不情願地隨著隊伍來到桐宮。對於祭禮這種枯燥的活動他早已厭倦了，千篇一律的祭辭，千人一麵的表情，若不是先王的祭祀和伊尹再三的叮囑，他一定會找個理由推托的。
伊尹看上去衰老多了，他對先王行了大禮，接過主祭人手中的祭辭，恭恭敬敬地誦讀。太甲根本沒有將祭祀放在心上，他不時地東張西望，盼祭奠儀式快些結束。此時他漸漸覺出有些不對勁，不但氣氛較從前莊嚴肅穆很多，伊尹的祭辭也似乎有所改變。他仔細聽下去，漸漸頭上冒出了冷汗。隻聽伊尹沉聲訴道：“……由於老夫能力所限，對幼主教導不善，如今萬般無奈，隻得將幼主留在桐宮……”原來，伊尹要借給先王祭祀的機會，將太甲囚禁在桐宮。
伊尹要起程了，被鎖在桐宮的太甲對著伊尹的背影哭喊著，須發皆白的伊尹硬著心腸頭也不回地乘車返回王宮。
太甲度日如年般地在桐宮過了三天，三天來，除了一日三餐與睡眠外再也無事可做，他望著窗外的一切，想著自己何時才能重獲自由。忽然，門開了，伊尹走進來，太甲猶如見到了希望，他多想再過從前那種快樂的日子呀。誰知伊尹根本沒有放他走的意思，告訴他從現在起每天不得貪睡，必須從早到晚學習誦讀曆代賢王的遺訓和勤政的事跡，還要常思己過，考慮今後該如何去做。從此太甲過起了苦讀的日子。
伊尹囚禁了太甲之後，代行王政，每日要處理大量事務。由於他是開國元老，又有極高的威望，眾臣對他的命令言聽計從。但是伊尹並沒有借機篡權，他隻是盡力地完善法製、懲奸除惡、賞功獎賢。在此之餘，他每隔一段時間去桐宮檢查太甲有何進展。太甲在誦讀先王功德時，越來越發現自己無才無德，開始後悔從前的所做所為。
時間在一天天的流逝，轉眼三年過去了。這一天，伊尹又來到桐宮，太甲忙起身迎接。伊尹沒有像往日那樣詢問他有何進步，而是恭恭敬敬跪在先王靈前拜了三拜。然後站起身對太甲說：“微臣鬥膽囚禁大王是不得已而為之，如今微臣前來迎接大王回宮。”太甲這才發現門外停著自己裝扮得非常華麗的車子。驀地，他淚如泉湧，猛地跪在伊尹麵前，一句話也說不出來。
太甲穿上王袍、戴上王冠，端坐在王位上。老態龍鍾的伊尹和眾臣一起叩拜太甲。太甲望著德高望重的伊尹，想著從前自己所做的一切，不禁羞愧難當。太甲複位後，猶如換了一個人，他不再沉迷於酒色，在伊尹的輔佐下，勤於政務，將國家治理得安定富足。
30年後太甲死了，伊尹又扶助他的兒子沃丁繼位。不久，操勞一生、勞苦功高、一百餘歲的忠臣伊尹停止了呼吸。消息傳開，全國上下一片哭聲，各地都舉行不同的儀式祭奠這位忠正的老人。沃丁也以天子之禮為他舉行了隆重的葬禮，伊尹以後也受到曆代帝王的隆重祭祀，殷墟甲骨文中便有祭祀伊尹的卜辭。
千百年來，伊尹的賢德一代代地流傳著，至今他的墓地和祠堂還保留著，不時有人前去燒香祭拜。伊尹的事跡被人民傳為佳話。盤庚遷都
自商湯在亳(今河南商丘)建立奴隸製商王朝之後的長時期中，商朝的國都處於不斷的遷徙之中。商朝第10個王仲丁將國都遷隞(今河南滎陽附近)，第十四個王祖乙又遷都於庇，第十八個王南庚再將國都遷於奄(今山東曲阜)。在此期間，商王朝統治集團內部內亂頻繁，多次發生爭奪王位的激烈鬥爭。
每當一位國王去世，王室貴族們便圍繞王位繼承人選展開激烈的角逐，他們從各自的利益出發，或主張兄終弟及，或要求父死子繼。為達到控製國家最高權力的目的，叔侄反目成仇，兄弟同室操戈，分別拉攏擁護自己的貴族展開你死我活的大廝殺，國家陷於混亂和血腥之中，國力也迅速衰退。
奴隸主階級也日益腐化墮落。在當時，迷信鬼神，飲酒作樂為奴隸主生活的主要內容。奴隸主頻繁地舉行各種各樣的祭祀活動，甚至大規模地使用人祭。人祭的手段十分殘忍，包括砍頭、肢解、焚燒等等。被殺者多為俘虜、奴隸、此外還包括少量仆人和妾。人祭的數量龐大，少則數人，最多一次可高達500人，其狀令人慘不忍睹。
統治階級的腐朽奢侈的生活加重了人民的負擔，激化了階級矛盾，導致奴隸的大批逃亡和反抗。
正當商王朝內憂外困之時，商朝第十八個王陽甲去世了，陽甲的弟弟盤庚被擁立為王。盤庚是商湯的第九代孫，他睿智聰慧，頗有心計，較善於分析觀察形勢。他即位後，開始設法緩和階級矛盾，去除奢侈惡習、提倡簡樸，以圖挽救商朝的衰亡。
盤庚經過多方籌劃，感到隻有遷都才是解決各種矛盾的最佳途徑，於是他決定將國都從奄遷至殷(今河南安陽小屯村附近)。盤庚認為將國都遷往荒涼的殷有許多好處：首先可以避開奄地區頻繁發生的水旱災害，有利於農牧業生產。其次，殷地區尚未開發，在那裏建都，一切須從頭做起，奴隸主們無法過分享受，有利於去除反叛勢力，有利於都城的安全和穩定。
遷都的決定公布之後，人們一片大嘩，反對者主要是奴隸主貴族，他們留戀奄的奢侈生活，紛紛反對遷都的決定。有的貴族甚至威脅盤庚說：“你是我們擁立的，我們也可以罷黜你。”盤庚是個強有力的統治者，他決不因有人反對而改變自己的決定，他撰寫了《盤庚》兩篇告誡奴隸主們要和他同心同德。同時，盤庚也以強硬口氣警告那些煽動鬧事的奴隸主，要老老實實地服從命令，否則將予以嚴懲。
在盤庚的脅迫下，奴隸主貴族被迫服從盤庚的命令，隨同盤庚遷都到了殷。初到殷時，地方荒涼，雜草從生，生活艱難，大家都不習慣。於是，一些奴隸主貴族便趁機發難，鼓動大家遷回老家去。盤庚又召集奴隸主會議，宣讀了《盤庚》第三篇告誡，以更加強硬的語氣再次警告那些奴隸主，又一次將奴隸主們的反對壓製了下去。經過數年的反複鬥爭，隨著新國都的逐漸興建，局麵才最終穩定下來。
盤庚遷殷之後，強行推行商湯時確立的德政，加強統治，政治上出現了較為穩定的局麵，社會經濟和文化也獲得了較大的發展。
盤庚十分重視農業生產，除本人親自視察農田作業外，還經常命令大臣和奴隸主們監督農耕。當時的農作物禾、黍、稻、麥等已被廣泛載培，耕田時采用合力耕種以及火耕，並已使用糞肥肥田。農業的發展使農產品有了較多的剩餘，商王命令將收割後的糧食放入倉庫中貯存以備災年。
農作物的再生產品主要是酒類，當時上至王公大臣、下至平民百姓，嗜酒風氣盛行。釀酒業的迅速發展，也反映了當時農業的發達程度。
園藝和蠶桑業在盤庚遷殷後也有了較大的發展。殷地處黃河中下遊地區，氣候溫和，雨量豐沛，並有廣大的桑樹種植。奴隸們采集桑葉，飼養家蠶，抽出蠶絲，使用陶製紡輪織成精美的絲、帛，供奴隸主貴族們穿戴。
盤庚遷殷之後，青銅器的製造也步入了一個光輝燦爛的時代。當時青銅作坊規模之大，冶煉青銅技術之高超，產品製作之精美，種類之複雜繁多，製造水平之純熟，都令人驚歎。
盤庚遷殷之後，驅使成千上萬的奴隸日夜趕修新國都，不久，一座規模宏大，占地廣闊的都城便拔地而起。新國都中王宮部分為城市的核心，它擁有五十多座宮殿。都城外圍由人工挖成的壕溝，形成一條保護都城的水域屏障。在都城周圍是居住區和手工作坊，供平民和工匠們生活和勞作。在盤庚的嚴厲督促和廣大工奴隸平民的艱辛努力之下，殷迅速建成一座十分繁榮的都市。
在至今仍舊保留下來的殷墟遺址中，還發現有大量刻於龜甲獸骨上的文字，被稱為“甲骨文”，又被稱為契文、卜辭、龜甲文字或殷墟文字。甲骨文是商代國王利用龜甲、獸骨進行占卜的記事文字，迄今已發現約15萬片。其內容以占卜為主，但也反映了自庚盤遷殷之後至商朝末年間的祭祀、征伐、田獵、農業、畜牧、地理等社會各方麵的情況。甲骨卜辭一般很簡短，從一二字到數十字不等。甲骨文單字約有5000左右，其中可識的約1500字左右，是我國已發現的古代文字中時代最早、體係較為完備的文字。
盤庚遷殷，使得社會矛盾趨於緩和，社會經濟獲得了較大發展，使得商王朝一度複興，在此後的273年間，商朝再不遷徙國都，商人在盤庚奠定的基礎上不斷發展，創造了燦爛輝煌的古代文明，商成為當時世界的文明大國。